Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 2,757,445 | Δ1 bp | 1.6% | intergenic (+322/‑247) | RCAP_rcc02566 → / → RCAP_rcc02567 | reverse transcriptase catalytic domain‑containing protein/resolvase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 2,757,445 | 0 | C→. | 1.6% | 6.6 ‑0.4 ‑0.4 | 313 | intergenic (+322/‑247) | RCAP_rcc02566/RCAP_rcc02567 | reverse transcriptase catalytic domain‑containing protein/resolvase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/3): ref base (163/144): total (166/147) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.69e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.82e-01 |
Only 100 of 380 total aligned reads displayed.
GGCCGCCCGCACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACCTCTCC > NC_014034/2757345‑2757544
|
ggCCGCCCGCACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.c > 2:4731607/1‑101 (MQ=255)
gccgccCGCACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.cc < 2:1720202/101‑1 (MQ=255)
cgcccgcACGGCAAGCCCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.cccc < 2:8638835/101‑1 (MQ=255)
cccgcACGGCAAGCCCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAACAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.cccccc < 2:6260238/101‑1 (MQ=255)
cccgcACGGCAAGCCCCAGCCGCAAAAGCGATAAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.cccccc < 1:4378725/101‑1 (MQ=255)
ccgcGCGGCAAGCCCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.ccccccc < 2:4051275/101‑1 (MQ=255)
ccgcACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.ccccccc < 2:3045057/101‑1 (MQ=255)
gcccGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.ccccccccc < 1:3644225/98‑1 (MQ=255)
gcACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.ccccccccc < 1:1741694/101‑1 (MQ=255)
cACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCg < 1:9033017/101‑1 (MQ=255)
cGGCAAGCGCCAGCCGCAAAGGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGt > 1:8217553/1‑101 (MQ=255)
cGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCggg > 2:4119940/1‑100 (MQ=255)
cGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGt > 2:9126162/1‑101 (MQ=255)
cGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGAGCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGt < 2:5082455/101‑1 (MQ=255)
ggCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTg > 1:718182/1‑101 (MQ=255)
gCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTgg < 2:6998563/101‑1 (MQ=255)
cccAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGccgccc < 2:3463445/100‑1 (MQ=255)
cccAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGccgccc < 2:1120158/100‑1 (MQ=255)
cccAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCAGATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGccgccc < 1:6401429/100‑1 (MQ=255)
ccAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGccgcccg < 1:6031960/101‑1 (MQ=255)
ccGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATTTTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCCCCCCCCCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.GCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCt < 2:2821695/101‑1 (MQ=255)
cGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTg < 1:8689828/101‑1 (MQ=255)
cAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTggg < 1:3740029/101‑1 (MQ=255)
aaaaGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGACGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGGGGCCGGCCCCCCTGGGc > 2:2937121/1‑101 (MQ=255)
aaaGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGcc > 1:3940727/1‑101 (MQ=255)
gCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCCGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGt < 2:4449616/101‑1 (MQ=255)
cGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCgct > 2:5890366/1‑99 (MQ=255)
cGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGtt < 2:5393405/101‑1 (MQ=255)
cGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGtt > 1:1114457/1‑101 (MQ=255)
cGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGtt < 1:4729265/101‑1 (MQ=255)
cGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCCGGGCCCGtc > 2:8327631/1‑100 (MQ=255)
gATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGGGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTc > 1:5161219/1‑101 (MQ=255)
aTCGGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAACCCGAGCCACCCCCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCa < 2:3569614/101‑1 (MQ=255)
aTCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCa > 1:3493891/1‑101 (MQ=255)
aTCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCa > 1:4626055/1‑101 (MQ=255)
tCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGCGGCCGCCCCCCCCGGGCACGTTCac > 2:197646/1‑100 (MQ=255)
tCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAACCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAg < 1:6816570/101‑1 (MQ=255)
cAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAgg > 1:4086787/1‑101 (MQ=255)
aGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAggc > 2:6919449/1‑100 (MQ=255)
gggCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTc > 1:5873310/1‑101 (MQ=255)
gCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCTCGTTCAGGTCGCCCa < 1:7643498/101‑1 (MQ=255)
gCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCa > 2:5302046/1‑101 (MQ=255)
gCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGGTCAGGTCGCCCa < 1:6612605/101‑1 (MQ=255)
gCATATTTGGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCa < 2:8012691/101‑1 (MQ=255)
atatTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCCGGTCGCCCAGc > 2:2313531/1‑101 (MQ=255)
atTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTcagatcggaa > 2:6115736/1‑92 (MQ=255)
atTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCAc < 1:6248023/101‑1 (MQ=255)
tttGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGc > 2:3199119/1‑101 (MQ=255)
tGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG..CCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTcc < 2:1563292/101‑1 (MQ=255)
gCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTccc > 2:3698335/1‑101 (MQ=255)
gCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTccc > 1:2398595/1‑101 (MQ=255)
gCGGAAAAACCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTccc < 1:5584017/101‑1 (MQ=255)
cGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCg < 2:8199026/101‑1 (MQ=255)
gAAAAACCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAg < 1:1187068/101‑1 (MQ=255)
aaaaaTCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAgg > 2:7328490/1‑101 (MQ=255)
aaaaTCCGAGCCACCCCCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGgc < 1:4502435/101‑1 (MQ=255)
aaaaTCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGgc > 1:8971577/1‑101 (MQ=255)
aaaTCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGgcc > 2:7664496/1‑101 (MQ=255)
aaaTCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGGTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCCAGgcc > 2:1860287/1‑101 (MQ=255)
accccGAGCCACCCCCTCGGCCGAAGTGCGGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGgccg < 1:7076868/98‑1 (MQ=255)
aTCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGgccgc > 2:5708890/1‑101 (MQ=255)
aTCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGgccgc < 2:2468250/101‑1 (MQ=255)
cGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGcccc > 1:2999809/1‑101 (MQ=255)
gacccaccaCCTCGACCGAAGTCCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCa < 2:4625920/98‑1 (MQ=255)
gAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCTCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCa < 2:3944533/101‑1 (MQ=255)
gAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCa < 2:4897772/101‑1 (MQ=255)
gAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCa > 1:730824/1‑101 (MQ=255)
aGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAg < 1:8430201/101‑1 (MQ=255)
aGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGACGCCGCCCCAg > 2:5999396/1‑101 (MQ=255)
aGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCCCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAg < 2:2066360/101‑1 (MQ=255)
accaccTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCGCCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGGCGCCCAGCACGCTCCCCTGGCCGCCCCCGggcc > 2:2547660/1‑101 (MQ=255)
ccaccTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGCGGCCGCCCCAGggccg > 2:8457138/1‑101 (MQ=255)
ccaccTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCCGcgccc > 2:1478280/1‑100 (MQ=255)
ccTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGccc > 1:3236579/1‑101 (MQ=255)
ccTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGccc > 1:2084244/1‑101 (MQ=255)
tCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCt < 1:738384/101‑1 (MQ=255)
gACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTcc < 1:1417078/101‑1 (MQ=255)
gACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTcc < 1:9143062/101‑1 (MQ=255)
cccGAAGGGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTccc < 1:2623032/100‑1 (MQ=255)
aCCGAAGTGCCGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTccc < 1:8327994/101‑1 (MQ=255)
cGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGc > 2:6705647/1‑101 (MQ=255)
gAAGTGCAGCCGCGCAGCCCCCCCCCCGGGGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGc > 1:2823923/1‑101 (MQ=255)
gAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGcc > 2:4182955/1‑101 (MQ=255)
gAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGcc > 1:5044314/1‑101 (MQ=255)
aaGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGccc > 1:4267846/1‑100 (MQ=255)
aGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCCCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCAc > 1:7970129/1‑101 (MQ=255)
gTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCAcc < 1:8039745/101‑1 (MQ=255)
tGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCAccc < 1:6115490/101‑1 (MQ=255)
gCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCAcccc < 1:4878282/101‑1 (MQ=255)
gCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGGCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGGCCCTCCCGCCAcccc > 2:6805748/1‑101 (MQ=255)
gCAGCCGCGCAC.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCAcccc < 2:9061258/101‑1 (MQ=255)
cggCCGCCCAC.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCg < 1:667691/99‑1 (MQ=255)
cAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCg < 2:7542479/101‑1 (MQ=255)
aGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCgg > 2:2673475/1‑101 (MQ=255)
gcgcgCAC.CCCCCCCCCGGCGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCa < 1:577889/100‑1 (MQ=255)
cgcgCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCAc < 2:5558487/101‑1 (MQ=255)
cgcAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACct > 1:8889187/1‑101 (MQ=255)
cAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACctct < 2:8842978/101‑1 (MQ=255)
aG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACCtctc > 2:3367266/1‑101 (MQ=255)
g.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACCTCTcc < 1:3980955/101‑1 (MQ=255)
|
GGCCGCCCGCACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACCTCTCC > NC_014034/2757345‑2757544
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 39 ≤
ATCG
|