| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 221,997 | 0 | G→C | 11.9% | 219.6 ‑5.0 0.0 | 907 | T220T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (44/68): ref base (422/373): total (466/441) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.45e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 2116 total aligned reads displayed.
TGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGG > NC_014034/221897‑222097
|
tgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 2:2881588‑M1/57‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtg < 2:5096728‑M1/45‑2 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 2:4404063‑M1/47‑1 (MQ=255)
atgggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAt > 1:5478344‑M1/53‑101 (MQ=255)
gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGt < 1:5383095‑M1/53‑1 (MQ=255)
cgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 1:4354631‑M1/55‑1 (MQ=255)
cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 1:3384451/1‑101 (MQ=255)
ggATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg > 1:5685184/1‑101 (MQ=255)
ggATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg > 2:1455718/1‑101 (MQ=255)
ggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa > 1:3747331‑M1/45‑101 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGa > 1:3170348‑M1/45‑101 (MQ=255)
gtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:545342‑M1/58‑1 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:108843‑M1/59‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgcgtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt < 1:5165727‑M1/62‑1 (MQ=255)
ggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:3859347‑M1/65‑1 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:4470211‑M1/69‑1 (MQ=255)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 2:3499041‑M1/33‑101 (MQ=255)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 2:3175766‑M1/32‑101 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 1:4305897‑M1/73‑1 (MQ=255)
gTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 1:3083631/101‑1 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa > 1:5092939‑M1/27‑101 (MQ=255)
gggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTAGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt > 2:133832/1‑101 (MQ=255)
tccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 1:465648‑M1/25‑101 (MQ=255)
tCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccgtg < 1:3261705/101‑2 (MQ=11)
gggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGggtcggtgg < 2:782632‑M1/82‑3 (MQ=255)
ggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:5011694‑M1/83‑1 (MQ=255)
ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:3007424/101‑1 (MQ=255)
gCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 2:5241640/101‑1 (MQ=255)
cggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 1:1931763‑M1/15‑101 (MQ=255)
gtggggtgcgtcggATCGTGCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGt < 2:1890065/92‑1 (MQ=11)
ttgaatcggttggCACGGGCGGCTCCGTTGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 2:2567192/96‑1 (MQ=11)
cgtgtcggtggtATCGGTCGGGTCCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 2:2421165/97‑1 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTGGGATCCGGggg > 2:2756184/10‑101 (MQ=11)
tcggtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 2:579866‑M1/7‑101 (MQ=255)
tccgtcggATCGGTGGGCTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:677901/98‑1 (MQ=11)
cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg < 1:4563783/101‑1 (MQ=11)
cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGTGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTGTGGTCAGTGGGCTCGGCCGGATCAGTGGTAtcg > 2:4815772/1‑101 (MQ=14)
ccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:2696360‑M1/6‑101 (MQ=255)
ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCATGGGAtcgg > 2:4251584/1‑101 (MQ=255)
gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt < 1:3966624‑M1/98‑1 (MQ=255)
gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggggtccgg < 2:3373725‑M1/98‑7 (MQ=255)
gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:2231073/1‑101 (MQ=11)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgGGACCGGTCGGGGCCGTGGGATCGCTCGGGTCCGTGGGGCCCGTCGGTTCCGCGGGAtcggtc > 1:1604895/3‑101 (MQ=11)
tgggagcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:2938283/99‑1 (MQ=14)
gggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:4724732/93‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggccg > 1:1535935/2‑101 (MQ=14)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcgg > 2:2047502/1‑101 (MQ=11)
gatgggtcgggtccgtgggatcgggcgggtcggtggGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg < 1:2010420/101‑1 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCggg > 1:732316/1‑101 (MQ=11)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatc > 2:5551275‑M2/1‑98 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatcc < 1:2334677‑M2/101‑5 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTcc > 2:1785515/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:5587338/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGATCGGGGGGATCGGTCGGATcc > 2:3100186/1‑101 (MQ=11)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGCCGGGTCCGTGGGGTCGGCCGGGTCCGCGGGGGCGGTCGGGTCGGTGGGGTAGGTCggggca > 2:853018/1‑98 (MQ=2)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 1:1822689/1‑101 (MQ=14)
ggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:2100573/101‑1 (MQ=14)
gtcgggtccgtggggcccgtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 1:3646171/101‑1 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTGCGTCGGATCCGt > 2:40646/1‑101 (MQ=11)
gcgggtgcgttggatcggtcgggtcggtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg < 1:596434/100‑2 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgg > 1:4227778‑M2/1‑93 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtag < 1:4789636‑M2/101‑9 (MQ=255)
gggtccgtggggtcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGCTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg < 1:4894875/101‑1 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggggacggggg > 2:463459/1‑93 (MQ=11)
gctctgtgggatcggtctggtcagtggggtccgtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 2:1057113/96‑1 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggat < 2:2670482‑M2/101‑12 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgaccgtggggt < 2:4912314‑M2/101‑12 (MQ=255)
atccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGGCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGGTGGGTAGGAGCCGTGggct > 2:566329/2‑99 (MQ=2)
ccgtgggatcggtcggctccgtgggttcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:4140208/101‑1 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCGGTGGGGTCGCTGGGGTGCGTTGGGtcgg > 2:3891021/1‑101 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGGAggggagg > 1:1699686/1‑96 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCtcgg > 1:1278764/1‑101 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcgg > 2:157504/1‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCggggggcccgg > 1:4987656/1‑91 (MQ=11)
gtcgagtccgtcgcgtccgcgggacccgtcggGTTCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgt < 2:4325259/92‑1 (MQ=2)
tgggatcggtcgggtcggtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtc > 1:838691‑M2/1‑85 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtc < 2:5363083‑M2/101‑17 (MQ=255)
tgcggtcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:1682355/96‑1 (MQ=11)
ggggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtc > 1:5284254‑M2/2‑85 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 1:2474641/101‑1 (MQ=11)
ggatcggtcgggaccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg > 1:4136532/1‑101 (MQ=11)
ggtccgtcgggtccgtggggtccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtggga < 2:2298497/96‑2 (MQ=11)
tcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc < 1:1430824/101‑1 (MQ=11)
gtcggggccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt < 2:1287532/101‑1 (MQ=14)
gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgt < 2:3975701/101‑1 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtagga > 1:2820424‑M2/1‑73 (MQ=255)
gatgcgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg > 1:3498152/5‑101 (MQ=11)
gtccgtggggtccgtcggATCCCTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccgtgggat < 2:3786535/101‑3 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc < 2:2195724‑M2/101‑31 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc < 1:100380/101‑1 (MQ=14)
cgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGtggggtccggcgggtccg > 2:118550/1‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt > 1:1187746‑M2/1‑68 (MQ=255)
gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggt < 1:940742‑M2/101‑34 (MQ=255)
tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc > 2:3280931/1‑100 (MQ=11)
ggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtcg < 1:1341636/101‑3 (MQ=11)
ggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 1:2606498‑M2/101‑37 (MQ=255)
atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt > 2:4526699/1‑101 (MQ=14)
gcggtcggTTCCGTGGGGTGGGTCGGGTCCGAGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtc < 1:4061173/100‑1 (MQ=11)
cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGTGTCGGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:1979556/101‑1 (MQ=14)
ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg < 2:36538‑M2/101‑42 (MQ=255)
|
TGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGG > NC_014034/221897‑222097
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|