| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,427 | A→C | 4.6% | intergenic (+239/‑692) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,427 | 0 | A→C | 4.6% | 38.2 ‑0.4 ‑0.9 | 416 | intergenic (+239/‑692) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/9): ref base (181/216): total (191/225) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.40e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.36e-01 | ||||||||||
Only 100 of 495 total aligned reads displayed.
CAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCG > NC_014034/1395327‑1395527
|
cAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.a > 1:2682052/1‑101 (MQ=255)
aTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCggtgatcggtg.atc < 2:8490231/101‑1 (MQ=255)
tttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa < 1:3222258/101‑1 (MQ=255)
tACGCCGTCTGGTCAGCGGTTTACGAAACGGCAGTCGCT.CCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCg < 2:4717352/101‑1 (MQ=255)
acacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCCGCg > 2:1228013/1‑101 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTc < 1:5338580/101‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCg > 1:5466224/1‑101 (MQ=255)
cGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCg > 2:3991143/1‑101 (MQ=255)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGc > 2:2301338/1‑101 (MQ=255)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGc > 2:6329093/1‑101 (MQ=255)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGCTGATCGGTC.ATCAGCGGTCGc > 1:9157702/1‑101 (MQ=255)
tCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCt < 1:5852593/101‑1 (MQ=255)
cTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.c > 1:3534581/1‑101 (MQ=255)
ggTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.ccc > 2:6435837/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.ccccc < 1:8737775/101‑1 (MQ=255)
tCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.ccccc < 1:3338308/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCCCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.cccccc < 1:6259024/101‑1 (MQ=255)
aGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGACGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCcg > 2:6752789/1‑101 (MQ=255)
cGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCcgcg > 2:7219900/1‑101 (MQ=255)
gggTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCgg > 2:1897394/1‑101 (MQ=255)
ggTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCCCggg > 2:1003876/1‑101 (MQ=255)
ttACCAACCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCggggg < 1:7245847/101‑1 (MQ=255)
aCGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCg > 1:4543762/1‑101 (MQ=255)
cGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCgg > 1:2484293/1‑100 (MQ=255)
cGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGt < 1:5256164/101‑1 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:3730622/1‑101 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTg > 2:2749534/1‑101 (MQ=255)
aaaCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTgg < 1:2301705/101‑1 (MQ=255)
caacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:2335757/94‑1 (MQ=2)
aacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:840602/95‑1 (MQ=2)
cGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:4546118/101‑1 (MQ=255)
acactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:4165857/6‑101 (MQ=2)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCCGCGGGGGCGGGGATc > 1:6635171/1‑101 (MQ=255)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:6068716/101‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:8897295/101‑1 (MQ=255)
actgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:1753588/4‑101 (MQ=2)
cAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:2671168/1‑101 (MQ=255)
cAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:1439744/101‑1 (MQ=255)
cAGGCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAGCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:1253117/101‑1 (MQ=255)
tgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAct > 1:7922964/2‑100 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:1003894/100‑1 (MQ=255)
cgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:7653796/100‑1 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:8305879/1‑101 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:1972707/1‑101 (MQ=255)
gTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:3609760/101‑1 (MQ=255)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 2:615895/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAAAt > 2:5409298/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc < 1:6811177/101‑1 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc > 1:4360968/1‑101 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg < 2:4041514/101‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgcc > 1:2112046/1‑101 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCGCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCt < 1:3463452/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCtt < 2:33943/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCtt < 1:6470486/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTg < 2:3653452/101‑1 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTgg > 2:8582892/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTgg > 2:7910811/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGc > 1:5773559/1‑101 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCg > 1:2811660/1‑101 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCg > 1:8041306/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAATCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt < 2:8857589/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg > 2:5076557/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg < 1:716685/101‑1 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGa > 2:8675819/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 2:9016185/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc > 2:6923081/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa < 2:5523758/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGCCa > 2:7829844/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa < 1:4050882/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg < 2:808237/101‑1 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAgg > 1:7468508/1‑101 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAgg > 2:6675991/1‑101 (MQ=255)
tCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGc > 1:6917677/1‑101 (MQ=255)
cGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCt < 1:7619676/101‑1 (MQ=255)
gAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg < 2:3573567/101‑1 (MQ=255)
gAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg > 2:2899299/1‑101 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg < 1:11225/101‑1 (MQ=255)
aaCTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGt < 2:5834004/101‑1 (MQ=255)
aaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGt > 1:1868266/1‑101 (MQ=255)
gcccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAAATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg < 1:4765459/98‑1 (MQ=255)
cccccGCTGGCCCCTCCGGTGATCGGTT.ATCCCGGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgt < 2:4255005/99‑1 (MQ=25)
aCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtg > 1:1363506/1‑101 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTGACGCGTCGc > 1:8576059/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc < 2:7610105/101‑1 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc < 1:6354617/101‑1 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc > 2:731126/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 2:3008291/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 1:3868328/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc > 2:1690274/1‑101 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcg > 1:1565879/1‑101 (MQ=255)
gCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgc > 1:4013788/1‑101 (MQ=255)
gCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgc > 1:705083/1‑101 (MQ=255)
tcggtg.atcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt > 2:2182117/1‑101 (MQ=255)
cggtg.atcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:5092919/1‑101 (MQ=255)
gtg.atcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACTTGTCGCTTCCCCCGCGGGGGCGTggg > 2:3777962/1‑100 (MQ=255)
gtg.atcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 2:5773324/101‑1 (MQ=255)
gtg.atcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 2:9163434/1‑101 (MQ=255)
g.atcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:49035/101‑1 (MQ=255)
g.atcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:3152809/1‑101 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:2746709/101‑1 (MQ=255)
|
CAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCG > NC_014034/1395327‑1395527
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 28 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|