BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,051	G→C	1.3%	T202T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,051	0	G→C	1.3%	49.0 ‑1.1 ‑0.8	2971	T202T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (14/28): ref base (1207/1718): total (1223/1748)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.45e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.74e-01

Only 100 of 4254 total aligned reads displayed.


CGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGC  >  NC_014034/221951‑222151


cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcg                                                                                                      >  2:7840777/1‑101 (MQ=11)


ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                      <  2:2793058‑M1/96‑1 (MQ=255)


ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                      >  1:84131/3‑101 (MQ=11)


ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                      >  1:4723852/3‑101 (MQ=11)


 cgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                                     >  1:3625964/2‑101 (MQ=11)


  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggc                                                                                                    >  2:7146538/4‑100 (MQ=11)


  gtgggatcgggcggggccgtgggatcgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgt                                                                                                    <  1:6082776/98‑1 (MQ=11)


  gtcgtATCGGGAGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                    <  2:7681288/101‑1 (MQ=11)


  gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggg                                                                                                    >  2:8499025/1‑100 (MQ=14)


  gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcggg                                                                                                    >  2:8678673/1‑100 (MQ=14)


   tgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  2:6367588‑M1/99‑1 (MQ=255)


    gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGAACGGTGGGGTCCGTGGGATGGGTGGGGTCCGTGGGAGCGGCCGGGTCAGTGGGAtcggtag                                                                                                  >  2:3539492/2‑99 (MQ=11)


     ggatcgggcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                 <  1:2782746/101‑1 (MQ=11)


       gtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                                               <  2:8049339/100‑3 (MQ=11)


        gtcgtggcgtccttgggattggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                              <  2:8194910/93‑1 (MQ=11)


          cgtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                            <  1:3259721/100‑1 (MQ=14)


           gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGGCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGTCCCGGGGGATGGGTTGGGGCCgg                                                                                           >  2:3351083/1‑100 (MQ=11)


             gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAg                                                                                         <  1:7298278‑M1/46‑1 (MQ=255)


              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                        <  1:7656288/101‑1 (MQ=11)


              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                        >  2:2325663‑M2/1‑98 (MQ=255)


              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGGCCgacat                                                                                        >  1:8721441/1‑97 (MQ=11)


              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCAGTggg                                                                                        >  1:5688458‑M2/1‑98 (MQ=255)


              gggtccgtgggatcggtcggggccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                        <  1:7489547/101‑1 (MQ=14)


              ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                                                        >  1:9066521/4‑101 (MQ=11)


               ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                                                       >  1:3939459‑M2/1‑97 (MQ=255)


               ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                                                       >  1:6874792‑M2/1‑97 (MQ=255)


                gtccgtgggttcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                                                                      >  2:4362415‑M2/1‑96 (MQ=255)


                gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                                                                      <  2:5974267‑M2/101‑6 (MQ=255)


                 tcggttggatcggtcgtgtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtc                                                                                     <  1:2969604/95‑1 (MQ=11)


                  ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                    >  2:6183740/1‑101 (MQ=11)


                  ccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcc                                                                                    <  2:3863919/101‑2 (MQ=11)


                   ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcgg                                                                                   <  2:9053058‑M1/52‑1 (MQ=255)


                   cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCGGTGGGGtcgg                                                                                   >  1:6567042/1‑101 (MQ=11)


                   cgtgggagcggtcgggtccgtgggagcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                   <  1:484919/101‑1 (MQ=14)


                     tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                                                                                 <  2:479335‑M2/101‑11 (MQ=255)


                      ggggtcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                <  1:2295003/101‑1 (MQ=11)


                       ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                                                               >  2:5795822‑M2/1‑89 (MQ=255)


                           gatctggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc                                                                           <  2:7503480/93‑1 (MQ=14)


                           ctgtcggatccgtgggatcggtcggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                                                           >  2:467515‑M2/3‑85 (MQ=255)


                           cggtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtgggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc                                                                           >  1:1941522‑M1/42‑101 (MQ=255)


                           cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatcc                                                                           >  2:66756‑M2/1‑85 (MQ=255)


                            ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                                                                          >  1:1610346‑M2/1‑84 (MQ=255)


                            cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg                                                                          >  1:6419272‑M1/41‑101 (MQ=255)


                            cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg                                                                          <  2:2019100‑M1/61‑1 (MQ=255)


                             gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                                                                         >  2:1506599‑M2/1‑83 (MQ=255)


                             ggggggtccgtgggatggggcggAGCCGGTGGATCGGTTGGATCCGGTGGATCGGGCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggtccgt                                                                         <  1:3459657/98‑1 (MQ=2)


                               cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtcgggtccgtcg                                                                       >  2:1319383/1‑101 (MQ=11)


                                gggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccagatc                                                                      >  2:2171589/1‑96 (MQ=11)


                                gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                                                                      <  1:1471977‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                                                                      <  1:3123738‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                ggatccgtgggatgggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGCCCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtcggatccgtggg                                                                      <  2:8811401/98‑1 (MQ=11)


                                ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggcccgtggg                                                                      <  1:1001937‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                 gatccgtgggatcggtcggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggggccgtgggg                                                                     <  1:987390‑M2/99‑23 (MQ=255)


                                  ttgggtggggtcggccggATCCGGGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGAT.GGTCCGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcggatc                                                                   <  1:1319415/97‑1 (MQ=2)


                                    ccgtgggttcggtcggCTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcg                                                                  <  2:512318/101‑2 (MQ=11)


                                      gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                <  1:8906232‑M2/101‑28 (MQ=255)


                                        ggggtccgtgggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTgg                                                              <  2:1830817/101‑1 (MQ=14)


                                         gggtccggcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTcgg                                                             <  1:5230220/93‑1 (MQ=11)


                                         ggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                                                             <  1:3785125/101‑1 (MQ=14)


                                            tccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtc                                                          >  1:2614288/4‑101 (MQ=11)


                                             gggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                         >  1:2455537‑M2/2‑67 (MQ=255)


                                             gcgtgggctcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                         >  2:5470719‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                             cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggtccc                                                         <  1:7801453‑M2/101‑35 (MQ=255)


                                             cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGAtcc                                                         >  2:4174650/1‑100 (MQ=11)


                                             ccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                         <  1:7023290‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                               gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggctcggtcgggtccgt                                                       <  1:7151682‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                gggggtcgggcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                      >  1:7980757‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                                   ggtccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggctcggtcgggtccgtggga                                                   <  2:4010306‑M2/99‑41 (MQ=255)


                                                    gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggat                                                  >  1:8269099‑M2/2‑60 (MQ=255)


                                                     tCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                 >  1:5380864‑M2/1‑59 (MQ=255)


                                                       cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                               >  2:3707080‑M2/1‑57 (MQ=255)


                                                         taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgac                                             >  1:8572586/3‑99 (MQ=14)


                                                         taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc                                             >  2:1656095/3‑100 (MQ=14)


                                                         tGGGATCGGTCCGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                             >  2:2614206‑M2/1‑55 (MQ=255)


                                                           ggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTggg                                           <  2:491965‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                                               cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatcc                                       <  2:832998‑M2/101‑53 (MQ=255)


                                                               cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggttcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc                                       <  1:4424893‑M2/101‑53 (MQ=255)


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                                                               ccggcggatccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc                                       >  1:177057‑M2/5‑49 (MQ=255)


                                                                   cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggaccgtgg                                   <  2:6970844‑M2/101‑57 (MQ=255)


                                                                     gatccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggga                                 <  1:4571348‑M2/99‑59 (MQ=255)


                                                                       tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                               <  2:2468621/101‑1 (MQ=255)


                                                                       tCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTc                               <  1:6271971/101‑1 (MQ=17)


                                                                         cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg                             <  2:6511713‑M2/101‑63 (MQ=255)


                                                                           tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                           <  2:4502957‑M2/101‑65 (MQ=255)


                                                                            gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcg                          <  1:5025325‑M2/101‑66 (MQ=255)


                                                                             ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggg                         >  2:6851899/1‑101 (MQ=17)


                                                                                 cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                     >  1:8126496‑M2/1‑31 (MQ=255)


                                                                                  cgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccg                    <  1:6706770‑M2/100‑72 (MQ=255)


                                                                                     cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgg                 <  2:529712‑M2/101‑75 (MQ=255)


                                                                                       ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa               >  2:3050669/3‑101 (MQ=255)


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                                                                                         tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc             >  2:3197291‑M2/1‑23 (MQ=255)


                                                                                         tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc             >  1:5550409‑M2/1‑23 (MQ=255)


                                                                                         gccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtc             >  1:1155631‑M2/2‑23 (MQ=255)


                                                                                          ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg            >  1:2120434‑M2/1‑22 (MQ=255)


                                                                                           cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg           >  1:590119‑M2/1‑21 (MQ=255)


                                                                                            gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt          <  2:7300307‑M2/101‑82 (MQ=255)


                                                                                            gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggg          >  1:4263340/1‑100 (MQ=255)


                                                                                                  tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAcc    <  2:1129543/101‑1 (MQ=255)


CGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGC  >  NC_014034/221951‑222151

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 24 ≤


ATCG

< 33 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG