Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA NC_014034 222,027 G→C 9.6% P210P (CCC→CCG RCAP_rcc00185 ← hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*NC_014034222,0270G→C 9.6% 0.0 ‑0.0 ‑0.03974P210P (CCC→CCGRCAP_rcc00185hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (167/214):  ref base (1548/1997):  total (1745/2229)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 9.57e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 4618 total aligned reads displayed.

CGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221927‑222127
                                                                                                    |                                                                                                     
  ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTggg                                                                                                     >  1:6256852‑M1/91‑101 (MQ=255)
  ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTggg                                                                                                     <  1:6074630‑M1/11‑1 (MQ=255)
    gtcggtggggtccgtgggttcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGAt                                                                                                   >  1:3616450‑M1/89‑101 (MQ=255)
    atccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgtgggct                                                                                                   <  1:9118353‑M1/76‑3 (MQ=255)
      ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc.g                                                                                                >  1:3123527‑M1/24‑101 (MQ=255)
      ccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc.g                                                                                                >  2:6873759‑M1/24‑101 (MQ=255)
       cgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc.gg                                                                                               <  2:3209065‑M1/79‑1 (MQ=255)
        gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCgggtccgtgcggtccgt                                                                                               <  1:7856353‑M1/80‑9 (MQ=255)
        gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc.ggt                                                                                              <  2:7300307‑M1/80‑1 (MQ=255)
           ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtc.ggtcgg                                                                                           <  2:6401551‑M1/83‑1 (MQ=255)
                ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCg                                                                                      <  2:2351510‑M1/88‑1 (MQ=255)
                  ggggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGtc                                                                                    <  2:471540/100‑2 (MQ=11)
                    gggtcgggcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTcgg                                                                                  <  1:1000386/98‑1 (MQ=11)
                      atccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGCCCGTGGGAt                                                                                <  1:3757296‑M1/94‑1 (MQ=255)
                       tccgtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                               >  2:8351553‑M1/70‑101 (MQ=255)
                       gccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                               <  1:2260006/95‑1 (MQ=11)
                        ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATccgtggggtcc                                                                              >  1:6707730‑M1/6‑97 (MQ=255)
                         ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                             >  2:5345530/1‑101 (MQ=255)
                         cgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGC.GGGCGGATCCGTGGGAacgg                                                                             >  2:4986023/11‑101 (MQ=11)
                          ttgggatcggcagggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                            <  2:6562234/98‑1 (MQ=14)
                          gtgggatcggtcggctccgtgggatcggtcggccccgtgGGATCGGGCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGGCCCGCGGGGTC.CGTCGGCCCCGCGCGAtcggc                                                                            >  1:2964080/4‑100 (MQ=0)
                          gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                            <  1:8179169/101‑1 (MQ=11)
                           ggggatgtgtcgggtccgtgggctcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                           <  2:3074432/93‑1 (MQ=11)
                            cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                          >  2:2515885/1‑101 (MQ=255)
                            cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                          >  1:1314869/1‑101 (MQ=255)
                             ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGCGGCGGTGGGATCGGGTCGG.GCCGTGGGAtcgggcgg                                                                         >  2:4024028/1‑101 (MQ=11)
                             ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGgggtccgtggg                                                                         <  1:1915510‑M2/101‑12 (MQ=255)
                             ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGGCGGAtcggtcgg                                                                         >  2:7017572/1‑101 (MQ=11)
                               gtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                       <  2:8049339/100‑3 (MQ=11)
                               atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATC.GGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCgggg                                                                       >  2:1683549/1‑100 (MQ=11)
                               atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGAAA.GGGCGGTCCGGTGGGCtcggggagga                                                                       >  2:2844406/1‑95 (MQ=11)
                                tcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                      <  1:1749269/101‑1 (MQ=11)
                                 cggtggggtccgtgggagcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  1:5249476/101‑1 (MQ=11)
                                 cgctcgcgttcgtgggagcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                     <  2:1513160/98‑1 (MQ=11)
                                  ggtcgggtgcggggggtgggtggggtcggtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                    <  1:571466/101‑1 (MQ=11)
                                   gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggt                                                                   <  1:4286814‑M2/101‑18 (MQ=255)
                                   gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGGTCGGAGGGATCCgg                                                                   >  2:8866350/1‑100 (MQ=11)
                                    tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                  >  1:7154786‑M2/1‑100 (MQ=255)
                                      gggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                >  1:4859611/1‑101 (MQ=11)
                                       ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                               <  1:4585823‑M2/101‑5 (MQ=255)
                                       ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                               <  1:6870175‑M2/101‑5 (MQ=255)
                                        gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                                              >  2:2054432‑M2/1‑96 (MQ=255)
                                        gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggaa                                                              <  1:8647488‑M2/101‑6 (MQ=255)
                                          ccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcg                                                            >  1:1459407/1‑101 (MQ=11)
                                            gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGGCCGGGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGCtcggt                                                          >  2:4197058/1‑101 (MQ=11)
                                            gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgt                                                          <  2:1181185‑M2/101‑27 (MQ=255)
                                             tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGAC.CGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGCGTCAGTGGGAtcggtc                                                         >  2:7694865/1‑101 (MQ=14)
                                             gcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtc                                                         >  2:7848315‑M1/48‑101 (MQ=255)
                                                 gtcggtcgggtccgtgggatccggcggGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                                                     <  1:8466406/100‑1 (MQ=11)
                                                   ctgtcggatccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                                   >  1:6423176‑M2/3‑85 (MQ=255)
                                                    ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtccg                                                  <  2:3393454‑M2/101‑18 (MQ=255)
                                                    ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGggggccgcgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                  <  2:4808568‑M2/101‑35 (MQ=255)
                                                    cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg                                                  <  2:3572740‑M1/61‑1 (MQ=255)
                                                     gtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                                                 >  1:8330521‑M2/1‑83 (MQ=255)
                                                      tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATC.GGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtcgggtccgtg                                                >  2:5640479/1‑100 (MQ=11)
                                                        gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                                              <  1:7522660‑M2/101‑22 (MQ=255)
                                                        gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgccgggtccgtggg                                              >  2:5214005/1‑101 (MQ=11)
                                                         ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggc                                             <  1:343303‑M2/101‑23 (MQ=255)
                                                            ccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcg                                          >  1:2103223/1‑100 (MQ=11)
                                                                gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtag                                      <  1:1580486‑M2/101‑47 (MQ=255)
                                                                 gggtccggcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTggg                                     <  2:3709258/93‑1 (MQ=11)
                                                                 ggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                     <  2:2202965‑M2/101‑31 (MQ=255)
                                                                   atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggat                                   >  1:3248442‑M2/1‑52 (MQ=255)
                                                                    tcggtcggAGCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatc                                  >  2:6706502‑M2/1‑51 (MQ=255)
                                                                     ccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                 <  1:7023290‑M1/78‑1 (MQ=255)
                                                                      ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccg                                <  2:9055818‑M2/101‑36 (MQ=255)
                                                                      cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGTCCGTCGGAtccg                                >  1:8054862/2‑99 (MQ=11)
                                                                       gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgt                               <  1:4443538‑M2/101‑37 (MQ=255)
                                                                       gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgt                               >  2:550981‑M2/1‑65 (MQ=255)
                                                                       gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgg                               >  2:4531828/1‑98 (MQ=11)
                                                                         cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             <  2:2658909/101‑1 (MQ=14)
                                                                         cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTGGCGTCCGTGGGGCCCGTGGGCtccgtgg                             >  2:438802/1‑99 (MQ=11)
                                                                          ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtggg                            <  2:8212178‑M2/101‑40 (MQ=255)
                                                                          ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtggg                            >  2:3868135/1‑101 (MQ=11)
                                                                            gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggt                          >  1:7697265‑M2/2‑43 (MQ=255)
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                                                                                   ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgg                   <  1:2423580‑M2/101‑49 (MQ=255)
                                                                                     gtcggtcgggTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggat                 >  2:5844549‑M2/2‑51 (MQ=255)
                                                                                        ggtcggGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtcagtcgggtccg              <  2:6216676‑M2/101‑71 (MQ=255)
                                                                                         gtcggGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgg             <  2:1008721‑M2/101‑55 (MQ=255)
                                                                                             ggTCCGTCGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCggg         <  2:1345102/101‑1 (MQ=17)
                                                                                              gTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggac        <  1:1138735‑M2/101‑60 (MQ=255)
                                                                                              gTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt        >  2:6042399/1‑101 (MQ=255)
                                                                                                ccGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtggggtcg      <  1:6598029‑M2/101‑79 (MQ=255)
                                                                                                ccGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcg      >  1:2754978‑M2/1‑40 (MQ=255)
                                                                                                  gTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggc    <  1:5042295‑M2/101‑64 (MQ=255)
                                                                                                   tGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg   <  1:5897326/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                   tGGGATC.GGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtgggatcggtc   <  1:7318209‑M2/101‑82 (MQ=255)
                                                                                                    |                                                                                                     
CGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221927‑222127

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 41 ≤  ATCG