| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 681,481 | C→A | 18.2% | G709V (GGC→GTA) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 681,481 | 0 | C→A | 18.2% | 195.9 ‑4.4 ‑0.3 | 395 | G709V (GGC→GTC) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (21/51): ref base (148/175): total (169/226) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.20e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.31e-01 | ||||||||||
Only 100 of 425 total aligned reads displayed.
CCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAC > NC_014034/681382‑681581
|
ggCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCAGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.a > 2:7034659/1‑101 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.Ct < 2:8467935/101‑1 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.Ct < 1:803676/101‑1 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.Ct > 1:6115362/1‑101 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.Ct < 1:5374175/101‑1 (MQ=255)
aTCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTg > 2:6105077/1‑101 (MQ=255)
tCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTgc < 1:8739075/101‑1 (MQ=255)
cGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTgcg > 2:1636318/1‑101 (MQ=255)
gTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTgcgc > 2:2745817/1‑101 (MQ=255)
gTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGANNNNNGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTgcgc > 1:4628099/1‑101 (MQ=255)
tGGCCGAGCCCAGCCCGGAGCGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGcc < 1:8820805/101‑1 (MQ=255)
gCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGa > 1:8371467/1‑101 (MQ=255)
gAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGcc < 1:780080/101‑1 (MQ=255)
gAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTAGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCACCGGGCCG.AT.CTTGGCCGAGca > 2:2963427/1‑100 (MQ=38)
agcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGccc > 2:8137069/1‑101 (MQ=255)
gcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCa < 2:3145642/101‑1 (MQ=255)
gcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCa < 2:5813213/101‑1 (MQ=255)
cagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCTCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGAc < 2:4382498/101‑1 (MQ=255)
cagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGAc < 1:7951066/101‑1 (MQ=255)
gcgggAGAGCGCAGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGAcgcg < 2:1022608/98‑1 (MQ=255)
cGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgcc > 1:4181556/1‑101 (MQ=255)
cGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgcc > 2:2264079/1‑101 (MQ=255)
ggAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgccg < 1:8563801/101‑1 (MQ=255)
gagaGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgccgc > 1:5779110/1‑101 (MQ=255)
agCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTg > 2:138578/1‑101 (MQ=255)
agCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGACCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.GTGCGCCGTGCCCAGACGCGCCGCCTg < 2:2518776/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgc < 2:5484785/101‑1 (MQ=255)
cGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcg < 2:1879837/101‑1 (MQ=255)
cgcgCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcg < 1:7093524/101‑1 (MQ=255)
gcgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcgt > 2:7767872/1‑101 (MQ=255)
gcgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcgc > 2:9027387/1‑100 (MQ=255)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc < 2:2080694/101‑1 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa > 1:1413430/1‑101 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa > 1:633313/1‑101 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTAGTAAGCGCGCCG.AT.CTTCACCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtcg > 1:7355287/1‑100 (MQ=25)
cTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAg < 1:4334396/101‑1 (MQ=255)
tGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 2:1799056/101‑1 (MQ=255)
ggagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 2:5705442/92‑1 (MQ=2)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 2:6877291/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 1:204451/101‑1 (MQ=255)
ccgcgcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa < 2:4549563/99‑1 (MQ=255)
cgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 2:7170955/97‑1 (MQ=2)
cgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 1:7128055/97‑1 (MQ=2)
ccggcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGCTCTGCGTGCTGGGCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGCCGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 2:8853564/98‑1 (MQ=21)
cccAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 1:3679598/100‑1 (MQ=255)
ccAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATg < 2:7280903/101‑1 (MQ=255)
ccAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATg > 1:7486580/1‑101 (MQ=255)
cAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt > 1:5166113/1‑101 (MQ=255)
cAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt > 1:4947848/1‑101 (MQ=255)
cAGATCCGCCGCCTCACGCGCCGCGATCTGCTGACTGGATAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCTGCTGTGCCGTCTGCGGCGTCGTCTGTGCCACGaaca > 2:972495/1‑98 (MQ=16)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa < 2:4627964/101‑1 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 2:3798358/1‑101 (MQ=255)
aTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAt < 1:2453450/101‑1 (MQ=255)
tCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATc < 1:3091636/101‑1 (MQ=255)
tCCCCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATc < 1:1011637/101‑1 (MQ=255)
ccgccgCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCg < 2:6049280/101‑1 (MQ=255)
ccgccgCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCg > 1:9171611/1‑101 (MQ=255)
tgccgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg < 2:767235/100‑1 (MQ=255)
ggcggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg < 2:2177711/91‑1 (MQ=9)
gccgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgga > 1:767248/1‑100 (MQ=255)
cgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc < 2:8371104/101‑1 (MQ=255)
gccGCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:1074174/101‑1 (MQ=255)
tttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccg < 1:5693567/96‑2 (MQ=9)
tCGAGCGCCGCGCTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 1:2951491/101‑1 (MQ=255)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa > 1:3537636/1‑101 (MQ=255)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 2:8558090/101‑1 (MQ=255)
ccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgagg < 2:5174006/99‑5 (MQ=9)
ccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGC.CAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgagg > 1:1770656/3‑97 (MQ=2)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc < 1:4425093/101‑1 (MQ=255)
aGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcc < 1:6956006/101‑1 (MQ=9)
aGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGC.CAG.AAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcc > 1:1259597/1‑101 (MQ=9)
gccgcgtgATCTGCGTGCCGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcg < 2:2923858/94‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcgcg > 2:7461390/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcgcg > 2:2015913/1‑101 (MQ=255)
ccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCgg > 2:637027/1‑101 (MQ=255)
ccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCgg < 2:5084072/101‑1 (MQ=255)
ccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcccttg < 1:6526339/101‑5 (MQ=2)
ccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcccttg < 2:8317579/101‑5 (MQ=2)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt < 1:8185859/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt < 1:2544415/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt > 2:7974949/1‑101 (MQ=255)
cgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATc < 2:6432780/101‑1 (MQ=255)
tCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgcc < 2:3768138/101‑1 (MQ=255)
gCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCgccgcc < 1:1877876/101‑1 (MQ=255)
cGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGccgccg > 1:9020362/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt < 1:4855742/101‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt > 2:7370179/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt > 1:2328972/1‑101 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg > 2:1215133/1‑101 (MQ=255)
gCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGCTGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGc > 1:3197011/1‑101 (MQ=255)
cTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGcc > 1:5951844/1‑101 (MQ=255)
cTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCCCCGCCTGCGCCGTCGTCATCGCCACGATATCATCGGTGCCAAACCCACCGAGcaccgcgccgcc > 2:4257220/1‑95 (MQ=18)
tGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGccc > 1:2799621/1‑101 (MQ=255)
ggccAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa < 2:3574253/98‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCA.AT.CTGCGCAGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa < 2:4884992/101‑1 (MQ=255)
gTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAg > 2:7877737/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAg > 1:3874839/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcg > 1:8788796/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcg < 1:3786879/101‑1 (MQ=255)
gcgcgcCG.AT.CTGCGCCGAGCCCGGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcggc < 1:5483337/101‑3 (MQ=255)
|
CCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAC > NC_014034/681382‑681581
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 28 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|