BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,000	C→G	3.6%	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,000	0	C→G	3.6%	107.0 ‑0.2 ‑0.0	2060	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (40/42): ref base (1000/977): total (1041/1019)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.22e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.82e-01

Only 100 of 4043 total aligned reads displayed.


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100


tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                                                                                                      <  1:8752304‑M1/45‑1 (MQ=255)


ggggagcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                                      >  1:3525420‑M1/57‑101 (MQ=255)


 ggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                                                     <  1:5542199‑M1/46‑1 (MQ=255)


 gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcg                                                                                                     <  1:7813016‑M1/46‑1 (MQ=255)


    gtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                                                  <  1:1608680‑M1/49‑1 (MQ=255)


      ccggcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                                >  1:177057‑M1/51‑101 (MQ=255)


       cGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                               <  2:1317708/101‑1 (MQ=255)


          cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTgg                                                                                            <  2:6970844‑M1/55‑1 (MQ=255)


           gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                                                           <  1:2275155‑M1/56‑1 (MQ=255)


             gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGgac                                                                                         <  1:1138735‑M1/58‑2 (MQ=255)


               ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                       <  1:5888333‑M1/60‑1 (MQ=255)


                 gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                     >  1:6858928‑M1/40‑101 (MQ=255)


                 gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGgatcgag                                                                                     <  1:1310408‑M1/62‑3 (MQ=255)


                   gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                   <  1:282008‑M1/64‑1 (MQ=255)


                   gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                   <  2:5137975‑M1/64‑1 (MQ=255)


                       tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                               >  2:8198508‑M1/34‑101 (MQ=255)


                       tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggatcggtcggatc                                                                               >  1:3053632‑M1/34‑98 (MQ=255)


                          gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                            >  1:7277430‑M1/31‑101 (MQ=255)


                            ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                          >  2:203404/1‑99 (MQ=255)


                               gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                       >  1:5223374‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                      >  1:6228992‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                 ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                     >  1:2120434‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                 ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                     >  1:6697488‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                  cgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                    >  1:3980008‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                   gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                   <  2:7717001‑M1/80‑1 (MQ=255)


                                   gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                   <  2:7524439/101‑1 (MQ=255)


                                      ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                <  1:7140994‑M1/83‑1 (MQ=255)


                                      ggatcggtcgggtccgtgGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                >  2:5325282‑M1/19‑101 (MQ=255)


                                       gatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGa                                                               <  1:5021931‑M1/84‑1 (MQ=255)


                                          cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                            <  2:2457090‑M1/87‑1 (MQ=255)


                                          cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                            <  1:1459990‑M1/87‑1 (MQ=255)


                                            gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                          >  2:3192336/1‑101 (MQ=11)


                                             gcgtatccgtcggATCCGTCGGTTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                         <  2:1162454/93‑1 (MQ=11)


                                               gggtcgggcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg                                                       <  1:1000386/98‑1 (MQ=11)


                                               ggCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                       <  1:319546‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                      <  2:4506346/93‑1 (MQ=11)


                                                 gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                     >  2:5630284‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                                   ccgggggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                   <  2:6541056/96‑1 (MQ=11)


                                                     gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAgcggg                                                 >  1:7485141/4‑100 (MQ=11)


                                                     gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcggg                                                 >  2:8678673/1‑100 (MQ=14)


                                                      tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTgggggccgtc                                                >  1:33504/3‑94 (MQ=11)


                                                      tgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                <  2:4024489/99‑1 (MQ=11)


                                                      tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                >  1:8283256‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                      gcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtc                                                <  2:2623666/100‑1 (MQ=14)


                                                       ggtgacggtggggtgcggggaataggtcgtggcagtgggatCGGTCGGGTCCGTGGCATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                               <  1:5377250/96‑1 (MQ=2)


                                                       gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGGCGGGCGGCTGCGTGGGGtccgcgg                                               >  2:9031657/2‑96 (MQ=11)


                                                       gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGAtcggtag                                               >  2:7871981/2‑99 (MQ=11)


                                                        ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                              >  2:8517297/1‑101 (MQ=11)


                                                         gctccggcgggtccgtgggatccgtccggtccgttgggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                             <  2:1004737/94‑1 (MQ=11)


                                                          gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                            <  2:2808404/100‑3 (MQ=14)


                                                          gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                            <  1:3824268/100‑3 (MQ=14)


                                                          gtccgtcggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCgggc                                            >  1:8153725/5‑100 (MQ=11)


                                                          atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGGGGGGACCGTGGGATCGGTCGTGGCCGTCGGATCGGTGgggg                                            >  2:5498876/1‑100 (MQ=11)


                                                           tcggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatc                                           >  2:8828219‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                                           tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTc                                           <  1:4731913/101‑1 (MQ=11)


                                                            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGGGGGTCGGGCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATcg                                          >  2:2298343/1‑100 (MQ=14)


                                                            ccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                          <  2:3549206/99‑1 (MQ=14)


                                                             ggtcggttccgtgggaacggtcgtgtccgtggaatcGGTCTGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                         <  2:3362368/101‑1 (MQ=11)


                                                             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTAGGGTcag                                         >  2:8058766/1‑99 (MQ=14)


                                                              gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCga                                        >  2:7124888/7‑100 (MQ=11)


                                                              gtcggggccgtggggtccgtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                        <  1:5650767/101‑1 (MQ=11)


                                                              gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg                                        >  1:7654979/1‑100 (MQ=11)


                                                               tcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                       <  1:8616155/101‑2 (MQ=14)


                                                                cgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCGGtgg                                      >  2:8343186/1‑99 (MQ=11)


                                                                cgggtccggggggtcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                      <  1:4291193/101‑3 (MQ=14)


                                                                cggatccgtgggatgagtcgcgtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                      <  2:6197441/101‑3 (MQ=11)


                                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                     >  1:8430408‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                                 ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                     <  2:3053533‑M2/101‑4 (MQ=255)


                                                                  ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCggggga                                    >  2:7278476/1‑96 (MQ=14)


                                                                  gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCCGTCGGGACCGTGGGa                                    >  1:3677461/3‑101 (MQ=14)


                                                                  gatccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa                                    <  2:4187859/99‑1 (MQ=14)


                                                                   gtccgtgggttcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                   >  2:4362415‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                                   gtccgtggggtcggtcgggtccgtaggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                   <  1:6544316/101‑1 (MQ=11)


                                                                   gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                   <  2:5974267‑M2/101‑6 (MQ=255)


                                                                    tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                  <  2:2170436‑M2/101‑7 (MQ=255)


                                                                     ccgtgggctcgggcgggtccgtggggtgcgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                 <  1:8949092/101‑1 (MQ=14)


                                                                     ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcg                                 >  1:8019686/1‑101 (MQ=14)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                               <  1:4849888‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcggggccgg                               <  2:1665780‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGggcacggc                               >  2:5818661/1‑95 (MQ=11)


                                                                       gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                               >  1:9116243/1‑101 (MQ=11)


                                                                        tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgggc                              <  1:6410844‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                                        tgggatcggcgggatccgtggggtcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                              <  1:4590531/101‑1 (MQ=11)


                                                                         gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                             <  2:3865186‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                                          ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                            <  1:194122‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                             gcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatc                         <  1:4448923/100‑1 (MQ=11)


                                                                              cggtcgggtccgtggtagcggccgtGTCCGTGGGATCGGTCGGGAGCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGGCCCGTCCGATCCGTGGGATCGgtcggatcc                        <  2:3696847/101‑1 (MQ=2)


                                                                              cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatcc                        >  1:261796‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                                gtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                      <  1:6059929/101‑1 (MQ=11)


                                                                                gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                      >  2:1506599‑M2/1‑83 (MQ=255)


                                                                                   ggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGCGGGATCGggcgggtccgtgcg                   >  2:467311/4‑98 (MQ=11)


                                                                                    ggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTGGGCNCGgtcgggtgcngggnn                  >  2:668706/1‑93 (MQ=11)


                                                                                      tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                <  2:4773077‑M2/101‑42 (MQ=255)


                                                                                        cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgggggatcgg              >  1:6978756/1‑92 (MQ=11)


                                                                                           ggggtccgtgggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTgg           <  2:1830817/101‑1 (MQ=14)


                                                                                            ggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTggg          >  2:4911734/1‑101 (MQ=14)


                                                                                              atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt        >  2:6391433/1‑101 (MQ=14)


                                                                                                 ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg     <  1:243592‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                                                                                    cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcg  <  2:6850457‑M2/101‑56 (MQ=255)


                                                                                                    cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtgg  >  1:4124743/1‑99 (MQ=11)


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 17 ≤


ATCG

< 24 ≤


ATCG

< 32 ≤


ATCG

< 41 ≤


ATCG