Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 3,560,922 | +G | 98.9% | coding (330/1134 nt) | bioF → | 8‑amino‑7‑oxononanoate synthase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 3,560,922 | 1 | .→G | 98.9% | 3.4 ‑1.0 ‑0.2 | 370 | coding (330/1134 nt) | bioF | 8‑amino‑7‑oxononanoate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (185/181): ref base (1/3): total (186/184) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.70e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.33e-01 |
Only 100 of 439 total aligned reads displayed.
CTGGAGCAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCTCTTGCGACGCTGCCGAT.GGC.GG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCTTTCGCCACAATGA > NC_014034/3560821‑3561017
|
cTGGAGCAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGCGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGc > 1:240685/1‑101 (MQ=255)
tGGAGCAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.g > 1:1051264/1‑101 (MQ=255)
tGGAGCAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.g > 1:1603543/1‑101 (MQ=255)
tGGAGCAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.g > 2:8325837/1‑101 (MQ=255)
gAGCAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.gg.g > 2:3835896/1‑101 (MQ=255)
aGCAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.gg.g.g > 2:3929677/1‑101 (MQ=255)
gCAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.gg.g.gg < 1:8442983/101‑2 (MQ=255)
gCAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.gg.g.gg < 1:8509690/101‑2 (MQ=255)
cAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCTAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.gg.g.gga > 1:8644792/1‑99 (MQ=255)
cAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.gg.g.ggg > 2:6780254/1‑99 (MQ=255)
aaGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGCT.GGC.gg.g.ggat > 1:1850903/1‑98 (MQ=255)
aaGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.gg.g.ggat < 1:4155113/101‑4 (MQ=255)
agagGCCGCCTGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.gg.g.ggatc > 1:3610993/1‑97 (MQ=255)
gagGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.gg.g.ggatct < 1:6327565/101‑6 (MQ=255)
gggCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTg < 1:2626605/100‑1 (MQ=255)
agGCCGCCGGTTTTTGCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTg < 1:1641856/101‑1 (MQ=255)
gccgccGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATTGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGATGGGG.GG.G.GATCTGGt < 1:6563543/101‑1 (MQ=255)
gccgGTTTTTTCGGTGCTGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATGAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.GGCG.GATCTGGtact < 2:765292/101‑1 (MQ=255)
cgGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGtgctgc > 2:5252392/1‑101 (MQ=255)
cgGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGtgctgc > 2:6425559/1‑101 (MQ=255)
ggTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGTTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCa > 1:316023/1‑101 (MQ=38)
ggTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCa > 1:8897635/1‑101 (MQ=255)
ggTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCa > 2:5587407/1‑101 (MQ=255)
gTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCAt < 2:1051246/101‑1 (MQ=255)
ttttttCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATg < 2:1716792/101‑1 (MQ=255)
ttttttCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATg < 1:5259882/101‑1 (MQ=255)
ttttttCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATg > 1:5555552/1‑101 (MQ=255)
ttttttCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATg > 2:3501498/1‑101 (MQ=255)
ttttCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGGGCTGCATGAc > 2:6592295/1‑101 (MQ=255)
ttCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGt > 1:5352693/1‑101 (MQ=255)
tCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTg > 1:5178006/1‑101 (MQ=255)
cGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGc > 2:2350974/1‑101 (MQ=255)
ggTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCt > 1:7440061/1‑101 (MQ=255)
tGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGa > 1:5794904/1‑101 (MQ=255)
gCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGAt < 2:8447297/101‑1 (MQ=255)
gAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCa > 2:6944863/1‑101 (MQ=255)
gAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCa > 1:3943572/1‑101 (MQ=255)
gAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCAAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCa < 1:4342222/101‑1 (MQ=255)
aGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCAt < 2:246201/101‑1 (MQ=255)
aGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCAt < 1:7606282/101‑1 (MQ=255)
ggCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATg < 1:509611/101‑1 (MQ=255)
ggCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATg < 2:2759952/101‑1 (MQ=255)
gCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGc > 2:1630528/1‑101 (MQ=255)
gCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGc > 2:1926214/1‑101 (MQ=255)
gCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGc < 2:3571566/101‑1 (MQ=255)
gCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGc > 1:6050264/1‑101 (MQ=255)
gCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.GG.GCGATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGc < 1:6990567/101‑1 (MQ=255)
ccTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGcc < 2:7244915/101‑1 (MQ=255)
cTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCa > 2:4766582/1‑101 (MQ=255)
gTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAgc < 1:4041726/101‑1 (MQ=255)
ttttCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAgcgcg > 1:4656412/1‑101 (MQ=255)
tCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCAt > 1:4804053/1‑101 (MQ=255)
cATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATg > 2:8816386/1‑101 (MQ=255)
cATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATg > 1:2558478/1‑101 (MQ=255)
cATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATg < 1:1336651/101‑1 (MQ=255)
aTGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGa > 1:273800/1‑101 (MQ=255)
aTGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGGGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGa > 2:3153397/1‑101 (MQ=255)
ggcggcGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAggg < 1:2992845/101‑1 (MQ=255)
cggcggGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGc < 2:7298877/101‑1 (MQ=255)
gcggGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTg < 1:7708949/101‑1 (MQ=255)
cggGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGc < 1:3539635/101‑1 (MQ=255)
gggTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCg < 1:5615996/101‑1 (MQ=255)
gggTTCCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCg < 1:8170007/101‑1 (MQ=255)
ggTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCgg < 2:4528657/101‑1 (MQ=255)
ggTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCgg > 1:840526/1‑101 (MQ=255)
ggTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCgg > 1:2308088/1‑101 (MQ=255)
ttCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTg > 2:1554177/1‑101 (MQ=255)
ttCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGC.GGTG.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTg > 2:4367638/1‑101 (MQ=255)
tCAGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTgg < 1:8254213/101‑1 (MQ=255)
aGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGc > 2:9121734/1‑101 (MQ=255)
aGGCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGc < 1:1156675/101‑1 (MQ=255)
gCCAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTc < 2:62640/101‑1 (MQ=255)
ccAGTCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCg > 1:8796268/1‑101 (MQ=255)
ccAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCg > 2:4866572/1‑101 (MQ=255)
cAATCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCgg > 2:2582164/1‑101 (MQ=255)
aTCAGGCTGTCT.TTGCGCCGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGcc < 2:7805841/101‑1 (MQ=255)
aTCAGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGcc > 2:7030126/1‑101 (MQ=255)
aGGCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAg < 1:723210/101‑1 (MQ=255)
ggCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGTGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAgg > 1:4389228/1‑101 (MQ=255)
gCGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGc > 2:4171245/1‑101 (MQ=255)
cGGTCT.TTGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCa > 2:1480301/1‑101 (MQ=255)
ggtctttGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GCTCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGGTCGGCCGAGGCAc > 2:6016851/6‑101 (MQ=255)
ggtctttGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGGGGCAc > 2:2237016/6‑101 (MQ=255)
ggtctttGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCAc > 2:5091532/6‑101 (MQ=255)
ggtctttGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCAc > 1:1515467/6‑101 (MQ=255)
ctttGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCa > 1:3803916/3‑101 (MQ=255)
tttGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGccg > 1:6743378/2‑99 (MQ=255)
tttGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAg < 2:5767793/100‑1 (MQ=255)
tttGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAg < 1:943254/100‑1 (MQ=255)
tttGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GAGCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAg < 2:2154757/100‑1 (MQ=255)
tGCGACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCt > 1:6478066/1‑101 (MQ=255)
gACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCTTTc > 1:7860880/1‑101 (MQ=255)
gACGCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCTTTc < 2:3287215/101‑1 (MQ=255)
gCTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCTTTCGcc > 2:8650390/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCTTTCGCca < 1:2014154/101‑1 (MQ=255)
gCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCTTTCGCcaca < 1:5949258/101‑1 (MQ=255)
gCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCTTTCGCcaca > 2:7181520/1‑101 (MQ=255)
gCCGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCTTTCGCcaca > 2:5018785/1‑101 (MQ=255)
ccGAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCTTTCGCcacca > 2:3014532/1‑99 (MQ=255)
gAT.GGCGGG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCTTTCGCCACAATg > 2:8186157/1‑101 (MQ=255)
|
CTGGAGCAAGAGGCCGCCGGTTTTTTCGGTGCCGAGGCCTGTCTTTTCATGGGCGGCGGGTTTCAGGCCAATCAGGCGGTCTCTTGCGACGCTGCCGAT.GGC.GG.G.GATCTGGTGCTGCATGACGTGCTGATCCATGCCAGCGCGCATGAGGGGCTGCGGCTGGGCTCGGCCGAGGCACGCAGCTTTCGCCACAATGA > NC_014034/3560821‑3561017
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 30 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|