Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,395,477 | G→T | 18.5% | intergenic (+289/‑642) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,395,477 | 0 | G→T | 18.5% | 251.2 ‑0.7 0.0 | 496 | intergenic (+289/‑642) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (42/50): ref base (201/203): total (243/253) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.90e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 518 total aligned reads displayed.
GCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCC > NC_014034/1395377‑1395577
|
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTg < 2:8128363/101‑1 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTgg > 2:8582892/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTgg > 2:7910811/1‑101 (MQ=255)
gggggGGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGc < 1:2327255/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGc < 1:2749616/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGc > 1:5773559/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCgg > 1:819161/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACNGCACCCGCNGGCNCTGNCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCg < 1:3285208/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGAc < 2:7858023/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGAc < 1:4256315/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGAc < 2:2256760/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGAc > 1:8891807/1‑101 (MQ=255)
gggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGAc < 1:802163/100‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACa < 2:7288596/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACa > 1:376701/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAg < 2:4066409/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAg < 1:8323856/101‑1 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAgg > 2:6675991/1‑101 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTgg > 1:5106944/1‑101 (MQ=255)
aaCTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGt < 2:5834004/101‑1 (MQ=255)
aaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGt > 1:910822/1‑101 (MQ=255)
accgcccccGCTGGCCGTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 2:8473692/95‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTa > 1:4535561/1‑101 (MQ=255)
cTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa < 1:3965134/101‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTTATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGTAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 1:6525000/1‑101 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg < 2:3694929/101‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 1:5282248/1‑101 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg < 1:1221939/101‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGGAACg > 2:4818934/1‑101 (MQ=255)
ccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtg < 1:6321692/100‑1 (MQ=255)
aCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtg > 2:5122251/1‑101 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 2:630624/101‑1 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 1:2484454/101‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTc < 1:1006881/101‑1 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc > 1:4045051/1‑101 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc < 2:3264334/101‑1 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc > 1:3496777/1‑101 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccc > 2:7607735/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 2:3008291/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc > 2:1690274/1‑101 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcg > 1:1565879/1‑101 (MQ=255)
cgCCGGTGATCAGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcg < 2:3645174/100‑1 (MQ=255)
gCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgc > 1:2667378/1‑101 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg < 2:9157280/101‑1 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg > 1:2862823/1‑101 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:2027817/101‑1 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 1:4120957/1‑101 (MQ=255)
atcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg > 1:7727501/1‑101 (MQ=255)
ggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 2:4610049/101‑1 (MQ=255)
cgctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGTGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:7897654/91‑1 (MQ=2)
gtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 2:5773324/101‑1 (MQ=255)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:7220204/101‑1 (MQ=255)
ggatcAGCGGTCGCGCCCCGCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:7387187/100‑1 (MQ=255)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:5335307/9‑101 (MQ=0)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATc > 1:2105526/9‑101 (MQ=2)
tggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 2:275063/8‑101 (MQ=2)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:6036381/1‑101 (MQ=255)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:4587074/7‑101 (MQ=2)
gacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:1324150/96‑1 (MQ=2)
aGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:7978424/1‑101 (MQ=255)
aGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:6923366/101‑1 (MQ=255)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGGTGGAAGCa > 2:4265272/3‑101 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 2:184960/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 2:3966104/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGCTCGAAACAt > 2:8976857/1‑101 (MQ=255)
gTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgct < 2:1044225/101‑1 (MQ=2)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctt < 2:1425766/101‑2 (MQ=2)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtct < 1:9186831/101‑1 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 1:1813563/101‑1 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 2:6916261/1‑101 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca > 2:6072326/1‑97 (MQ=2)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 2:5465576/101‑5 (MQ=2)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCggg > 2:9056260/1‑100 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGt < 2:8738134/101‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTg < 1:6195585/101‑1 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaatgg < 1:484645/101‑9 (MQ=2)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCg < 2:7764576/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACACCCCGGACCTGTCGGCGG.CGA.ACACCGATACCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtcgatgatcaa < 1:6389223/101‑10 (MQ=0)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGGGCCGTCg > 2:161489/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGc > 1:3019490/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCt > 1:8665399/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCg > 1:7569269/1‑101 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTc > 1:3567291/1‑101 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTc > 1:4414197/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTcc < 2:3466314/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCCGCGCTCGTcc > 1:4945909/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa < 2:7411876/101‑1 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa > 2:8798040/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa > 1:548174/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAg > 1:6809802/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGc < 1:1329052/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGcc < 1:8583277/101‑1 (MQ=255)
cGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGc > 2:4970901/1‑101 (MQ=255)
gAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGGCGCTCGTCCACTCGGcc > 2:2322229/1‑101 (MQ=255)
cATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCt < 1:221034/101‑1 (MQ=255)
cgccg..cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgt < 1:5878758/101‑1 (MQ=255)
gccg..cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgtc > 1:138237/1‑101 (MQ=255)
gccg..cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgtc < 2:643922/101‑1 (MQ=255)
t.ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTGGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcc > 1:6572113/1‑101 (MQ=255)
tGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcccc > 2:7183367/1‑101 (MQ=255)
|
GCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCC > NC_014034/1395377‑1395577
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 28 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|