| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,974,337 | +C | 98.1% | intergenic (‑30/+25) | rpe1 ← / ← cbbM | ribulose‑phosphate 3‑epimerase/ribulose bisphosphate carboxylase large subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,974,337 | 1 | .→C | 98.1% | 12.5 ‑1.8 ‑1.3 | 417 | intergenic (‑30/+25) | rpe1/cbbM | ribulose‑phosphate 3‑epimerase/ribulose bisphosphate carboxylase large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (215/194): ref base (2/6): total (217/200) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.61e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.54e-02 | ||||||||||
Only 100 of 463 total aligned reads displayed.
GGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..GG.GC..GGGGT.GT.CCCCC.GCCCGGATAGCACCGGCGTTCAGTTAACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCTTTCGAACGC > NC_014034/1974241‑1974433
|
gCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GT.ccc < 2:1797831/101‑1 (MQ=255)
gAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGG.GT.cccccc > 1:6099059/1‑100 (MQ=255)
aaaTCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTGTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGG.GT.ccccccg > 2:6614240/1‑99 (MQ=255)
aaaTCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GT.ccccccg < 1:3170549/101‑3 (MQ=255)
cGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCccc.gcccg < 1:2472046/101‑1 (MQ=255)
ggCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCgg > 1:1680528/1‑101 (MQ=255)
cGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGAt < 2:8862454/101‑1 (MQ=255)
cGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGAt < 2:8430509/101‑1 (MQ=255)
cGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGG.GTCCCCCC.GCCCGGAt > 2:3460138/1‑101 (MQ=255)
gAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTCGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATa < 2:6763241/101‑1 (MQ=255)
aGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGc < 1:7324257/101‑1 (MQ=255)
tCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATATTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCAc > 2:1884799/1‑101 (MQ=255)
cGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCAcg < 2:7994929/101‑2 (MQ=255)
ggCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGG.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCAcgg > 1:701016/1‑99 (MQ=255)
gCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCAcggc > 2:4431639/1‑98 (MQ=255)
gCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCAcggc > 2:2088685/1‑98 (MQ=255)
aGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGt > 1:5798004/1‑101 (MQ=255)
aaaGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTc > 2:7076050/1‑101 (MQ=255)
aaGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCa < 1:7187554/101‑1 (MQ=255)
aGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGG.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAg > 1:4952878/1‑101 (MQ=255)
aTCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGttc < 2:1696359/101‑2 (MQ=255)
aTCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGttc < 1:1260786/101‑2 (MQ=255)
aTCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGttc > 2:5850653/1‑100 (MQ=255)
tCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGG.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAggtca > 2:7416775/1‑97 (MQ=255)
cGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCAc > 2:6395707/1‑101 (MQ=255)
cGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCAc < 1:5213029/101‑1 (MQ=255)
gAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGttcaag > 2:944014/1‑97 (MQ=255)
gAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACg < 2:2935209/101‑1 (MQ=255)
gAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACg > 1:7641476/1‑101 (MQ=255)
gAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACg > 1:7859497/1‑101 (MQ=255)
aGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGc > 1:320213/1‑101 (MQ=255)
gggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCa < 1:4161707/101‑1 (MQ=255)
ggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCag > 2:2523587/1‑101 (MQ=255)
ggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCag < 2:1571987/101‑1 (MQ=255)
gCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCaga > 2:913538/1‑101 (MQ=255)
gCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCaga < 1:8866838/101‑1 (MQ=255)
gCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGG.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGGTCACGCCCaga > 1:8453435/1‑101 (MQ=255)
cGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCagag > 1:9179152/1‑101 (MQ=255)
gATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGc < 2:7128381/101‑1 (MQ=255)
gATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGG.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGc > 1:1927573/1‑101 (MQ=255)
aTCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCg > 2:3288196/1‑101 (MQ=255)
cTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAc < 2:5612566/101‑1 (MQ=255)
cTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAc < 1:6738129/101‑1 (MQ=255)
ttGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcg > 2:5084334/1‑101 (MQ=255)
ttGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcg < 1:4291205/101‑1 (MQ=255)
gATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcgcg > 2:4867171/1‑101 (MQ=255)
gATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcgcg < 2:9093456/101‑1 (MQ=255)
gATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcgcg > 1:4778161/1‑101 (MQ=255)
aTGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACgcgc > 1:4580488/1‑101 (MQ=255)
aTGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGAGTTCAGTTCACGCCCCGAGCGACgcgc > 2:5225439/1‑101 (MQ=255)
tGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGcc < 1:7567259/101‑1 (MQ=255)
ggAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCa > 1:8068285/1‑101 (MQ=255)
aCGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGcc > 1:1845777/1‑101 (MQ=255)
cGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..GG.GCCGGGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCCGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGccc < 1:6523021/101‑1 (MQ=255)
ggAAGGTCATGTCGGTTTCCTGAGGGGTTGGGG.GG..GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGAt < 1:1028674/100‑1 (MQ=255)
cGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGAt < 2:4088852/101‑1 (MQ=255)
cGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGAt > 1:346876/1‑101 (MQ=255)
cGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGAt > 2:7828352/1‑101 (MQ=255)
tccgatcttGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATa < 1:4469107/93‑1 (MQ=255)
aaGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATag > 1:9126214/1‑101 (MQ=255)
ggTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATagag > 2:8262286/1‑101 (MQ=255)
ggTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATagag > 1:8225504/1‑101 (MQ=255)
ggTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GT.CCCCCAGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAAGCGCCAGCCCGGATagag > 1:4235303/1‑101 (MQ=255)
tCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCt < 1:5027300/101‑1 (MQ=255)
taTGGCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCtt < 1:1130839/100‑1 (MQ=255)
cATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGTGGC.CCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCtt < 1:2220424/101‑1 (MQ=255)
cATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCtt > 2:3091108/1‑101 (MQ=255)
aTGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTg > 1:2904246/1‑101 (MQ=255)
aTGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTg > 2:2207621/1‑101 (MQ=255)
gTCGGTGTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTc < 1:6905783/101‑1 (MQ=255)
gTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTc < 2:5797769/101‑1 (MQ=255)
tCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCg > 1:6176142/1‑101 (MQ=255)
cGGTCTCCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCgg > 1:3004844/1‑101 (MQ=255)
tctcCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCAt > 1:3595901/1‑101 (MQ=255)
tctcCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCAt > 1:5151444/1‑101 (MQ=255)
tcCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCg < 1:1424549/101‑1 (MQ=255)
tcCTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCg < 2:7641149/101‑1 (MQ=255)
tcCTGAGGGGTT..GGCGCG.GGGGT.CTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGTCATCg < 2:6472331/101‑1 (MQ=255)
cTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGtt < 2:5381964/101‑1 (MQ=255)
cTGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGtt > 1:5402056/1‑101 (MQ=255)
tGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGGGCGACGCGCCAGCCCCGATAGAGCTGGCCGGCATCGTTc > 2:609579/1‑101 (MQ=255)
tGAGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTc > 2:1340429/1‑101 (MQ=255)
aGGGGTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCgg > 1:1361196/1‑101 (MQ=255)
ggggTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCggg < 2:7233814/101‑1 (MQ=255)
ggggTTG.GG.GCG.GGGGT.GTCCCCCC.GCACGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCggg < 1:3823643/101‑1 (MQ=255)
gttggggcgggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAg < 2:3699529/92‑1 (MQ=255)
gttggggcgggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAg > 2:276612/10‑101 (MQ=255)
tggggcgggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGCAGCt > 2:1115144/8‑101 (MQ=255)
tggggcgggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCt > 1:2584346/8‑101 (MQ=255)
tggggcgggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCt > 2:3941413/8‑101 (MQ=255)
ggggcgggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCtt > 2:758751/7‑101 (MQ=255)
ggcgggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCTTTc < 1:2088747/97‑1 (MQ=255)
ggcgggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCTTTc < 1:9010494/97‑1 (MQ=255)
ggcgggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCTTTc < 1:1564642/97‑1 (MQ=255)
ggcgggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCTTTc < 2:8572994/97‑1 (MQ=255)
ggcgggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCTTTc < 1:3951457/97‑1 (MQ=255)
gggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCTTTCGaa < 1:2376405/100‑1 (MQ=255)
ggggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCTTTCGAAc > 2:4703811/1‑101 (MQ=255)
ggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCTTTCGAACGc > 1:3434938/1‑101 (MQ=255)
ggT.GTCCCCCC.GCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCTTTCGAACGc > 2:4532125/1‑101 (MQ=255)
|
GGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..GG.GC..GGGGT.GT.CCCCC.GCCCGGATAGCACCGGCGTTCAGTTAACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAAGCTTTCGAACGC > NC_014034/1974241‑1974433
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 28 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|