Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 2,177,276 | +T | 98.8% | coding (101/990 nt) | rbsB ← | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 2,177,276 | 2 | .→T | 98.8% | 2.7 ‑0.4 ‑0.7 | 334 | coding (101/990 nt) | rbsB | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (190/139): ref base (3/1): total (194/140) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.42e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.83e-01 |
Only 100 of 367 total aligned reads displayed.
CATCGCCATCGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AA...GGGTT.G..GTCGGT.CTT.G.TGTACAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.G.AGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.GGCAGAGG.CCCCAACAGGGCC > NC_014034/2177181‑2177363
|
caTCGCCATCGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.g..gtg > 2:5036516/1‑100 (MQ=255)
caTCGCCATCGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.g..gtg < 1:8569903/101‑2 (MQ=255)
tCGCCATCGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.g..gtgtc < 2:8763681/101‑4 (MQ=255)
gCCATCGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.g..gtgtcgg > 2:6203201/1‑96 (MQ=255)
ccATCGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.g..gtgtcggt < 2:2280541/101‑7 (MQ=255)
cATCGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.g..gtgtcggtc > 1:4944901/1‑94 (MQ=255)
aTCGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.g..gtgtcggtct < 2:6900387/101‑9 (MQ=255)
tCGATCTTGCCCGCATAGGTCGATGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.g..gtgtcggtctt < 2:7723292/101‑10 (MQ=255)
tCGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.g..gtgtcggtctt < 1:7834948/101‑10 (MQ=255)
tCGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.g..gtgtcggtctt < 2:6160973/101‑10 (MQ=255)
cGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTt.g > 2:2687142/1‑101 (MQ=255)
cGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTt.g > 1:1677128/1‑101 (MQ=255)
aTCTTGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTt.ggg > 2:3734140/1‑99 (MQ=255)
ttGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTt.ggtgat < 1:6208218/101‑6 (MQ=255)
ttGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTt.ggtgat > 2:7295895/1‑96 (MQ=255)
ttGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTt.ggtgat > 2:797040/1‑96 (MQ=255)
tGCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTt.ggtgatc < 2:5978185/101‑7 (MQ=255)
gCCCGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTt.ggtgatca > 2:4770174/1‑94 (MQ=255)
cccGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTt.ggtgaccag < 1:7206723/101‑9 (MQ=255)
ccGCATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTt.ggtgatcaga < 1:2413288/101‑10 (MQ=255)
cGCAGAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCGCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTGCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTt.ggtgatcagac < 2:805421/101‑11 (MQ=255)
cATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGAtcagacag > 2:2357363/1‑101 (MQ=255)
aTAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAgg < 1:1157299/101‑1 (MQ=255)
aTAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAgg > 1:58927/1‑101 (MQ=255)
tAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGc > 1:3262191/1‑101 (MQ=255)
aGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGcc < 2:5283263/101‑1 (MQ=255)
aGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGcc < 2:320861/101‑1 (MQ=255)
aGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGcc < 2:1015465/101‑1 (MQ=255)
ggTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGccc > 1:2466862/1‑101 (MQ=255)
ggTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGccc > 2:4162952/1‑101 (MQ=255)
ggTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGcac > 1:9020604/1‑99 (MQ=255)
gTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGcccc < 1:836497/101‑1 (MQ=255)
tCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCg > 2:3039489/1‑101 (MQ=255)
cGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCgg > 1:3995306/1‑101 (MQ=255)
agagCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTCCTTCTTGCGGAA.AACG.GGGTTGG..GGTGGTCCTT.GTTGTTCAGAAAGGCCCCGGtt > 1:5812359/4‑101 (MQ=255)
gCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCg < 2:1785599/101‑1 (MQ=255)
cACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCgg > 1:6025308/1‑101 (MQ=255)
cACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCgg > 2:6788361/1‑101 (MQ=255)
ccAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGcc > 2:2491590/1‑101 (MQ=255)
ccAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGcc > 2:4527118/1‑101 (MQ=255)
cAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.g > 2:739596/1‑101 (MQ=255)
cAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.g > 1:6120399/1‑101 (MQ=255)
aGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.G.a > 2:7647441/1‑101 (MQ=255)
ccccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.G.aag < 1:2580809/101‑3 (MQ=255)
cccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.G.aagc < 1:315735/101‑4 (MQ=255)
cATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.G.aagccg > 2:14314/1‑96 (MQ=255)
aTCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGATGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAgccgc > 2:8206430/1‑101 (MQ=255)
aTCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAgccgc < 1:7714733/101‑1 (MQ=255)
ctcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGGTG.GT.GTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGccc > 2:5624944/1‑101 (MQ=255)
cGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGTCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCg < 2:4073265/101‑1 (MQ=255)
cGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCg > 1:7084828/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCgg > 2:7083056/1‑101 (MQ=255)
gTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGc < 1:8845624/101‑1 (MQ=255)
gTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGc > 1:1465149/1‑101 (MQ=255)
gTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGc > 2:2907909/1‑101 (MQ=255)
tCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGcc < 2:9131493/101‑1 (MQ=255)
tCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGcc < 1:1021478/101‑1 (MQ=255)
gcGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGcc < 2:519833/100‑1 (MQ=255)
cGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCa < 2:5714299/101‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAg > 1:5085175/1‑101 (MQ=255)
gCCTGTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGGTG.GT.GTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAg < 1:560592/101‑1 (MQ=255)
cTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAgcg < 1:52318/101‑1 (MQ=255)
cTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAgcg > 1:4210195/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAgcgc > 1:3531666/1‑101 (MQ=255)
tGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCgg > 2:3317957/1‑101 (MQ=255)
ccGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaa < 1:2141276/101‑1 (MQ=255)
ccGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaa < 1:3466440/101‑1 (MQ=255)
ccGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaa > 1:460224/1‑101 (MQ=255)
cGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaa > 2:1880723/1‑101 (MQ=255)
cGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaa > 2:8374679/1‑101 (MQ=255)
gAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaaa > 1:5147831/1‑101 (MQ=255)
gAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaaa < 1:4354480/101‑1 (MQ=255)
gAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaaa > 1:8151568/1‑101 (MQ=255)
gAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGaaaa > 2:113610/1‑101 (MQ=255)
aaGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAAc > 2:6484777/1‑101 (MQ=255)
aaGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAAc > 2:6338451/1‑101 (MQ=255)
aaGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAAc < 2:388257/101‑1 (MQ=255)
aGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACg > 2:3002774/1‑101 (MQ=255)
aCCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCAGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCa > 2:5365671/1‑101 (MQ=255)
cttccttcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gg > 2:5431504/1‑101 (MQ=255)
tccttcATCTTGGCGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gggc < 2:7168831/101‑3 (MQ=255)
tccttcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gggc > 2:4593348/1‑99 (MQ=255)
tccttcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gggc > 1:1755987/1‑99 (MQ=255)
tccttcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gggc < 1:2908007/101‑3 (MQ=255)
ccttcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gggca < 2:6596678/101‑4 (MQ=255)
ccttcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gggca > 1:2815683/1‑98 (MQ=255)
ccttcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGCGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGCCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCACGGCCCGCGCGGAAAACGCCA.gggca > 1:4445495/1‑98 (MQ=255)
cttcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gggcag > 1:2692692/1‑97 (MQ=255)
cttcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gggcag > 1:3077793/1‑97 (MQ=255)
ttcATCTTGACGAA.AAGG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gggcaga > 2:3623132/1‑96 (MQ=255)
ttcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.gggcaga > 1:6386594/1‑96 (MQ=255)
tcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCagag > 2:3446852/1‑101 (MQ=255)
tcATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCagag > 2:8972124/1‑101 (MQ=255)
cATCTTGACGAACAAG..GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGG.AGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAgg > 1:6562830/1‑101 (MQ=255)
cATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAgg > 2:6712324/1‑101 (MQ=255)
cATCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAgg < 2:5875986/101‑1 (MQ=255)
tCTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGG.cc < 1:7450325/101‑1 (MQ=255)
cTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGG.ccc > 2:746267/1‑101 (MQ=255)
cTTGACGAA.AAAG.GGGTT.GGTGTCGGT.CTTGG.TGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGG.ccc < 1:6736219/101‑1 (MQ=255)
acgggttggg..gtcggt.cTTGG.TGAGCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGcc < 2:4259834/92‑1 (MQ=255)
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CATCGCCATCGATCTTGCCCGCATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AA...GGGTT.G..GTCGGT.CTT.G.TGTACAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.G.AGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.GGCAGAGG.CCCCAACAGGGCC > NC_014034/2177181‑2177363
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 21 ≤
ATCG
< 30 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
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