Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,823,743 | +G | 1.2% | intergenic (+28/‑145) | RCAP_rcc01687 → / → RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,823,743 | 1 | .→G | 1.2% | 3.2 ‑3.2 ‑0.0 | 337 | intergenic (+28/‑145) | RCAP_rcc01687/RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (0/4): ref base (184/149): total (184/153) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.16e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 419 total aligned reads displayed.
TGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCGAACGCC > NC_014034/1823643‑1823843
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gCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.cc < 1:8070343/101‑2 (MQ=255)
gCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.cc > 2:5970410/1‑100 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.ccgg < 2:6872439/101‑4 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.ccgg < 1:3636696/101‑4 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.ccgg > 2:2239442/1‑98 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.ccgg > 2:2605540/1‑98 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGNC.GGGGGCAA.A.CC.C.GGCt > 2:3776827/1‑101 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGGA.A.A.CC.C.GGcc > 1:5010941/1‑100 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.ccggct > 1:4127274/1‑96 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.cc.ccggct < 1:1633104/101‑6 (MQ=255)
cAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTg > 1:339584/1‑101 (MQ=255)
aaGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTgc > 2:8176260/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTgccgcc > 1:2247428/1‑101 (MQ=255)
gTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCgg > 2:3462938/1‑101 (MQ=255)
gTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCgg > 1:6855967/1‑101 (MQ=255)
gTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGGGAAGGGGCC.GGGGGG.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCgg > 1:2925390/1‑101 (MQ=255)
gTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGGGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCgg > 2:4219619/1‑101 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTc < 1:8201815/101‑1 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTc < 2:6239720/101‑1 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAACCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTc < 1:6265243/101‑1 (MQ=255)
gcggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCg < 2:8040652/101‑1 (MQ=255)
ggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGcc > 2:5291575/1‑101 (MQ=255)
gcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCg > 1:2450330/1‑101 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.CGCTGCGGCCGGTTCGCCgg > 2:4726198/1‑101 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGt > 1:3996171/1‑101 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc > 2:4466236/1‑101 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc < 2:7622479/101‑1 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc > 1:1971717/1‑101 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.CCAC.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc > 2:509426/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgg < 2:4641889/101‑1 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc > 1:2022146/1‑101 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTGGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc < 1:4404636/101‑1 (MQ=255)
aTTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGggcgggcg > 1:9080238/1‑101 (MQ=255)
aTTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGggcgggcg > 1:7794045/1‑101 (MQ=255)
tttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgc > 1:7263713/1‑101 (MQ=255)
ttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcg > 2:517824/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCCGCCGCCGGTCCGCCGGTCgggggggctgggcc > 1:8488564/1‑95 (MQ=255)
gcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCGGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTc > 2:6767275/1‑101 (MQ=255)
gcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGNCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTc > 1:1370374/1‑101 (MQ=255)
cgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTcc > 1:4807668/1‑101 (MQ=255)
tCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGc > 1:1018158/1‑101 (MQ=255)
cAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGcc > 2:901980/1‑101 (MQ=255)
aaGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGTCGGGCGCGGGCTTCCGGCCg > 1:5651151/1‑101 (MQ=255)
aaGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCg > 1:61593/1‑101 (MQ=255)
aaGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCg > 1:2696760/1‑101 (MQ=255)
aGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGc > 1:8366315/1‑101 (MQ=255)
gCTGTTGAGGTTTGCCGCCTCGTAGCGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCt < 2:8846938/101‑1 (MQ=255)
gCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCt > 2:6577589/1‑101 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCgattcc > 2:2021418/1‑96 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc > 2:1829927/1‑101 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc > 1:4966485/1‑101 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 1:5189887/101‑1 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 2:2796063/101‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa < 1:1768938/101‑1 (MQ=255)
aGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct < 2:3103590/101‑1 (MQ=255)
aGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct < 1:598950/101‑1 (MQ=255)
aGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct < 1:6941555/101‑1 (MQ=255)
aGTTTGCCCCCTCGTAAGGGGCGGGGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct < 1:6373405/101‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctg < 2:5543310/101‑1 (MQ=255)
ttGCGGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgct < 2:1313870/101‑1 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctc > 2:5317687/1‑101 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc < 2:791709/101‑1 (MQ=255)
gccTCGTACCGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.AGC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc < 2:7162627/101‑1 (MQ=255)
ccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc < 2:3181524/101‑1 (MQ=255)
ccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc > 2:3649039/1‑101 (MQ=255)
cGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtc > 2:6728117/1‑101 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTTAAGGGGCC.GGGGGC.AGC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctagatcg > 1:6529558/1‑95 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 2:3552494/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 2:3304897/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc > 1:3161834/1‑101 (MQ=255)
tAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg > 1:1216213/1‑101 (MQ=255)
tAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg > 1:7387074/1‑101 (MQ=255)
cGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGt < 1:4609620/101‑1 (MQ=255)
cGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAgg > 2:5797768/1‑100 (MQ=255)
gggCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTg < 1:5747455/101‑1 (MQ=255)
ggCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTgg > 1:2138678/1‑101 (MQ=255)
ggTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCgg > 2:2704423/1‑101 (MQ=255)
ggTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCgg > 2:643628/1‑101 (MQ=255)
gTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGt < 2:8493133/101‑1 (MQ=255)
ggAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.CC.CGGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTg < 2:4966325/100‑1 (MQ=255)
gAAGGGGCC.GGGGGC.ACC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGc < 1:1438973/101‑1 (MQ=255)
gAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.CC.CGGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGc < 2:6983581/101‑1 (MQ=255)
aaGGGGCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCg > 1:8267531/1‑101 (MQ=255)
gggCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCgggg > 2:1051076/1‑101 (MQ=255)
gCC.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCgggggc > 2:2437949/1‑99 (MQ=255)
cc.GGGGGC.ACC.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCt < 2:8618808/101‑1 (MQ=255)
cc.GGGGGC.A.ACCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCt < 2:2553255/101‑1 (MQ=255)
ggggggC.A.C.CCAC.GGTAGCCGCCGTGTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGGTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg < 2:9095271/100‑1 (MQ=255)
gggggC.A.CCCC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTgc < 1:7991148/101‑1 (MQ=255)
ggggcacccc.c.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTgcg < 1:5106631/93‑1 (MQ=255)
gccacccc.c.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGcc < 2:74286/95‑1 (MQ=255)
cacccc.c.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCTCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCg < 2:2187425/97‑1 (MQ=255)
cacccc.c.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCg < 1:2833738/97‑1 (MQ=255)
aaccc.c.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCGa > 1:5490627/4‑101 (MQ=255)
aaccc.c.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGCGGCGGTGCGGGGCCTGCGCCCGa > 1:644474/4‑101 (MQ=255)
ccc.c.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCGAAc < 2:6283113/100‑1 (MQ=255)
ccc.c.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCGAAc < 2:1452284/100‑1 (MQ=255)
c.c.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCGAACGc < 1:86601/101‑1 (MQ=255)
c.c.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCGAACGc < 1:8750709/101‑1 (MQ=255)
c.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCGAACGcc < 2:1664829/101‑1 (MQ=255)
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TGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCC.GGGGGC.A.A.CC.C.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCCCGAACGCC > NC_014034/1823643‑1823843
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 17 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
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