BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,066	A→G	1.5%	D197D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,066	0	A→G	1.5%	20.3 ‑0.2 ‑0.1	1231	D197D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/11): ref base (530/677): total (541/690)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.26e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.22e-01

Only 100 of 1525 total aligned reads displayed.


GGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCG  >  NC_014034/221966‑222165


 gtccgtcggatccgtgggatccgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAt                                                                                                    <  2:8706636/101‑1 (MQ=14)


 gtcagggggatcgttcgggcccttgggagcggtcggCTCCTTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                                    <  2:7116344/95‑1 (MQ=11)


 ctccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                                                    <  2:6957162/100‑1 (MQ=11)


  tccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                                                                   <  2:7756282/101‑1 (MQ=11)


  gcggtggggtcggtggggtcggtggggtccgtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                                   <  1:1297097/98‑1 (MQ=1)


   ctgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                  <  2:1310376/99‑1 (MQ=11)


   ccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                  >  1:4832661/1‑101 (MQ=11)


   ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                  <  2:8878621/101‑1 (MQ=11)


   ccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcc                                                                                                  <  2:3863919/101‑2 (MQ=11)


    cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCGGTCGGTTCCGTGGGAtcgg                                                                                                 >  2:185390/1‑101 (MQ=11)


    cgtgggatcggccggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtccg                                                                                                 >  2:2045850/1‑99 (MQ=11)


     gtggggtcggtcggagcggtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                <  1:1449046/101‑1 (MQ=11)


     gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGAgcggg                                                                                                >  2:3230733/1‑100 (MQ=11)


     gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtgggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGtcggc                                                                                                >  2:7861616/1‑100 (MQ=11)


       gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcggtcg                                                                                              >  1:5649617/1‑101 (MQ=14)


       gggatcggtcgggtccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtccgtgg                                                                                              <  1:8610602/101‑3 (MQ=11)


       gggatcggtcgggtccgggggatcggtcggGTCCGTGGGGTCGGTGGGAACCGTGGGATCGGTCGGGTCTAGGGGACCGGTGGGTTCGCTGGGAtcggggg                                                                                              >  2:3616342/1‑98 (MQ=2)


       cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAggatcggccg                                                                                              <  2:5019854‑M1/55‑4 (MQ=255)


        ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtcgg                                                                                             <  2:8350303‑M1/56‑1 (MQ=255)


         ggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtcggtcggt                                                                                            >  2:2585148/6‑100 (MQ=11)


          gtcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggat                                                                                           <  2:8615843/100‑3 (MQ=11)


           tccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcggctggatc                                                                                          >  1:1951838/4‑94 (MQ=11)


            cggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                                                         >  1:1765588/1‑101 (MQ=11)


            cggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                                                         <  1:6812386/101‑1 (MQ=11)


             ggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg                                                                                        >  2:6374049/1‑101 (MQ=11)


             ggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccg                                                                                        <  2:8242277/101‑1 (MQ=11)


             cgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg                                                                                        >  2:9114055‑M1/41‑101 (MQ=255)


              gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgt                                                                                       <  1:6172959‑M1/62‑1 (MQ=255)


              ggggggtccgtgggatggggcggAGCCGGTGGATCGGTTGGATCCGGTGGATCGGGCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggtccgt                                                                                       <  1:3459657/98‑1 (MQ=2)


                 gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGgtcggctccgcggg                                                                                    >  2:4268448/1‑97 (MQ=11)


                 gggtccgtcgggtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                                    <  1:3740173/101‑1 (MQ=11)


                  ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGAATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgggg                                                                                   >  1:8263760/1‑101 (MQ=11)


                  gatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgga                                                                                   >  1:7830892/3‑100 (MQ=11)


                    tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgggtc                                                                                 >  2:3006786‑M1/34‑101 (MQ=255)


                    tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatc                                                                                 <  2:582982/101‑1 (MQ=255)


                     ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                                                                <  1:5087887/101‑1 (MQ=11)


                       gtgggatgggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggt                                                                              <  2:4144804/101‑1 (MQ=11)


                       gtgggagcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt                                                                              <  2:6663170/101‑1 (MQ=11)


                       gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtggggtccgtcgggtccgg                                                                              >  1:6346022/4‑100 (MQ=11)


                       gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtggggtccgtcggggccgg                                                                              >  1:3080221/4‑100 (MQ=11)


                       gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggtccgtcgggtccgt                                                                              >  2:1741140/4‑101 (MQ=14)


                        taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtgggggcggtcggggccggg                                                                             >  2:7604936/3‑99 (MQ=11)


                        taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTg                                                                             <  1:273895/99‑1 (MQ=14)


                        ggggatcggtcggGTCCGTGGGCTCGGTCGCGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc                                                                             <  2:8028160/100‑2 (MQ=11)


                          gggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTcgg                                                                           >  1:2484636/7‑101 (MQ=11)


                          ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGTcgg                                                                           >  2:3101869/1‑101 (MQ=11)


                           ggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa                                                                          <  1:547304‑M1/75‑1 (MQ=255)


                           gatctgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGa                                                                          <  2:3495180/101‑1 (MQ=11)


                           gatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGa                                                                          <  2:645792/101‑1 (MQ=11)


                            gtcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                         <  2:5625832/100‑1 (MQ=14)


                            gtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                         >  1:8448296‑M1/26‑101 (MQ=255)


                             tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                        <  2:4403120/101‑1 (MQ=14)


                             tccgtcggAGCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtc                                                                        <  1:6992080/98‑1 (MQ=11)


                              gcgtgggctcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                       >  2:5470719‑M1/24‑101 (MQ=255)


                              cggtcggATCCGTGGGACCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcc                                                                       <  2:4734343/101‑2 (MQ=11)


                              ccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcc                                                                       >  1:9141549/3‑100 (MQ=11)


                               ggtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccg                                                                      <  2:3725845/101‑3 (MQ=11)


                               cgtcggAGCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccg                                                                      <  2:3976548/100‑3 (MQ=11)


                                 tgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGatcggtg                                                                    <  1:8960508‑M1/81‑2 (MQ=255)


                                  cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                   <  2:4879179/101‑1 (MQ=14)


                                  cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtgg                                                                   >  1:4124743/1‑99 (MQ=11)


                                   gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                  <  1:7318950/98‑1 (MQ=14)


                                   ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                                                                  >  1:5277262/1‑101 (MQ=11)


                                   ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                                                                  <  2:4536751/101‑1 (MQ=11)


                                   ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtggg                                                                  >  1:1010123/1‑101 (MQ=11)


                                    gATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGa                                                                 <  1:4480620/101‑1 (MQ=11)


                                       cggtggtgtgggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCTGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                              <  1:3247866/91‑1 (MQ=14)


                                       ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcgcgcggggcg                                                              >  2:1448426/1‑92 (MQ=11)


                                       ccGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                              <  1:8112633/101‑1 (MQ=14)


                                         gtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                            <  1:3955127‑M1/89‑1 (MQ=255)


                                          tggggtaggtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                           >  1:6628819‑M1/12‑101 (MQ=255)


                                          taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc                                                           >  1:219134/3‑100 (MQ=14)


                                          gcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                           >  2:7297974‑M1/12‑101 (MQ=255)


                                           cggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCTGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                          >  1:7959593‑M1/11‑101 (MQ=255)


                                            ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGGCCGTcgg                                                         >  2:5207427/1‑101 (MQ=14)


                                               tcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                      <  1:2622758/101‑1 (MQ=14)


                                                  gtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                   <  1:2338714‑M1/98‑1 (MQ=255)


                                                   gcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc                                                  <  1:4650710/100‑1 (MQ=14)


                                                    gGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                 <  1:6476126‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                      ggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGNCGGTCGGAgcggggggg                                               >  2:3311047/1‑96 (MQ=14)


                                                      GGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                               <  2:1113316‑M1/101‑1 (MQ=255)


                                                       gTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                              <  2:6161614/101‑1 (MQ=14)


                                                        tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                             <  2:2468621/101‑1 (MQ=255)


                                                           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCgg                                          >  2:532039/1‑100 (MQ=255)


                                                             gggcgtggtgggGTCCGTGGGATCGGGCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                        <  1:4269707/95‑1 (MQ=17)


                                                             cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                        >  2:15733/2‑101 (MQ=18)


                                                              ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                       >  2:6851899/1‑101 (MQ=17)


                                                              ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                       <  1:7114776/101‑1 (MQ=17)


                                                               ggtcggtcggATCGGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                      <  2:2361270/99‑2 (MQ=14)


                                                                 tcggtgggATCCGTGGGATCGGTGGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatc                                    <  1:7477268/101‑4 (MQ=14)


                                                                  cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATACGTGGGATCGGTCGGGTGCGGGGGGCtg                                   >  2:2775581/1‑101 (MQ=21)


                                                                      cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtgg                               >  1:1586015/1‑101 (MQ=255)


                                                                             gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggt                        >  1:11613/1‑101 (MQ=255)


                                                                               gggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcgggcg                      >  1:36119/1‑101 (MQ=255)


                                                                                  gtcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAc                   <  1:8796409/100‑1 (MQ=255)


                                                                                  aTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAc                   >  1:7694436/1‑101 (MQ=255)


                                                                                   tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAcc                  >  1:5942369/1‑101 (MQ=255)


                                                                                        cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGt             >  2:7471826/1‑101 (MQ=255)


                                                                                        cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGt             <  2:2185005/101‑1 (MQ=255)


                                                                                           gTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgc          >  1:2871238/1‑101 (MQ=255)


GGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCG  >  NC_014034/221966‑222165

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 17 ≤


ATCG

< 24 ≤


ATCG

< 33 ≤


ATCG

< 41 ≤


ATCG