| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,407 | G→C | 3.9% | intergenic (+219/‑712) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,407 | 0 | G→C | 3.9% | 32.2 ‑0.2 ‑0.3 | 484 | intergenic (+219/‑712) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/9): ref base (222/243): total (232/252) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.16e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.27e-01 | ||||||||||
Only 100 of 512 total aligned reads displayed.
GCACCTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCC > NC_014034/1395307‑1395507
|
cACCTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTgg < 1:1357960/101‑1 (MQ=255)
aCCTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGc < 1:9148788/101‑1 (MQ=255)
ccTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGcc > 1:1388150/1‑101 (MQ=255)
ccTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGcc > 1:4006904/1‑101 (MQ=255)
cTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGccc < 2:3078117/101‑1 (MQ=255)
cTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGATCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGccc > 1:8063009/1‑101 (MQ=255)
ttCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCt < 1:737864/101‑1 (MQ=255)
ttCGCACCACCGGAGCAATTGACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGTCCt < 1:8819640/101‑1 (MQ=255)
tCGCACCCCCGGAGTAATTTACTCCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTg < 1:4705033/101‑1 (MQ=255)
tCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTg < 1:373738/101‑1 (MQ=255)
cGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGc > 1:129209/1‑101 (MQ=255)
gCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGTCCCTgtc > 2:6482542/1‑99 (MQ=255)
gCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGcc < 1:5903012/101‑1 (MQ=255)
caccacCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcg > 1:1810799/1‑101 (MQ=255)
caccacCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcg > 2:2699148/1‑101 (MQ=255)
caccacCGGAGCAATTTACACCGTATGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcg > 2:4380325/1‑101 (MQ=255)
ccaccGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggt < 2:7091315/101‑1 (MQ=255)
ccaccGGAGCAATTTACACCGGCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggt < 1:4793132/101‑1 (MQ=255)
accGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtga > 2:6363175/1‑101 (MQ=255)
accGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtga < 1:2713421/101‑1 (MQ=255)
gAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggggatcgg > 2:3982553/1‑101 (MQ=255)
aGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggt < 2:2640783/101‑1 (MQ=255)
aGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcgag > 1:7764909/1‑99 (MQ=255)
cAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.a > 2:3839887/1‑101 (MQ=255)
cAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.a > 1:2682052/1‑101 (MQ=255)
aaTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.at > 1:2303315/1‑101 (MQ=255)
aaTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.at > 1:8677380/1‑101 (MQ=255)
aTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAGCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCggtgatcggtg.atc < 2:531311/101‑1 (MQ=255)
aTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCggtgatcggtg.atc < 1:698520/101‑1 (MQ=255)
aTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCCGCccgtgatgcgcggtc > 2:2182528/1‑93 (MQ=37)
tttACCCCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa < 2:7943756/101‑1 (MQ=255)
tttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa < 1:3222258/101‑1 (MQ=255)
tACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGc > 1:7982081/1‑101 (MQ=255)
acagCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTACCGGTGATCGGTG.ATCAGCg > 1:7201772/1‑101 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGACACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTc < 1:6482792/101‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTc < 2:5576967/101‑1 (MQ=255)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGc > 2:2301338/1‑101 (MQ=255)
cTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTc < 1:2338585/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTccc > 2:6864927/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcccc < 1:360065/101‑1 (MQ=255)
tCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTccccc < 1:3338308/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcccccc > 1:5281260/1‑101 (MQ=255)
aGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCcg < 1:3837845/101‑1 (MQ=255)
cGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCcgcg > 2:7219900/1‑101 (MQ=255)
gggTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGCTCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCgg > 2:105107/1‑101 (MQ=255)
ggTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCggg > 1:8560211/1‑101 (MQ=255)
ttACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCggggg > 2:1827248/1‑101 (MQ=255)
aCGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCCGCCGGGGATCGGTG.ATCAGCGGGCGCTCCGCCCGCGGGGGCg > 2:8659102/1‑101 (MQ=37)
cGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCgg > 1:2484293/1‑100 (MQ=255)
caacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:4201638/94‑1 (MQ=2)
caacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:4779827/8‑101 (MQ=2)
aCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:7689358/101‑1 (MQ=255)
cGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:5945096/101‑1 (MQ=255)
cGGCAGTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:8115586/101‑1 (MQ=255)
acactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 2:2937835/6‑101 (MQ=2)
acactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:3677504/6‑101 (MQ=2)
ggCAGCCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:943237/101‑1 (MQ=255)
cactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:2827278/97‑1 (MQ=2)
gCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 1:1133560/101‑1 (MQ=255)
cAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGCGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.GTCATCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCgca > 2:9151525/1‑99 (MQ=38)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:1003894/100‑1 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:8305879/1‑101 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:3636892/101‑1 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:759735/1‑101 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:6224802/1‑101 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGGGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:8548885/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 2:4983235/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 2:4702242/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc < 2:8734124/101‑1 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGCAACATcg > 1:5386277/1‑101 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg > 1:3466418/1‑101 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg < 2:543255/101‑1 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg < 2:4041514/101‑1 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCGCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgc > 1:5797535/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgcc > 1:1677805/1‑101 (MQ=255)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCGCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgccg < 1:6642126/101‑1 (MQ=255)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgccg < 1:6881460/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCtt < 2:5820205/101‑1 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCg > 1:2811660/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg < 1:639011/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 2:7858023/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc > 1:2065831/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 2:730642/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 2:9016185/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 1:4256315/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg < 2:1603150/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg < 1:8323856/101‑1 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAgg > 2:6675991/1‑101 (MQ=255)
cGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCt > 1:1938844/1‑101 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg > 1:5106944/1‑101 (MQ=255)
accgcccccGCTGGCCGTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 2:8473692/95‑1 (MQ=255)
tGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc < 2:3458749/101‑1 (MQ=255)
cACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgt < 2:1959414/101‑1 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 2:630624/101‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTc < 2:129209/101‑1 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCt < 1:4094774/101‑1 (MQ=255)
tGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTc < 1:4426694/101‑1 (MQ=255)
tGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGGAACGTGTCGCTc > 2:3216240/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc < 2:7610105/101‑1 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc < 1:5534725/101‑1 (MQ=255)
|
GCACCTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCC > NC_014034/1395307‑1395507
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|