| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 681,485 | T→G | 18.0% | M708L (ATC→CTC) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 681,485 | 0 | T→G | 18.0% | 197.4 ‑3.0 ‑0.1 | 414 | M708L (ATC→CTC) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (23/51): ref base (147/191): total (171/243) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.16e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.67e-01 | ||||||||||
Only 100 of 441 total aligned reads displayed.
GCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTC > NC_014034/681385‑681585
|
ccATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.c < 1:791302/101‑1 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.Ct < 2:8467935/101‑1 (MQ=255)
tCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTgc < 1:4743009/101‑1 (MQ=255)
tCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTgc < 2:1826129/101‑1 (MQ=255)
tCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTgc < 1:8739075/101‑1 (MQ=255)
tGGCCGAGCCCAGCCCGGAGCGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGcc < 1:8820805/101‑1 (MQ=255)
ggCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCg < 1:5125290/101‑1 (MQ=255)
gCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGa > 1:5540303/1‑101 (MQ=255)
gCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGa > 1:8371467/1‑101 (MQ=255)
gAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGcc > 2:3558256/1‑101 (MQ=255)
gAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTAGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCACCGGGCCG.AT.CTTGGCCGAGca > 2:2963427/1‑100 (MQ=38)
cccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAg < 2:7279503/101‑1 (MQ=255)
agccaGGGGAGCGCCGTGGCGCTGATCTGCGCCCGATCCGCCGCTTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGAcg < 2:6989282/101‑1 (MQ=37)
cGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgcc > 2:2264079/1‑101 (MQ=255)
cGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgcc > 2:7335782/1‑101 (MQ=255)
ggAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgccg < 2:7650308/101‑1 (MQ=255)
agagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCgccgcc < 2:6083718/101‑1 (MQ=255)
agagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCgccgcc > 1:1468991/1‑101 (MQ=255)
gagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCt < 2:1941648/101‑1 (MQ=255)
gagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCt < 2:7119944/101‑1 (MQ=255)
gagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCt > 2:908490/1‑101 (MQ=255)
agCGGCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTg < 1:2916031/101‑1 (MQ=255)
agCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTg > 2:138578/1‑101 (MQ=255)
agCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGACCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.GTGCGCCGTGCCCAGACGCGCCGCCTg < 2:2518776/101‑1 (MQ=255)
tCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtc < 1:3834428/101‑1 (MQ=255)
gtggtgtGATCCGCACCATATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCcgtc < 2:8399893/95‑1 (MQ=2)
gcgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcgt > 2:7767872/1‑101 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa > 1:633313/1‑101 (MQ=255)
tGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcggggcattt < 2:3788813/101‑9 (MQ=255)
tGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc > 1:2064066/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 2:1026708/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 2:4424966/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg < 2:3935649/101‑1 (MQ=255)
aTCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcgc > 2:6534962/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcgc > 2:5707473/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 2:6374336/101‑1 (MQ=255)
ccgcgcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa < 2:4549563/99‑1 (MQ=255)
tGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc > 1:4371361/1‑101 (MQ=255)
ccggcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGCTCTGCGTGCTGGGCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGCCGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 2:8853564/98‑1 (MQ=21)
gcgcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACg < 1:4492502/101‑1 (MQ=255)
gcgcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTAGTCAGCGCCACg < 1:7476520/101‑1 (MQ=255)
gcaccAGATCGGCGGGTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACg < 1:2961108/98‑1 (MQ=9)
gcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 1:192119/101‑1 (MQ=255)
cAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt < 1:7957285/101‑1 (MQ=255)
cAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt < 2:4662058/101‑1 (MQ=255)
cAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt > 1:4947848/1‑101 (MQ=255)
cAGATCCGCCGCCTCACGCGCCGCGATCTGCTGACTGGATAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCTGCTGTGCCGTCTGCGGCGTCGTCTGTGCCACGaaca > 2:972495/1‑98 (MQ=16)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 2:7908291/1‑101 (MQ=255)
aTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAt < 1:2453450/101‑1 (MQ=255)
aTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAt < 2:5540096/101‑1 (MQ=255)
aTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAt < 1:6381518/101‑1 (MQ=255)
tCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATc < 1:3091636/101‑1 (MQ=255)
tCCCCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATc < 1:1011637/101‑1 (MQ=255)
ccgccgCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCg > 1:9171611/1‑101 (MQ=255)
ggcggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg < 2:2177711/91‑1 (MQ=9)
gccgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgga > 1:767248/1‑100 (MQ=255)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc < 2:6155462/94‑1 (MQ=9)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc > 1:584162/8‑101 (MQ=9)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc > 1:7121834/8‑101 (MQ=9)
gccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:6932790/101‑1 (MQ=255)
gccGCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:1074174/101‑1 (MQ=255)
ccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCa < 1:574162/101‑1 (MQ=255)
cTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaa > 1:3240182/1‑101 (MQ=255)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 2:8558090/101‑1 (MQ=255)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCCCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa > 2:3681176/1‑101 (MQ=255)
ccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGC.CAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgagg > 1:1770656/3‑97 (MQ=2)
aGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCGGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGcc < 2:5841875/101‑1 (MQ=255)
aGCGCCGCACCCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcc < 1:705644/101‑1 (MQ=9)
aGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGC.CAG.AAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcc > 1:1259597/1‑101 (MQ=9)
gcgcCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccc > 2:3094648/1‑100 (MQ=2)
gccgcgtgATCTGCGTGCCGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcg < 2:2923858/94‑1 (MQ=255)
cgccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccct > 1:8172284/1‑99 (MQ=2)
gccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcgcg > 2:7461390/1‑101 (MQ=255)
gccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.AG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt < 1:8539796/101‑4 (MQ=9)
ccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCgg < 2:5084072/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt < 1:2544415/101‑1 (MQ=255)
cgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATc < 2:2037065/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 1:5461293/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg > 2:1229520/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgc > 2:8336724/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgc > 2:1696301/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGGGCCACAGCCGCGGCTccc > 1:4285097/1‑99 (MQ=255)
cGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGccgccg < 2:5211326/101‑1 (MQ=255)
cGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGccgccg > 1:9020362/1‑101 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt > 1:2328972/1‑101 (MQ=255)
cTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCCCCGCCTGCGCCGTCGTCATCGCCACGATATCATCGGTGCCAAACCCACCGAGcaccgcgccgcc > 2:4257220/1‑95 (MQ=18)
tGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGccc < 1:3609888/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa > 1:3935235/1‑101 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCA.AT.CTGCGCAGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa < 2:4884992/101‑1 (MQ=255)
gTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAg > 2:7877737/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgc < 1:6067648/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcg < 1:3777312/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcg > 1:8788796/1‑101 (MQ=255)
ggcgcgcCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcgc < 1:7335117/100‑1 (MQ=255)
cgaaT.CTGCGCCGGGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAc < 2:2684192/98‑1 (MQ=255)
cG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAcc < 2:810616/101‑1 (MQ=255)
cG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAcc < 2:8187661/101‑1 (MQ=255)
cG.AT.CGGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAcc < 1:5317330/101‑1 (MQ=255)
g.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCg < 1:7785506/101‑1 (MQ=255)
t.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTc < 2:2090684/101‑1 (MQ=255)
|
GCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.AT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTC > NC_014034/681385‑681585
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|