| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,823,740 | +C | 100% | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687 → / → RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,823,740 | 1 | .→C | 100.0% | 148.6 | 337 | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687/RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (180/109): ref base (5/43): total (185/152) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.14e-12 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.10e-02 | ||||||||||
Only 100 of 404 total aligned reads displayed.
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCC > NC_014034/1823640‑1823835
|
ctATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.a.a > 2:4172112/1‑101 (MQ=255)
ctATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.a.a > 1:2553328/1‑101 (MQ=255)
taggCGAGCAAGCGGGTTGGCGGGGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.c < 2:2976795/98‑1 (MQ=255)
tATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.c > 2:6578113/1‑101 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc < 2:7941696/101‑1 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc > 1:6861508/1‑101 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc > 2:6333384/1‑101 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.ccgg > 1:8272093/1‑98 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGNC.GGGGGCAA.A.CC.CGGCt > 2:3776827/1‑101 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.ccggct < 2:2238096/101‑6 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.ccggct < 1:1633104/101‑6 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.ccggct > 2:2316476/1‑96 (MQ=255)
cAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGGA.A.A.CC.CGGCTg > 2:5094407/1‑101 (MQ=255)
cAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTg > 1:8506442/1‑101 (MQ=255)
aaGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTgc > 1:6282869/1‑101 (MQ=255)
aaGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTgc > 2:8176260/1‑101 (MQ=255)
aGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTgcc > 2:4382546/1‑101 (MQ=255)
cGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTgccgc > 2:6527818/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTgccgcc > 1:7132637/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTgccgcc > 1:2247428/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTgccgcc > 2:3278153/1‑101 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGtt < 1:6564378/101‑1 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTc < 2:256560/101‑1 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTc > 2:6708179/1‑101 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTc < 2:2673079/101‑1 (MQ=255)
gcggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCg < 2:8040652/101‑1 (MQ=255)
cggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGc > 2:1216908/1‑101 (MQ=255)
gcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCg > 1:2450330/1‑101 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGt > 2:6944797/1‑101 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc < 2:7622479/101‑1 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc > 1:1971717/1‑101 (MQ=255)
tGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGGTGCCGCCGGTTCGCCGGTcg > 1:5642351/1‑101 (MQ=255)
tGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcg < 1:3638635/101‑1 (MQ=255)
cAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggc < 1:279087/101‑1 (MQ=255)
gCGATTCCGCTGAAATAAAGCTGTGGAAGTTTGCCCCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcgg < 2:45392/101‑1 (MQ=255)
cGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcggg < 1:401656/101‑1 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc > 1:2022146/1‑101 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc > 2:3444782/1‑101 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc > 1:8393732/1‑101 (MQ=255)
aTTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGggcgggcg > 1:5775143/1‑101 (MQ=255)
ccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTGACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCt > 1:6447715/1‑101 (MQ=255)
cgcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCtt < 1:4969613/101‑1 (MQ=255)
gcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGNCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTc > 1:1370374/1‑101 (MQ=255)
cgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTcc < 2:2784092/101‑1 (MQ=255)
gATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCg > 1:823287/1‑101 (MQ=255)
tCAAGCTTTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGc < 2:6245501/101‑1 (MQ=255)
tCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGc < 2:2058820/101‑1 (MQ=255)
tCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGc > 1:1018158/1‑101 (MQ=255)
cAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGcc > 2:901980/1‑101 (MQ=255)
aaGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGTTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCg > 1:4768794/1‑101 (MQ=255)
aaGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCg > 2:6118869/1‑101 (MQ=255)
gCTGTTGAGGTTTGCCGCCTCGTAGCGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCt < 2:8846938/101‑1 (MQ=255)
cTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTg < 1:7841258/101‑1 (MQ=255)
tGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGc > 1:8009613/1‑101 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc > 2:1829927/1‑101 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 1:5189887/101‑1 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 1:568214/101‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa < 1:1768938/101‑1 (MQ=255)
aGTTTGCCCCCTCGTAAGGGGCGGGGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct < 1:6373405/101‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctg < 2:5543310/101‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctg < 1:6201125/101‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGGTGCCTAgctg > 1:8102418/1‑101 (MQ=255)
gTTGGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctg < 2:6858801/101‑1 (MQ=255)
tttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAGGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgc < 1:3204815/101‑1 (MQ=255)
tttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgc > 2:1691052/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctc > 1:3399764/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctc < 1:8715065/101‑1 (MQ=255)
cgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccct < 2:4701954/101‑1 (MQ=255)
gccTCGTACCGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCCTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc < 2:5774908/101‑1 (MQ=255)
gccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc < 2:6761274/101‑1 (MQ=255)
ccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc > 2:3649039/1‑101 (MQ=255)
ccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc < 2:7132333/101‑1 (MQ=255)
cTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg > 1:5028603/1‑101 (MQ=255)
cTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg > 2:1386097/1‑101 (MQ=255)
cTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg < 1:9060419/101‑1 (MQ=255)
tCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgt > 1:6054482/1‑101 (MQ=255)
cGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtc > 1:2894918/1‑101 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 2:3552494/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc > 1:6923261/1‑101 (MQ=255)
tAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg > 1:1216213/1‑101 (MQ=255)
tAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg > 2:315793/1‑101 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa > 2:2521750/1‑101 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCACtccgtccgc > 2:7362968/1‑100 (MQ=255)
aCGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAg < 1:734125/101‑1 (MQ=255)
ggCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTgg > 1:2138678/1‑101 (MQ=255)
cGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCg < 2:5936325/101‑1 (MQ=255)
ggTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCgg > 2:4875085/1‑101 (MQ=255)
ggTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCgg > 1:4857540/1‑101 (MQ=255)
ggagaGGGCCC.CGGGGC.ACC.CC.CGGCTCCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGt < 1:4219737/97‑1 (MQ=255)
gTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGt < 2:8493133/101‑1 (MQ=255)
gAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGc < 1:1438973/101‑1 (MQ=255)
gAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGGGTGGCGGTGc > 1:3010446/1‑101 (MQ=255)
ggggCC.GGGGGC.A.ACCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCggg > 2:5276207/1‑101 (MQ=255)
ggCG.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGt < 2:4979130/101‑1 (MQ=255)
gCC.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTc < 2:5300865/101‑1 (MQ=255)
gcgggggcC.A.A.CCGCGGCTGCCGCCGGTGCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTc < 1:4550694/98‑1 (MQ=255)
cc.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCt < 2:8618808/101‑1 (MQ=255)
cggggggC.A.GCCC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCt < 1:7434251/99‑1 (MQ=255)
c.GGGGGC.ACC.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg < 1:9096575/101‑1 (MQ=255)
ggggggC.A.C.CCACGGTAGCCGCCGTGTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGGTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg < 2:9095271/100‑1 (MQ=255)
|
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.CC.CGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCC > NC_014034/1823640‑1823835
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 17 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|