Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,974,326 | +G | 98.8% | intergenic (‑19/+36) | rpe1 ← / ← cbbM | ribulose‑phosphate 3‑epimerase/ribulose bisphosphate carboxylase large subunit |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,974,326 | 1 | .→G | 98.8% | 5.3 ‑0.4 ‑1.2 | 403 | intergenic (‑19/+36) | rpe1/cbbM | ribulose‑phosphate 3‑epimerase/ribulose bisphosphate carboxylase large subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (208/189): ref base (2/3): total (210/193) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.73e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.79e-02 |
Only 100 of 452 total aligned reads displayed.
TGGCCTGGATTTCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..GG.GC.GG.GG.T.G.T.CCCCCGCCCGGATAGCACCGGCGTTCAGTTAACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGG > NC_014034/1974226‑1974419
|
tGGCCTGGATTTCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGtt < 2:8512417/101‑1 (MQ=255)
gCCTGGATTTCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGAAGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..gg < 2:5239637/101‑1 (MQ=255)
gcTGGGTTTCGCGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTTATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..gg.g < 1:8959424/100‑1 (MQ=255)
ccTGGATTTCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..gg.g < 2:2280424/101‑1 (MQ=255)
tGGATTTCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..gg.ggc > 1:7584225/1‑99 (MQ=255)
ggATTTCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..gg.ggcg > 1:5282897/1‑98 (MQ=255)
gATTTCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..gg.ggcgg < 2:1379859/101‑5 (MQ=255)
tttCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GC.gg.gg > 1:4999679/1‑101 (MQ=255)
ggCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GC.gg.gggggtcc > 2:2568545/1‑95 (MQ=255)
gCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.T.ccc < 2:1797831/101‑1 (MQ=255)
cGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.T.ccccc < 2:4410994/101‑1 (MQ=255)
gAAATCGGCGAAGCCGGCAGAAAGGCTCGTGGGGGCGATCTTGATGGAAGGGACGAACGTTACTTCTGTCTCCTGAGGGGTT..GG.GG.CG.Gg.t.gcgttacctc > 2:9019444/1‑92 (MQ=255)
aaaTCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.T.ccccccg < 2:8773482/101‑3 (MQ=255)
aaTCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.T.ccccccgc > 2:694902/1‑98 (MQ=255)
aaTCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.G.G.T.ccccccgc > 1:2052220/1‑98 (MQ=255)
cGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCcccgcccg < 1:3149585/101‑1 (MQ=255)
cGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCcccgcccg < 1:2472046/101‑1 (MQ=255)
cGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.G.G.TCCCcccgcccg > 1:4615662/1‑101 (MQ=255)
ggCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.C.G.TCCCCCCGCCCgg > 2:1683971/1‑101 (MQ=255)
gCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGa > 1:6777543/1‑101 (MQ=255)
cGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGAt < 2:8430509/101‑1 (MQ=255)
cGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGAt > 1:3945363/1‑101 (MQ=255)
gAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATa < 2:6349105/101‑1 (MQ=255)
cGGCAGAAAGGATCGGGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.G.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCAcg > 1:7263184/1‑100 (MQ=255)
cGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCAcg < 2:7994929/101‑2 (MQ=255)
gCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCAcggc > 1:5881120/1‑98 (MQ=255)
gCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.G.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCAcggc > 1:9193202/1‑98 (MQ=255)
aGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGt > 2:3043215/1‑101 (MQ=255)
aGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGt > 2:4110366/1‑101 (MQ=255)
aGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.G.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGt > 2:938371/1‑101 (MQ=255)
gAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGtt > 1:3807415/1‑101 (MQ=255)
gAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGtt < 1:637754/101‑1 (MQ=255)
aaaGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTc < 2:6087969/101‑1 (MQ=255)
aaaGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.G.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTc > 1:7650222/1‑101 (MQ=255)
aaGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCa > 1:5186438/1‑101 (MQ=255)
aaGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCa > 2:6535757/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGt < 2:7575322/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCCCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.G.G.TCCCCCCGCCCGGACAGCA.CGGCGTTCCGt > 2:8948512/1‑101 (MQ=255)
aTCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCCGttc > 2:3615704/1‑100 (MQ=255)
aTCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGttc < 2:4562118/101‑2 (MQ=255)
aTCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGttc < 1:1260786/101‑2 (MQ=255)
tCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGttca < 1:5094495/101‑3 (MQ=255)
cGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCAc < 1:3261646/101‑1 (MQ=255)
gAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACg > 1:7859497/1‑101 (MQ=255)
gAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACg > 1:8446163/1‑101 (MQ=255)
ggggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGccc > 1:745096/1‑101 (MQ=255)
ggggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGccc > 2:76949/1‑101 (MQ=255)
ggggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGccc < 2:510508/101‑1 (MQ=255)
gggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCa < 1:4161707/101‑1 (MQ=255)
gggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.G.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCa > 2:1996628/1‑101 (MQ=255)
ggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCag < 2:1571987/101‑1 (MQ=255)
ggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCag > 2:3419576/1‑101 (MQ=255)
gCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCaga < 1:8866838/101‑1 (MQ=255)
cTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAc > 2:5653886/1‑101 (MQ=255)
ttGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcg > 1:346075/1‑101 (MQ=255)
tGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcgc > 1:2909643/1‑101 (MQ=255)
gATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcgcg > 1:4778161/1‑101 (MQ=255)
gATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCCGAGGGGTTGGGG.GG.GG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCGCAGAGCGAcgcg < 1:6583352/101‑1 (MQ=255)
aTGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACgcgc > 1:9126816/1‑101 (MQ=255)
tGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGcc > 1:155182/1‑101 (MQ=255)
ggAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCa < 2:7104408/101‑1 (MQ=255)
ggAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCa < 2:4999519/101‑1 (MQ=255)
ggAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCa > 2:3486810/1‑101 (MQ=255)
gAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAg < 2:5808208/101‑1 (MQ=255)
gAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAg < 2:4852632/101‑1 (MQ=255)
aaCGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGc > 1:7131740/1‑101 (MQ=255)
cGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGccc > 1:2156499/1‑101 (MQ=255)
cGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGccc > 1:6116947/1‑101 (MQ=255)
gTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCgg < 1:694912/101‑1 (MQ=255)
ggAAGGTCATGTCGGTTTCCTGAGGGGTTGGGG.GG.GG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGAt < 1:1028674/100‑1 (MQ=255)
cGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGAt > 2:1201832/1‑101 (MQ=255)
cGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGAt > 2:2091328/1‑101 (MQ=255)
cGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGAt < 1:2625365/101‑1 (MQ=255)
gAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATa < 1:4912015/101‑1 (MQ=255)
gAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATa > 2:5486291/1‑101 (MQ=255)
ggTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.TGG.C.CCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATagag < 1:1914414/101‑1 (MQ=255)
ggTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGTGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATagag < 2:7162893/101‑1 (MQ=255)
ggTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATagag > 2:8262286/1‑101 (MQ=255)
taTGGCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCtt < 1:1130839/100‑1 (MQ=255)
tGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGt > 1:184095/1‑101 (MQ=255)
cGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCgg > 1:3004844/1‑101 (MQ=255)
ggTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGc < 2:7371124/101‑1 (MQ=255)
tctcCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCAt < 2:1862659/101‑1 (MQ=255)
tctcCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCAt > 1:3595901/1‑101 (MQ=255)
ctcCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATc > 1:4325843/1‑101 (MQ=255)
tcCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCg < 1:1424549/101‑1 (MQ=255)
tcCTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCg < 2:7641149/101‑1 (MQ=255)
tcCTGAGGGGTT..GGCGCGGG.GG.T.C.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGTCATCg < 2:6472331/101‑1 (MQ=255)
ccTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGt > 1:8005112/1‑101 (MQ=255)
ccTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGt < 2:9126394/101‑1 (MQ=255)
ccTGAGGGGTTG.GG.GC.GGAGG.A.GCC.CCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGGTAGAGCGTGTCgggcacgt > 2:2895398/1‑95 (MQ=255)
cTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGtt > 1:4257888/1‑101 (MQ=255)
cTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGtt < 2:3996313/101‑1 (MQ=255)
cTGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAATTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGtt > 1:5411474/1‑101 (MQ=255)
tGAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTc < 1:4501273/101‑1 (MQ=255)
gAGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCg < 1:237724/101‑1 (MQ=255)
gggggTTG.GG.GC.GG.GGCT.G.TCCCCCCGCCCGGTTAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCgg < 2:6768260/100‑1 (MQ=255)
aGGGGTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCgg > 1:1361196/1‑101 (MQ=255)
ggggTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCggg < 2:3244444/101‑1 (MQ=255)
ggggTTG.GG.GCGGG.GG.T.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCggg < 1:820839/101‑1 (MQ=255)
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TGGCCTGGATTTCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..GG.GC.GG.GG.T.G.T.CCCCCGCCCGGATAGCACCGGCGTTCAGTTAACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGG > NC_014034/1974226‑1974419
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
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