Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 2,177,289 | 2 bp→AT | 100% | coding (87‑88/990 nt) | rbsB ← | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 2,177,289 | 0 | T→A | 100.0% | 1395.7 | 364 | T30S (ACA→TCA) | rbsB | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (209/155): ref base (0/0): total (209/155) | ||||||||||
* | NC_014034 | 2,177,290 | 0 | A→T | 100.0% | 1392.3 | 360 | C29* (TGT→TGA) | rbsB | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (205/154): ref base (0/0): total (205/155) |
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
CATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AA..GGGTTG..GTCGGTCTT.GTGTACAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.G.AGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.GGCAGAGG.CCCCAACAGGGCCAG.TTGCGCATCATCA > NC_014034/2177202‑2177378
||
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aTAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAgg > 1:8122877/1‑101 (MQ=255)
aGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGcc > 2:8346255/1‑101 (MQ=255)
aGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGcc > 2:726787/1‑101 (MQ=255)
aGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGcc < 2:5274550/101‑1 (MQ=255)
aGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGcc < 2:320861/101‑1 (MQ=255)
ggTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGccc > 1:2466862/1‑101 (MQ=255)
ggTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGccc < 2:4961274/101‑1 (MQ=255)
ggTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGccc > 2:4162952/1‑101 (MQ=255)
ggTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGccc > 1:3105730/1‑101 (MQ=255)
gTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGcccc < 1:836497/101‑1 (MQ=255)
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cGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCgg > 2:3019607/1‑101 (MQ=255)
agagCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGtt > 2:6353964/4‑101 (MQ=255)
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gCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCg < 2:1785599/101‑1 (MQ=255)
cACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCgg > 2:6788361/1‑101 (MQ=255)
aCCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGc > 1:5813738/1‑101 (MQ=255)
ccAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGcc > 2:2491590/1‑101 (MQ=255)
cccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.G.aagc > 2:2356032/1‑98 (MQ=255)
aTCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGATGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAgccgc > 2:8206430/1‑101 (MQ=255)
gTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGc < 1:8845624/101‑1 (MQ=255)
gTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGc > 2:2907909/1‑101 (MQ=255)
gTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGc < 1:5910209/101‑1 (MQ=255)
tCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGcc < 2:9131493/101‑1 (MQ=255)
tCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGcc < 1:1021478/101‑1 (MQ=255)
cGCCTTTGCCGAAGCCCCTTCCTTCATCTGGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCa < 1:1072412/101‑1 (MQ=255)
cGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCa < 2:5714299/101‑1 (MQ=255)
cGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCa > 2:5348223/1‑101 (MQ=255)
cGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGCCCa > 1:2858727/1‑101 (MQ=255)
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cTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCTgcg < 1:7198496/101‑1 (MQ=255)
cTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAgcg > 1:4210195/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAgcgc < 2:3105631/101‑1 (MQ=255)
tttGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAgcgc > 1:437215/1‑101 (MQ=255)
tGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCgg < 1:2414346/101‑1 (MQ=255)
gCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGa > 1:1675020/1‑101 (MQ=255)
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aaGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAAc > 1:4955115/1‑101 (MQ=255)
aaGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAAc > 2:6484777/1‑101 (MQ=255)
aGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACg < 1:3019706/101‑1 (MQ=255)
aGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACg > 2:768948/1‑101 (MQ=255)
gCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AAAGGGGTTGGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGc > 1:649730/1‑101 (MQ=255)
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gttggtgtcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tt > 1:7809871/7‑101 (MQ=255)
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ggtgtcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAG.tttgc < 1:8972545/98‑4 (MQ=255)
gtcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGca > 2:2737188/1‑101 (MQ=255)
tcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcat > 1:3518739/1‑101 (MQ=255)
cggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcatc > 2:5159698/1‑101 (MQ=255)
cggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcatc < 2:7395850/101‑1 (MQ=255)
cggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcatc > 2:3395883/1‑101 (MQ=255)
cggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.GAAGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCCAACAGGGCCAGTTTGCGcatc > 2:9015895/1‑101 (MQ=255)
||
CATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAA.AA..GGGTTG..GTCGGTCTT.GTGTACAGACAGGCCCCGGTTTCGGCC.G.AGCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.GGCAGAGG.CCCCAACAGGGCCAG.TTGCGCATCATCA > NC_014034/2177202‑2177378
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 30 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|