Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 3,173,565 | +C | 96.9% | intergenic (+600/‑82) | tyrA → / → RCAP_rcc02983 | prephenate dehydrogenase/extensin family protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 3,173,565 | 1 | .→C | 96.9% | 4.4 ‑1.1 ‑1.1 | 129 | intergenic (+600/‑82) | tyrA/RCAP_rcc02983 | prephenate dehydrogenase/extensin family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (90/35): ref base (2/2): total (92/37) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.24e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.24e-02 |
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
GCGCCGGTCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.G.CCGCCGCGCAAGCG.C.A.A.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGCCTG > NC_014034/3173466‑3173658
|
gcgcCGGTCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCgcgcaagcg.c.a.a < 2:936471/101‑1 (MQ=255)
gcCGGTCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCgcgcaagcg.c.a.acg > 2:3426586/1‑99 (MQ=255)
ccGGTCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCgcgcaagcg.c.a.acgc > 2:5575480/1‑98 (MQ=255)
cGGTCACGCCCGCCCCCGCCACCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCgcgcaagcg.c.a.acgcc < 1:5615842/101‑5 (MQ=255)
gTCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.A.Cgcccc > 2:507133/1‑101 (MQ=255)
tCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGccccc < 1:6346403/101‑1 (MQ=255)
cggccgcccccgcccCCACCCCTCCCGCCGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCccccgcc < 2:5829093/98‑1 (MQ=255)
cgcccgccCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCccccgcc < 1:2349995/101‑1 (MQ=255)
cccccccccccgccCCCACCCCTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCccccgcc < 1:4399655/99‑1 (MQ=255)
cccgcccccgccCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCccccgcccc < 2:1865446/101‑1 (MQ=255)
ccgcccccgcccCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCccccgccccg > 1:3594929/1‑101 (MQ=255)
gccccggcccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGa < 2:436715/101‑1 (MQ=255)
cccgcccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAgc > 1:1963863/1‑101 (MQ=255)
ccgcccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcg > 1:8617113/1‑101 (MQ=255)
cgcccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgc > 1:5856914/1‑101 (MQ=255)
gcccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAgggcc > 1:7353803/1‑101 (MQ=255)
gcccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgcc > 1:5124385/1‑101 (MQ=255)
ccccccACCACGCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgcc < 2:8616727/100‑1 (MQ=255)
cccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgccc > 1:2420636/1‑101 (MQ=255)
ccccACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgcccg > 2:316308/1‑101 (MQ=255)
cacctcGCCCTCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCGTC.CCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgcccgcgc < 2:6167039/101‑1 (MQ=255)
cccccTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAgcgcccgcgcc < 1:770614/97‑1 (MQ=255)
ccTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGa < 1:9186480/100‑1 (MQ=255)
ccTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTCCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACACCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGa < 2:3586162/100‑1 (MQ=255)
gCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTcc > 2:914383/1‑101 (MQ=255)
ggAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGcc > 1:4362843/1‑101 (MQ=255)
ggAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGcc > 1:2293324/1‑101 (MQ=255)
ggAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGcc > 2:8932237/1‑101 (MQ=255)
gaggccgccgccGGGCGGCGTGCTGTCGCCCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGccc < 2:4251170/98‑1 (MQ=255)
gAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGccc > 2:5375283/1‑101 (MQ=255)
aGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGc > 1:5355830/1‑101 (MQ=255)
gccgccgccGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCa > 2:6211010/1‑101 (MQ=255)
ccgccgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGc > 2:1284375/1‑101 (MQ=255)
cgccgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGcc < 1:7289961/101‑1 (MQ=255)
gccgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.CAA.A.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCg > 2:6593423/1‑101 (MQ=255)
gccgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCg < 1:3426690/101‑1 (MQ=255)
ccgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGa < 1:6863118/101‑1 (MQ=255)
ccgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGa > 2:3892388/1‑101 (MQ=255)
cgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAg > 2:3546000/1‑101 (MQ=255)
cgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAg < 2:3946132/101‑1 (MQ=255)
cgGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCCCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCACGGCCGAg > 1:4743421/1‑101 (MQ=255)
ggcggcGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGcc < 1:6358220/101‑1 (MQ=255)
gcggcgTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGccc < 1:3892503/101‑1 (MQ=255)
gcgccgTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCACGCGCC.A.C.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGccc < 2:8758772/101‑1 (MQ=255)
cggcgTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCg > 1:4161043/1‑101 (MQ=255)
ggcgTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCgg > 1:306739/1‑101 (MQ=255)
ggcgTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCgg > 1:1792333/1‑101 (MQ=255)
cgTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGcc > 1:3809106/1‑101 (MQ=255)
cgTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGcc > 2:167356/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCt > 2:7438704/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCt > 2:1790710/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCt > 1:1362848/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCt < 1:5375467/101‑1 (MQ=255)
gTGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCt > 2:1531609/1‑101 (MQ=255)
tGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTg > 2:10194/1‑101 (MQ=255)
tGCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTg > 1:3014094/1‑101 (MQ=255)
gCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTgc > 2:2078124/1‑101 (MQ=255)
gCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTgc > 2:2243964/1‑101 (MQ=255)
gCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTgc > 1:5023162/1‑101 (MQ=255)
gCTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGACCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTgc > 1:4676153/1‑101 (MQ=255)
cTGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTgcg > 2:7552121/1‑101 (MQ=255)
tGTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCCGCCTgcgc > 2:677588/1‑101 (MQ=255)
gTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGcgcg > 2:8276692/1‑101 (MQ=255)
gTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGcgcg > 2:7292612/1‑101 (MQ=255)
gTCGCGCCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGcgcg > 1:9644/1‑101 (MQ=255)
cgcCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCACGGCCGAGCCCGGCCTGCGCgggcc > 1:6970756/1‑99 (MQ=255)
gcCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGggtcg < 1:3998244/101‑1 (MQ=255)
gcCTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGggtcg > 1:2643999/1‑101 (MQ=255)
cTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGggtcggt > 2:373886/1‑101 (MQ=255)
cTTTTCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGggtcggc > 2:8363180/1‑100 (MQ=255)
ttttCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGggtcggtc > 2:2583647/1‑101 (MQ=255)
tttCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCt > 1:1460253/1‑101 (MQ=255)
tttCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCt < 2:3325001/101‑1 (MQ=255)
ttCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTg > 1:8483257/1‑101 (MQ=255)
ttCG.GCCCGCCGCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTg < 2:1702865/101‑1 (MQ=255)
tcggcccgccgCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgc < 1:5184372/96‑1 (MQ=255)
tcggcacgccgcGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGGCGGTCCgc > 2:9084731/7‑101 (MQ=255)
cggcccgccgCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcg > 2:2031419/5‑101 (MQ=255)
cggcccgccgCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcg < 2:4203776/97‑1 (MQ=255)
cggcccgccgCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcg > 2:4055539/5‑101 (MQ=255)
cggcccgccgCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcg > 2:3748459/5‑101 (MQ=255)
ggcccgccgCGCAAGCG.C.ACC.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcgg < 2:2420563/98‑1 (MQ=255)
ggcccgccgCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcgg > 2:4284170/4‑101 (MQ=255)
ggcccgccgCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcgg > 1:3408928/4‑101 (MQ=255)
gcccgccgCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcggc > 2:8661073/3‑101 (MQ=255)
gcccgccgCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcggc > 2:629121/3‑101 (MQ=255)
gcccgccgCGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcggc < 2:2683764/99‑1 (MQ=255)
cccgccgCGCAAGCC.C.ACC.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTgcggcg < 1:914396/100‑1 (MQ=255)
gccgcGCAAGCG.C.A.ACGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCACGGGTCGGTCTGCGGCGTGc > 1:5610294/1‑101 (MQ=255)
cgcgCAAGCG.C.AGC.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGccc < 1:9085153/101‑1 (MQ=255)
gcgcaagcg.c.a.acGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCg < 2:5856679/101‑1 (MQ=255)
gcgcaagcg.c.a.acGCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCg < 1:1757617/101‑1 (MQ=255)
gcaagcg.c.a.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGc > 2:4631627/1‑101 (MQ=255)
gcaagcg.c.a.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGc > 1:8162319/1‑101 (MQ=255)
caagcg.c.a.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTTCCCGGcc < 1:8735059/101‑1 (MQ=255)
caagcg.c.a.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGcc > 2:1295572/1‑101 (MQ=255)
aagcg.c.a.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGCAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGACTGCGGCGTGCCCGGCCt > 2:2806232/1‑101 (MQ=255)
aagcg.c.a.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGCCt < 2:5209976/101‑1 (MQ=255)
aagcg.c.a.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGCCt > 1:8644364/1‑101 (MQ=255)
aagcg.c.a.acgCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGCCt > 1:8874264/1‑101 (MQ=255)
|
GCGCCGGTCACGCCCGCCCCCGCCCCCACCACTCCCGCAGCCCGGAAGCCGCCGCCGGGCGGCGTGCTGTCGCGCCTTTTCG.G.CCGCCGCGCAAGCG.C.A.A.GCCCCCGCCCCGGAAGCGCCCGCGCCCGAAGCCCCTCCGGCCCGCAGGGCCGAGCCCGGCCTGCGCGGGTCGGTCTGCGGCGTGCCCGGCCTG > NC_014034/3173466‑3173658
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 39 ≤
ATCG
|