| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,412 | T→C | 3.8% | intergenic (+224/‑707) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,412 | 0 | T→C | 3.8% | 28.3 ‑0.4 ‑0.2 | 477 | intergenic (+224/‑707) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/9): ref base (214/244): total (224/253) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.46e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.00e-01 | ||||||||||
Only 100 of 511 total aligned reads displayed.
TTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCG > NC_014034/1395312‑1395512
|
ttCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCt < 2:2505505/101‑1 (MQ=255)
cGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGc > 1:129209/1‑101 (MQ=255)
gCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGTCCCTgtc > 2:6482542/1‑99 (MQ=255)
gCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGcc < 1:5903012/101‑1 (MQ=255)
accaccGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcgg > 1:9016607/1‑101 (MQ=255)
caccGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtg < 1:2654201/101‑1 (MQ=255)
accGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtga > 2:6363175/1‑101 (MQ=255)
accGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtga < 1:3735278/101‑1 (MQ=255)
ccGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgat < 1:8001517/101‑1 (MQ=255)
cAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.a > 2:1458549/1‑101 (MQ=255)
aTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCggtgatcggtg.atc < 2:201637/101‑1 (MQ=255)
tttACCCCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa < 2:7943756/101‑1 (MQ=255)
tttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa < 1:3222258/101‑1 (MQ=255)
ttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg > 1:8639735/1‑101 (MQ=255)
tACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGc > 1:1821164/1‑101 (MQ=255)
acacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCg < 2:8725353/101‑1 (MQ=255)
acacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCg > 2:3121670/1‑101 (MQ=255)
acacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCg > 1:3637000/1‑101 (MQ=255)
acCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGt < 2:8639349/101‑1 (MQ=255)
acCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGt < 1:194578/101‑1 (MQ=255)
acCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGt < 2:6863594/101‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACTAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCTGTc < 1:8803428/101‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTc < 2:5576967/101‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTc < 1:5072547/101‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCg < 1:1362040/101‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCg > 2:3991143/1‑101 (MQ=255)
cTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.c > 1:3534581/1‑101 (MQ=255)
tGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.cc > 1:643932/1‑101 (MQ=255)
ggTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.ccc > 2:5255980/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.ccccc < 1:3338308/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTTCACCCGCTGGCCCTGCCGGCGATCGGCG.ATCAGCGGCCGCT.cccccc > 2:4619378/1‑101 (MQ=37)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.cccccc > 1:5281260/1‑101 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.cccccc < 1:3785187/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGGCGCT.cccccc > 2:3340431/1‑101 (MQ=255)
aGCGGGTCACGAAGCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCcg < 2:2947388/101‑1 (MQ=255)
gCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCcgc > 1:6125055/1‑101 (MQ=255)
gCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCcgc > 1:3912944/1‑101 (MQ=255)
cGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCcgcg > 2:7219900/1‑101 (MQ=255)
ttACCAACCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCggggg < 1:7245847/101‑1 (MQ=255)
tACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGc < 1:942916/101‑1 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:2712145/1‑101 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:6920203/1‑101 (MQ=255)
caacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:9007872/94‑1 (MQ=2)
caacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:4201638/94‑1 (MQ=2)
caacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:4779827/8‑101 (MQ=2)
cacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 2:2644140/95‑1 (MQ=2)
cGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:5945096/101‑1 (MQ=255)
acactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:4165857/6‑101 (MQ=2)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCCGCGGGGGCGGGGATc > 1:6635171/1‑101 (MQ=255)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 2:2746627/1‑101 (MQ=255)
ggCAGTCGCTCCACCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:2170455/101‑1 (MQ=255)
cactgTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:1724955/97‑1 (MQ=2)
gCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 1:1133560/101‑1 (MQ=255)
cAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGCGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.GTCATCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGGGGATCgca > 2:9151525/1‑99 (MQ=38)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:1003894/100‑1 (MQ=255)
cgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:7653796/100‑1 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:8305879/1‑101 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGAGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:1901025/1‑101 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGGGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:8548885/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 2:4983235/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGAT.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 2:1049363/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc > 1:4360968/1‑101 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGCAACATcg > 1:5386277/1‑101 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg > 2:3856665/1‑101 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg < 2:4041514/101‑1 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg < 2:543255/101‑1 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CGCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgc > 1:5797535/1‑101 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCGCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCt < 1:3463452/101‑1 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCt > 1:7159936/1‑101 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCtt < 2:5820205/101‑1 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCttt < 2:3557753/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTg < 1:1458596/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTg < 2:3653452/101‑1 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCgg > 1:819161/1‑101 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTc < 1:2477371/101‑1 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTc > 1:7920484/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGa > 1:2313833/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 2:2256760/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGCCa > 2:7829844/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa < 1:4050882/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg < 2:808237/101‑1 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAgg > 2:6675991/1‑101 (MQ=255)
cGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCt < 1:6329333/101‑1 (MQ=255)
cGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCt < 1:7616801/101‑1 (MQ=255)
gAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg > 1:8533355/1‑101 (MQ=255)
accgcccccGCTGGCCGTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 2:8473692/95‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 2:1287839/101‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa > 1:4535561/1‑101 (MQ=255)
tGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc < 1:7466785/101‑1 (MQ=255)
gcccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAAATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg < 1:4765459/98‑1 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 2:630624/101‑1 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCg < 2:2844114/101‑1 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGGAACGTGTCggt > 2:6988330/1‑99 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc < 1:2769083/101‑1 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc < 1:5534725/101‑1 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc > 2:731126/1‑101 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccc > 2:7607735/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 1:6822538/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc > 2:1690274/1‑101 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcg < 2:4298233/101‑1 (MQ=255)
|
TTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCG > NC_014034/1395312‑1395512
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 19 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|