| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,009 | 0 | G→A | 7.1% | 290.0 ‑0.8 ‑2.2 | 1876 | P216P (CCC→CCT) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (71/58): ref base (849/799): total (966/910) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.65e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.78e-03 | ||||||||||
Only 100 of 2271 total aligned reads displayed.
CCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGG > NC_014034/221909‑222109
|
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ggATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg > 1:5685184/1‑101 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgtgggtt < 2:5269998‑M1/58‑3 (MQ=255)
tccgtggggtcggtgggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 1:1360194‑M1/43‑101 (MQ=255)
tccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 2:1247729‑M1/59‑1 (MQ=255)
cgcgCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 1:3593976/101‑1 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 2:4744065‑M1/42‑101 (MQ=255)
gtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 2:3157033‑M1/40‑101 (MQ=255)
gggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:4548581‑M1/37‑101 (MQ=255)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 1:3370285‑M1/32‑101 (MQ=255)
gtcggatccgtgggatctgtccgatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 2:3608345‑M1/31‑101 (MQ=255)
tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 2:2867353‑M1/30‑101 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:1632692‑M1/28‑101 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg > 1:3477750‑M1/28‑101 (MQ=255)
gTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 1:3083631/101‑1 (MQ=255)
tcggtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 1:233722‑M1/25‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggaca < 2:2025023‑M1/77‑3 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 1:1710018‑M1/25‑101 (MQ=255)
gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:899938/1‑101 (MQ=255)
ggatcggtggggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:1095037‑M1/19‑101 (MQ=255)
ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:583036/1‑101 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:145030/101‑1 (MQ=11)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 1:194000/101‑1 (MQ=11)
tcgggtaggtgggCTCGGTCTGCCCCGTGGGATCGCTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTg < 2:4524631/94‑1 (MQ=11)
gcggggccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 1:516195‑M1/12‑101 (MQ=255)
cgggtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGGCCGTgg > 1:3256760/8‑101 (MQ=11)
ggcttcgtgggatcggtcggagccgtgggatcggtcgggtccgtgGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg < 2:1010211/92‑1 (MQ=11)
ggCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg > 2:3366721/1‑101 (MQ=255)
ggtgcttgtgatctgtcggatccgggggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa < 2:2340733/92‑1 (MQ=11)
gatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCggcggg > 2:699247/3‑96 (MQ=11)
gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGCTCGGTCGGATCGGGCGGAGCCCTGGGa > 2:2529633/9‑101 (MQ=11)
atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGACCCGCgggct > 1:2021312/8‑99 (MQ=1)
ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATccgtggggtcc > 1:5476854‑M1/6‑97 (MQ=255)
ccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:2696360‑M1/6‑101 (MQ=255)
cgtgGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 1:2606726‑M1/5‑101 (MQ=255)
cgcgggatcggtcggctccgtgggatcggtggggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 2:2995844/97‑1 (MQ=11)
gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt < 1:4643782‑M1/98‑1 (MQ=255)
gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:2231073/1‑101 (MQ=11)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGGgcggtc > 2:1541833/3‑101 (MQ=11)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCGGTgggggccgtg > 2:5679725/3‑94 (MQ=11)
tgggagcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:2938283/99‑1 (MQ=14)
tgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:4245642‑M1/99‑1 (MQ=255)
gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 2:1430731‑M1/100‑1 (MQ=255)
gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:4089106‑M1/2‑101 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGAGGGATCGGTCGGATCCGTgggcctggtggg > 2:2717969/1‑92 (MQ=14)
gttctgtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg < 2:590840/96‑1 (MQ=11)
gtcggtcgggtccgtggggtccgtccgatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt < 2:1949244/100‑1 (MQ=11)
gtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt < 2:4630965/97‑1 (MQ=14)
atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggATCGGACGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGGGGTATCGGTCGGGGGCGGGGGATCGGTCtgga > 2:493925/1‑100 (MQ=11)
agcggtggggtccgtgggatcggtcgggtcggtgggatCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt < 1:2482960/99‑1 (MQ=11)
ccggcggatccgtagggtcggtgggctccgtggggtctgtCGGCTCCGTCGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:4845814/97‑1 (MQ=11)
ggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:5065187/101‑1 (MQ=14)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCg > 2:4396743/1‑101 (MQ=14)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg < 2:5372082‑M2/101‑6 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg < 2:3968880‑M2/101‑6 (MQ=255)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGGGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg > 2:1728502/1‑100 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 1:3698284/101‑1 (MQ=14)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgt > 2:3262772‑M2/1‑95 (MQ=255)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGGGGGAtcggtgggatgcgg > 2:4060926/1‑95 (MQ=11)
ctggtccttgggatcggtcgggtccgttggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg < 2:3092143/99‑3 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGtgg > 1:1196482/1‑99 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgagatcggaa > 2:802990/1‑92 (MQ=14)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga > 1:4198499‑M2/1‑91 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagga > 2:5460943‑M2/1‑91 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTCGGAtcggt > 1:5578389/1‑101 (MQ=11)
ggggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtc > 1:5284254‑M2/2‑85 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:3997647/101‑1 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggg > 1:1832947/1‑101 (MQ=11)
gtcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt < 2:4136321/100‑1 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt > 1:4890617/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg > 2:1321696/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccg > 1:811366‑M2/1‑78 (MQ=255)
gtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGCTCGGTTGTATCCGTGGGATCTGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccgt < 2:3751862/101‑1 (MQ=14)
tggggtcggtggggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGTTCGgtcgggtccgtc < 1:4790845/99‑1 (MQ=11)
tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc < 2:3876341/101‑1 (MQ=11)
gcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc < 1:1290874/100‑1 (MQ=11)
ccggtcgttgggatgtgtcggCTCCGTGTGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg < 2:2611623/93‑3 (MQ=1)
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ggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTGGGTCGGGTCCGGGGGGAGGgtcggttccgggggg > 2:1654076/1‑96 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtagga > 1:2820424‑M2/1‑73 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtaggat > 1:3157378‑M2/1‑72 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc < 1:100380/101‑1 (MQ=14)
cgtggcatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg > 2:3480017‑M2/1‑69 (MQ=255)
gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt > 1:4296833‑M2/1‑68 (MQ=255)
gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGacccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:4979941‑M2/101‑36 (MQ=255)
gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTggg < 1:707904/95‑1 (MQ=11)
ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgg > 1:1551856‑M2/1‑65 (MQ=255)
ggcgcggcggCTCCGGGGGATTGGTCGAGTCCGTAGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGa < 2:876664/94‑1 (MQ=11)
gatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa < 1:2119136/101‑1 (MQ=14)
gggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 2:4319356/100‑1 (MQ=17)
cggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgggggccggcg > 2:5154396/1‑93 (MQ=11)
ggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggg < 1:380849‑M2/101‑46 (MQ=255)
ggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 2:112852/1‑101 (MQ=17)
ggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCAGGTCCGTGGGATAGGACGGGTCCGTCGTGTTCGTCGGGtacgtcgg > 2:2265183/1‑101 (MQ=2)
gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 1:3920531‑M2/2‑54 (MQ=255)
aTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGGGGGATCCGTGGGAt > 1:4464199/1‑101 (MQ=11)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg > 2:5044442‑M2/1‑52 (MQ=255)
cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 2:1847127/1‑101 (MQ=14)
gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 2:2144790‑M2/101‑52 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcg < 1:4353032‑M2/101‑54 (MQ=255)
|
CCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGG > NC_014034/221909‑222109
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 22 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|