BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,036	C→G	2.7%	P207P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,036	0	C→G	2.7%	151.5 ‑4.1 ‑0.1	3652	P207P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (32/77): ref base (1444/2099): total (1476/2176)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.73e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.62e-01

Only 100 of 4592 total aligned reads displayed.


TCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGG  >  NC_014034/221936‑222136


tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                      >  1:1975501‑M1/21‑101 (MQ=255)


  ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                    >  1:3124367‑M1/19‑101 (MQ=255)


  ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                    <  1:6094152/101‑1 (MQ=255)


    gtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAt                                                                                                  >  1:7989024‑M1/17‑101 (MQ=255)


      ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                >  2:1312086‑M1/78‑101 (MQ=255)


        gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                                                                                              <  1:44720‑M1/26‑2 (MQ=255)


        gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgc                                                                                              <  1:8129092‑M1/89‑2 (MQ=255)


           gggtcgggcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg                                                                                           <  1:1000386/98‑1 (MQ=11)


             cgccttcggATCGGTCGNGTCTGTCGGTGCGGTCGGCTCCGGGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                         <  2:3330807/96‑1 (MQ=14)


             cTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                         <  2:8848447/101‑1 (MQ=255)


              tccgtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                        >  2:8351553‑M1/70‑101 (MQ=255)


              gccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                        >  1:2149376‑M1/7‑101 (MQ=255)


               tcgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                                                                                       <  1:6276675/99‑1 (MQ=11)


               ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                       <  2:2793058‑M1/96‑1 (MQ=255)


                 gggGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                     >  2:583184‑M1/4‑101 (MQ=255)


                  gtgcatcggtcgggtccgtggggcccgtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                    <  2:4806484/97‑1 (MQ=11)


                  ggggtgtcgtcgggtgcgtggggtccgtcgggttcgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtc                                                                                    <  1:2985167/93‑1 (MQ=11)


                  ggggacccttcgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtc                                                                                    <  2:1657745/92‑1 (MQ=1)


                   gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAccggtcg                                                                                   <  1:1620242‑M1/100‑1 (MQ=255)


                    gggtcggtcggatccgtgggatcgggggggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                  <  1:8740234/98‑1 (MQ=11)


                     ggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                                                                 <  1:7144147‑M1/39‑1 (MQ=255)


                     gagcgggcgggtccgtgggagcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                                                                 <  1:2298410/98‑1 (MQ=14)


                       tcgctcgggtctgtgggatcggtggggtccgtcggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                               <  2:8522555/101‑1 (MQ=11)


                       atcttcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                               <  1:892121/97‑1 (MQ=14)


                         ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                             >  1:8270719/1‑101 (MQ=11)


                         ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                             <  1:6872790/101‑1 (MQ=14)


                         ggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                             <  2:4965844/101‑1 (MQ=11)


                         ggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                             <  1:8576448/101‑1 (MQ=14)


                          gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                            <  2:8082329/101‑1 (MQ=11)


                          ggcggagccgtggggtcggtcggagccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                            <  1:3812411/94‑1 (MQ=11)


                           tggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtc                                                                           >  1:985759‑M2/3‑83 (MQ=255)


                           tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGtg                                                                           <  2:4531272/101‑2 (MQ=11)


                           tcgggtccgtgggatccgtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                           >  2:2017212‑M2/1‑100 (MQ=255)


                           tcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc                                                                           >  1:114502/1‑100 (MQ=11)


                            cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCggggcggtgg                                                                          >  2:6858656/1‑94 (MQ=11)


                            cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                          <  1:5920081‑M2/101‑3 (MQ=255)


                            cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                                                          >  1:245908/1‑99 (MQ=11)


                             gggtcggggggatcggtcggatccgggggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGgg                                                                         <  1:3470823/101‑1 (MQ=11)


                             gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                         >  1:4753616‑M2/1‑98 (MQ=255)


                             ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGgg                                                                         >  1:6707850/4‑101 (MQ=11)


                              gttccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggga                                                                        >  2:6031833‑M2/3‑97 (MQ=255)


                              ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                        >  2:4712492/1‑101 (MQ=11)


                              ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGTCGGTCtggggcgtgggc                                                                        >  2:2319968/1‑92 (MQ=11)


                              gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCgagggc                                                                        >  1:8432006/3‑96 (MQ=11)


                               gtccgtgtggtcaggcgggtccgttggctcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                       <  2:4377717/101‑1 (MQ=1)


                               gtccggggggtcggtcgggtccgtggggtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                       <  1:7295345/101‑1 (MQ=11)


                                tccgtgggatcggtcgtgtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                      <  1:5257168/101‑1 (MQ=14)


                                tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                                      >  1:3259098‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGagg                                                                      >  2:2154883/1‑99 (MQ=11)


                                tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                                      >  2:3548143‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                 gcgggggatcggtcggatccggaggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcc                                                                     <  1:4143039/97‑2 (MQ=11)


                                 ccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                                                     >  1:1787648‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                  cgtgggatcgggcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                    <  1:7808271/101‑1 (MQ=11)


                                    tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                                                                  <  1:2784606‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                     gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtctgtgg                                                                 >  2:7740138/1‑99 (MQ=11)


                                     gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtggggtccgtgg                                                                 <  2:1467460‑M2/101‑29 (MQ=255)


                                     gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcg                                                                 >  2:181531/1‑101 (MQ=11)


                                      ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTTGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgg                                                                >  1:3631229‑M2/1‑89 (MQ=255)


                                       gatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                                               <  2:3025491‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                        atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggt                                                              <  1:6600547/101‑1 (MQ=16)


                                         tcggtcgggtccgtcgggtcggtcggATCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                                             <  2:5205135/101‑1 (MQ=11)


                                          cggtgggggccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatcc                                                            <  1:1493780/101‑1 (MQ=11)


                                            gtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                                                          <  2:7872126/101‑1 (MQ=11)


                                             tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtcgggtccgtg                                                         >  2:5640479/1‑100 (MQ=11)


                                                ggtgcgtgggatgggctggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCgtcggatccgtggga                                                      <  2:3688440/101‑2 (MQ=11)


                                                ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccgtgggg                                                      >  2:7314862/1‑101 (MQ=11)


                                                 gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggat                                                     <  2:6991507‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                                   ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                   <  1:5582701‑M2/101‑43 (MQ=255)


                                                       ggggcccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtcg                                               <  2:2463546/94‑3 (MQ=11)


                                                       gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtag                                               <  1:506621‑M2/101‑47 (MQ=255)


                                                          atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                            >  2:6391433/1‑101 (MQ=14)


                                                          atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggat                                            >  2:7143843‑M2/1‑52 (MQ=255)


                                                           tccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtc                                           <  1:4644868/98‑1 (MQ=11)


                                                           tccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtc                                           >  1:2614288/4‑101 (MQ=11)


                                                             ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcgg                                         <  2:9053058‑M2/101‑53 (MQ=255)


                                                                cggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtgg                                      >  1:1328685/1‑99 (MQ=11)


                                                                  gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                    >  2:3853421/1‑101 (MQ=11)


                                                                   gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                   <  1:9060446‑M2/100‑42 (MQ=255)


                                                                    tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGACCCGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtc                                  >  2:4002713‑M2/1‑42 (MQ=255)


                                                                     cggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                 <  2:114913‑M1/87‑1 (MQ=255)


                                                                     ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                                 <  2:2616825‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                                     ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtcc                                 >  2:3192482‑M2/1‑41 (MQ=255)


                                                                      cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                <  1:3983264‑M2/101‑45 (MQ=255)


                                                                      cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGCGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggccggggccg                                >  1:4903539/1‑96 (MQ=14)


                                                                        tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtc                              <  2:4176986‑M2/101‑47 (MQ=255)


                                                                         cggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                             <  2:8228876‑M1/91‑1 (MQ=255)


                                                                            aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                          <  1:5432705‑M2/101‑51 (MQ=255)


                                                                              cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                        >  2:6537800‑M2/1‑49 (MQ=255)


                                                                               ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtcagtcgggtccg                       <  2:6216676‑M2/101‑71 (MQ=255)


                                                                               ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGAtcgg                       >  1:7654567/1‑101 (MQ=14)


                                                                                  cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCAGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgg                    <  1:6439048‑M2/101‑57 (MQ=255)


                                                                                   gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcgggataggtcggttccgtggg                   <  2:7535615‑M2/101‑58 (MQ=255)


                                                                                    ggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggga                  >  2:5348474‑M2/1‑43 (MQ=255)


                                                                                       ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtgggatcg               <  1:7023290‑M2/101‑79 (MQ=255)


                                                                                         gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggt             <  2:6693196‑M2/101‑64 (MQ=255)


                                                                                          tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtc            >  1:5734091‑M2/1‑37 (MQ=255)


                                                                                            ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg          >  1:7475558/1‑101 (MQ=255)


                                                                                             ggtcggtcggatCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgga         >  2:5509207‑M2/3‑17 (MQ=255)


                                                                                               tcggtcggATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggatc       <  2:8685175‑M2/101‑87 (MQ=255)


                                                                                                cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc      >  1:4336907‑M2/1‑31 (MQ=255)


TCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGG  >  NC_014034/221936‑222136

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 32 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG