BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,015	G→C	4.4%	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,015	0	G→C	4.4%	243.2 ‑3.5 0.0	3588	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (70/107): ref base (1635/1773): total (1706/1882)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.06e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 4271 total aligned reads displayed.


CGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221915‑222115


ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                      <  2:6059692‑M1/60‑1 (MQ=255)


  gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                    >  1:1326187‑M1/40‑101 (MQ=255)


    gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                  >  2:7528174‑M1/38‑101 (MQ=255)


    gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                  <  1:3928875‑M1/64‑1 (MQ=255)


     ggattggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                 >  1:7123351‑M1/37‑101 (MQ=255)


     ggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                 <  1:3765508‑M1/65‑1 (MQ=255)


       gtcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                               >  1:5214174‑M1/35‑101 (MQ=255)


        tccgatctgtgCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                              <  1:9099108/91‑1 (MQ=11)


         cggtctggtccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             >  2:8671290‑M1/33‑101 (MQ=255)


         ccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             >  2:6862854‑M1/33‑101 (MQ=255)


         cGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             >  2:1175358/1‑101 (MQ=255)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                            <  2:6228753‑M1/70‑1 (MQ=255)


          ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCg                                                                                            <  2:3729100‑M1/70‑1 (MQ=255)


            cGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                          >  2:3062752/1‑101 (MQ=255)


              ggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                        <  2:3212684‑M1/74‑1 (MQ=255)


                gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGCGGgac                                                                                      <  1:1974241‑M1/76‑2 (MQ=255)


                 tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                     >  1:3158350‑M1/25‑101 (MQ=255)


                  ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                    >  1:3452243‑M1/24‑101 (MQ=255)


                   cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                   >  1:1774574‑M1/23‑101 (MQ=255)


                   cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                   >  1:6205123‑M1/23‑101 (MQ=255)


                   cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                   >  1:4422845‑M1/23‑101 (MQ=255)


                   cgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcgg                                                                                   <  1:583573‑M1/79‑1 (MQ=255)


                    gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                  <  1:8581828‑M1/80‑1 (MQ=255)


                    gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                  <  1:1137202‑M1/80‑1 (MQ=255)


                     tCGGATGCGTGGGCTCGGCCGGATCTGTCGGGTCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                 >  1:7474815/1‑101 (MQ=18)


                     ggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                 >  1:6394995‑M1/21‑101 (MQ=255)


                         gtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAt                                                                             >  1:7989024‑M1/17‑101 (MQ=255)


                            ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                          <  1:5630491‑M1/88‑1 (MQ=255)


                            ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGtgggatcggtcggggccg                                                                          <  2:3903914‑M1/88‑6 (MQ=255)


                             gtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                         <  1:8921694‑M1/89‑1 (MQ=255)


                               cggttccgtcggATCCGTCGGGGCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGCTCGGGTCCGTgg                                                                       <  2:6690186/94‑1 (MQ=11)


                                gggtcgggcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg                                                                      <  1:1000386/98‑1 (MQ=11)


                                 gCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                     >  1:6846417/1‑101 (MQ=255)


                                  gtcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                    <  2:5844809/100‑1 (MQ=11)


                                  gtccggcggATCCGTTGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                    <  2:2177673/95‑1 (MQ=11)


                                  gtaaggggggtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                    <  1:7799544/91‑1 (MQ=11)


                                   tccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                   >  1:8740559‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                    cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                  <  2:6545620/101‑1 (MQ=255)


                                      gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggc                                                                >  2:7146538/4‑100 (MQ=11)


                                       tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                               <  1:482955/99‑1 (MQ=11)


                                       tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                               <  2:2034909‑M1/99‑1 (MQ=255)


                                        gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAccggtcg                                                              <  1:1620242‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                        cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggccg                                                              >  1:4263292/1‑101 (MQ=11)


                                          gctccggcgggtccgtgggatccgtccggtccgttgggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                                            <  2:1004737/94‑1 (MQ=11)


                                            tccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtcggatc                                                          >  2:8486090‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                             cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATGGGTCGGGTcg                                                         >  2:9031388/1‑100 (MQ=11)


                                             cggtcggatccgggggatcggtcggagccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         <  2:7297651/101‑1 (MQ=11)


                                             cgggcggcttcgggggatcggtcggttccgcgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                         <  1:2295650/101‑1 (MQ=11)


                                             cggcgcgttccgtcggatccgtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         <  2:5207546/93‑1 (MQ=11)


                                             ccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTcc                                                         >  1:8412602/3‑101 (MQ=11)


                                              ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTAGGGTcag                                                        >  2:8058766/1‑99 (MQ=14)


                                               gtcggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                       >  2:7709590/1‑101 (MQ=11)


                                               gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg                                                       >  1:7654979/1‑100 (MQ=11)


                                               gtcggatccgtgagatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGCGGGATCGGTCGGGTCCgg                                                       >  1:6533278/1‑100 (MQ=11)


                                                tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                      >  1:550991/1‑100 (MQ=11)


                                                 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTTGGATCGGTGGGGtccgtgggagggggcg                                                     >  2:5647538/1‑93 (MQ=11)


                                                 cgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCGGtgg                                                     >  2:8343186/1‑99 (MQ=11)


                                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGTCGGGCGGGTCCGGGGGGTCGGGCGGGTCCggggg                                                    >  2:4221166/1‑97 (MQ=11)


                                                  ggcgccgtggggtccgtcggctccgtcggatcggtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                    <  2:4395934/97‑1 (MQ=11)


                                                   ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGTCGGTCtggggcgtgggc                                                   >  2:2319968/1‑92 (MQ=11)


                                                   ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcggg                                                   <  2:4712279‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                   gagccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgggcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa                                                   <  2:5350304/98‑1 (MQ=11)


                                                    gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                                  >  1:8145899‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                     tccgtggggtcggtcggggccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                 <  1:3261904/101‑1 (MQ=11)


                                                     tccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                 <  2:3411969/101‑1 (MQ=11)


                                                      ccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGtcg                                                >  2:406264/1‑101 (MQ=11)


                                                        gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtgggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGtcggc                                              >  2:7861616/1‑100 (MQ=11)


                                                             atccgtgggatcggtcgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                                         <  1:2620791/101‑1 (MQ=14)


                                                               cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                       >  1:727144‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                 gtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgg                                     >  2:4973522/1‑100 (MQ=11)


                                                                    gggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                                  <  1:300062‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                    gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                                  <  1:1471977‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                    gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                  >  2:1682376/1‑101 (MQ=11)


                                                                    gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                  >  1:4100955/1‑101 (MQ=11)


                                                                    ggatccgtgggatgggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGCCCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtcggatccgtggg                                  <  2:8811401/98‑1 (MQ=11)


                                                                     gatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                                 <  2:3585318/99‑1 (MQ=11)


                                                                      gtccgtggggtccgtcggCTGCGTGGGATCCGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggt                                <  2:264480/101‑1 (MQ=11)


                                                                      gtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggat                                <  2:1847765‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                                                      atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                                <  2:1533348/100‑3 (MQ=255)


                                                                       tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggataggtcgggtccgtgggatg                               <  2:2475639‑M2/101‑25 (MQ=255)


                                                                          gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtggggtccgtcgggtccgg                            >  2:6991795/4‑100 (MQ=11)


                                                                           tgggatcggtcggGTCCGTGGGCTCGGTCGCGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc                           <  2:6410595/101‑2 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgg                          >  1:471548/1‑101 (MQ=11)


                                                                            aggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTgg                          >  1:2139080/2‑101 (MQ=14)


                                                                             ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTcgg                         <  1:3627553/101‑1 (MQ=11)


                                                                               atcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                       <  2:8193489‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                                                                cccgtcggATCCGCGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtc                      <  2:2824546/98‑1 (MQ=11)


                                                                                 gggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                     >  1:2455537‑M2/2‑67 (MQ=255)


                                                                                 cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                     <  1:5355556/101‑1 (MQ=14)


                                                                                   gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                   >  1:6013747/1‑101 (MQ=14)


                                                                                   gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgt                   <  1:4571575‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                                                   gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgt                   <  1:6682464‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                                                   gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgg                   >  2:4531828/1‑98 (MQ=11)


                                                                                    tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                  <  1:5000737‑M2/101‑38 (MQ=255)


                                                                                        gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggat              >  1:8269099‑M2/2‑60 (MQ=255)


                                                                                         tCCGTGTGACCCGTCTGGTCTGTGGGATGGGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATc             <  2:1331525/101‑1 (MQ=11)


                                                                                         tCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc             >  1:6966258‑M2/1‑59 (MQ=255)


                                                                                            gTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt          <  2:5535037‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                               ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg       <  1:2793676/101‑1 (MQ=14)


                                                                                                  tcggtcggGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc    <  2:4803868/101‑1 (MQ=255)


CGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221915‑222115

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG