| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,430 | A→C | 4.1% | intergenic (+242/‑689) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,430 | 0 | A→C | 4.1% | 35.4 ‑0.4 ‑0.1 | 458 | intergenic (+242/‑689) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/9): ref base (204/235): total (214/244) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.44e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.73e-01 | ||||||||||
Only 100 of 488 total aligned reads displayed.
TTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAA > NC_014034/1395330‑1395530
|
tttACCCCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCa < 2:7943756/101‑1 (MQ=255)
tttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCa > 1:8738539/1‑101 (MQ=255)
tACGCCGTCTGGTCAGCGGTTTACGAAACGGCAGTCGCT.CCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCg < 2:4717352/101‑1 (MQ=255)
tACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGc > 1:1821164/1‑101 (MQ=255)
acacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCCGCg > 2:1228013/1‑101 (MQ=255)
acacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCg > 1:3637000/1‑101 (MQ=255)
acCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGt < 1:194578/101‑1 (MQ=255)
acCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGt < 2:6863594/101‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTc > 1:1698460/1‑101 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTc < 1:5338580/101‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCg < 1:1362040/101‑1 (MQ=255)
cGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCg > 1:5466224/1‑101 (MQ=255)
cGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCg > 2:3991143/1‑101 (MQ=255)
cGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCg < 2:3123404/101‑1 (MQ=255)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGCTGATCGGTCATCAGCGGTCGc > 1:9157702/1‑101 (MQ=255)
tCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCt < 1:5852593/101‑1 (MQ=255)
cTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.c > 1:80889/1‑101 (MQ=255)
tGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.cc < 2:7260669/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.ccc < 1:6248460/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.ccaccc < 1:3277256/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGGCGCT.cccccc > 2:3340431/1‑101 (MQ=255)
aGCGGGTCACGAAGCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCcg < 2:2947388/101‑1 (MQ=255)
ggTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCCCggg > 2:1003876/1‑101 (MQ=255)
ttACCAACCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCggggg < 1:7245847/101‑1 (MQ=255)
tACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGc > 1:265352/1‑101 (MQ=255)
aCGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCg > 1:4543762/1‑101 (MQ=255)
cGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGt < 1:5256164/101‑1 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:2712145/1‑101 (MQ=255)
aaCGGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 2:2681970/101‑1 (MQ=255)
aCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGAt > 1:3436474/1‑101 (MQ=255)
aCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:7689358/101‑1 (MQ=255)
cGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:4546118/101‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCCGCGGGGGCGGGGATc > 1:6635171/1‑101 (MQ=255)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:8897295/101‑1 (MQ=255)
cAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:1439744/101‑1 (MQ=255)
cAGGCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAGCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:1253117/101‑1 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:1003894/100‑1 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:1813510/1‑101 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:8445777/1‑101 (MQ=255)
gccGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 2:3768855/99‑1 (MQ=255)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 2:615895/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 1:4454001/101‑1 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAAAt > 2:5409298/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc < 1:6811177/101‑1 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg > 1:3466418/1‑101 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg < 2:4041514/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCtt < 1:7645038/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCtt < 1:6470486/101‑1 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCttt < 2:3557753/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTg < 1:1458596/101‑1 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTgg > 2:8582892/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTgg > 2:2515714/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGc > 1:5773559/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGc > 2:847638/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGc < 1:3883890/101‑1 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCg > 1:2399311/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAATCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt < 2:8857589/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg > 2:5076557/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg > 2:207302/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg < 1:716685/101‑1 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGa > 1:2313833/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGa > 2:8675819/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 2:7858023/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 2:2256760/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 2:9016185/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa < 2:5523758/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa > 2:6348823/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa > 2:6487851/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa > 1:376701/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg < 2:808237/101‑1 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAgg > 1:7468508/1‑101 (MQ=255)
tCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGc > 1:6917677/1‑101 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg < 1:11225/101‑1 (MQ=255)
aaCTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGt < 2:5834004/101‑1 (MQ=255)
gcccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAAATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg < 1:4765459/98‑1 (MQ=255)
cccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgt < 2:1904181/99‑1 (MQ=255)
cccccGCTGGCCCCTCCGGTGATCGGTTATCCCGGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgt < 2:4255005/99‑1 (MQ=25)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCCGGGAACgggtg > 1:4270898/1‑100 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCg < 2:2844114/101‑1 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc > 1:4045051/1‑101 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGGAACGTGTCggt > 2:6988330/1‑99 (MQ=255)
tGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTc > 1:3557764/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc < 1:2769083/101‑1 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc < 2:7610105/101‑1 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc > 2:731126/1‑101 (MQ=255)
cgCCGGTGATCAGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcg < 2:3645174/100‑1 (MQ=255)
gCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgc > 1:705083/1‑101 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 1:4120957/1‑101 (MQ=255)
cggtgatcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:5092919/1‑101 (MQ=255)
gtgatcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 2:9163434/1‑101 (MQ=255)
gtgatcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 2:5773324/101‑1 (MQ=255)
tgatcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt > 1:217175/1‑101 (MQ=255)
gatcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:6036381/1‑101 (MQ=255)
gatcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:49035/101‑1 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 2:6713361/1‑101 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 1:6333596/1‑101 (MQ=255)
tcAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 1:3119142/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:8247507/1‑101 (MQ=255)
cAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 1:8601297/1‑101 (MQ=255)
aGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:7978424/1‑101 (MQ=255)
|
TTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCT.CCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAA > NC_014034/1395330‑1395530
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|