| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,478 | G→C | 18.3% | intergenic (+290/‑641) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,478 | 0 | G→C | 18.3% | 227.5 ‑0.6 ‑0.0 | 496 | intergenic (+290/‑641) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (42/49): ref base (201/204): total (243/253) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.64e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.96e-01 | ||||||||||
Only 100 of 515 total aligned reads displayed.
CGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCC > NC_014034/1395378‑1395578
|
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTgg < 2:8119307/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGc > 1:5773559/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCgg > 1:819161/1‑101 (MQ=255)
gggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGAc < 1:802163/100‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGCCa > 2:7829844/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACa > 1:376701/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAg < 2:4066409/101‑1 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAgg > 2:6675991/1‑101 (MQ=255)
gAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTg > 2:2899299/1‑101 (MQ=255)
gAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTg > 1:8533355/1‑101 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTgg < 1:2384678/101‑1 (MQ=255)
aaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGt < 1:6777684/101‑1 (MQ=255)
accgcccccGCTGGCCGTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 2:8473692/95‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTa > 1:4535561/1‑101 (MQ=255)
cTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa < 1:3965134/101‑1 (MQ=255)
cTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa < 1:863149/101‑1 (MQ=255)
tGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc < 2:3458749/101‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTTATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGTAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 1:6525000/1‑101 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 1:3497587/1‑101 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg < 2:3694929/101‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg < 1:1221939/101‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 1:5282248/1‑101 (MQ=255)
cACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGGAACgt > 1:4129292/1‑101 (MQ=255)
ccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtg < 1:6321692/100‑1 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 2:630624/101‑1 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 1:18147/101‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTc < 2:129209/101‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTc < 1:1006881/101‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCCGGGAACgggtg > 1:4270898/1‑100 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc > 1:4045051/1‑101 (MQ=255)
tGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTc < 1:4426694/101‑1 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccc > 2:7607735/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 2:1821111/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 2:8602628/101‑1 (MQ=255)
cggtgatcggtgatCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGTgg > 2:58239/1‑101 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg > 1:2862823/1‑101 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg < 2:9157280/101‑1 (MQ=255)
atcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg > 1:7727501/1‑101 (MQ=255)
tcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt > 2:2182117/1‑101 (MQ=255)
ggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 2:4610049/101‑1 (MQ=255)
ggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 2:4823053/1‑101 (MQ=255)
cgctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 2:5002965/11‑101 (MQ=2)
gtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 2:5773324/101‑1 (MQ=255)
gctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:902569/92‑1 (MQ=2)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:7220204/101‑1 (MQ=255)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:2671251/101‑1 (MQ=255)
ggatcAGCGGTCGCGCCCCGCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:7387187/100‑1 (MQ=255)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:5335307/9‑101 (MQ=0)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATc > 1:2105526/9‑101 (MQ=2)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:6036381/1‑101 (MQ=255)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:4587074/7‑101 (MQ=2)
gcgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:1596254/97‑1 (MQ=2)
aGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:6923366/101‑1 (MQ=255)
aGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:7278805/1‑101 (MQ=255)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGGTGGAAGCa > 2:4265272/3‑101 (MQ=2)
cGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 2:7699325/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACagc < 1:3293409/101‑3 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACagc > 2:7906430/1‑99 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 2:3966104/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGCTCGAAACAt > 2:8976857/1‑101 (MQ=255)
gTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtc < 1:1593071/101‑1 (MQ=255)
gcGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtct < 1:2671250/100‑1 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt > 2:1667243/1‑99 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 2:5466039/101‑1 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca > 2:6072326/1‑97 (MQ=2)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCgg < 2:3220184/101‑1 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCggg > 2:9056260/1‑100 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGt < 2:8738134/101‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTg < 1:6195585/101‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTg > 2:6793337/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTg < 2:1378752/101‑1 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG..GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaatgg < 1:484645/101‑9 (MQ=2)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGcc < 2:2313766/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCGGt < 1:9169591/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACACCCCGGACCTGTCGGCGG.CGA.ACACCGATACCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtcgatgatcaa < 1:6389223/101‑10 (MQ=0)
cgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGc > 1:3019490/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCt > 1:2253455/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCt > 1:2490001/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCg > 1:7569269/1‑101 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTc < 1:8314668/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTcc < 1:5122420/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCCGCGCTCGTcc > 1:4945909/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa < 2:7411876/101‑1 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa > 1:548174/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa > 2:8798040/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATAGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa > 1:7962610/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGc < 1:1329052/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCCCTCGTCCCGc > 1:873700/1‑101 (MQ=255)
cGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGc < 2:5161117/101‑1 (MQ=255)
gAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGcc > 2:1012674/1‑101 (MQ=255)
cATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGcc > 2:2022417/1‑100 (MQ=255)
tCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcg < 2:705073/101‑1 (MQ=255)
cgccg..cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgt > 1:358467/1‑101 (MQ=255)
cgccg..cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgt < 1:5878758/101‑1 (MQ=255)
gccg..cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgtc > 1:138237/1‑101 (MQ=255)
gccg..cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgtc < 2:643922/101‑1 (MQ=255)
t.ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTGGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcc > 1:6572113/1‑101 (MQ=255)
t.ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcc > 2:3634490/1‑101 (MQ=255)
ggCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTccccc < 1:7871644/101‑1 (MQ=255)
gCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcccccc < 1:2797691/101‑1 (MQ=255)
|
CGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG..CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCC > NC_014034/1395378‑1395578
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|