| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,030 | 0 | A→G | 11.7% | 0.0 ‑13.1 ‑4.7 | 1876 | D209D (GAT→GAC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (71/153): ref base (801/848): total (875/1001) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.13e-06 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.96e-05 | ||||||||||
Only 100 of 2392 total aligned reads displayed.
TGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGG > NC_014034/221930‑222129
|
tccgtgggctcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 2:2042180‑M1/25‑101 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg < 2:1972480‑M1/78‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 1:5739393‑M1/79‑1 (MQ=255)
gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:3598397/101‑1 (MQ=255)
gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtcggg > 2:3353016/1‑100 (MQ=255)
ggatcggtggggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:1095037‑M1/19‑101 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 2:1572182‑M1/19‑101 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 2:4874889‑M1/15‑101 (MQ=255)
cggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 2:1043393‑M1/87‑1 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTTGGTTTCGTGGGTTCGGTGGGATCCTTGGGGGCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg < 1:853087/101‑1 (MQ=2)
tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 1:5498622/101‑1 (MQ=255)
tgatcggtcggATCTGTGGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 2:2261247/98‑1 (MQ=11)
ggggccgtgggatcggtcgtgtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg < 1:3241303/92‑1 (MQ=11)
ggtgcttgtgatctgtcggatccgggggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa < 2:2340733/92‑1 (MQ=11)
ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa < 1:5623879‑M1/93‑1 (MQ=255)
atcggtcggGTCCGTCGGACCCGGGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 2:395991/100‑1 (MQ=11)
cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg > 1:2695729/1‑101 (MQ=255)
ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:3866065‑M1/96‑1 (MQ=255)
cgtgGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 1:2606726‑M1/5‑101 (MQ=255)
cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 1:314175‑M1/97‑1 (MQ=255)
cgcgggatcggtcggctccgtgggatcggtggggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 2:2995844/97‑1 (MQ=11)
tgtgatcggtccggtccgtgggaccggtcggatccgtggGCTCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtg < 2:2497577/98‑2 (MQ=11)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:1361608‑M1/99‑1 (MQ=255)
ggggtcggtcgggtccgttggatcggtcgggtccgtgggcCCGGTCCGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 2:707352/97‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:1657374/2‑101 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGGtaggtcg > 2:145504/2‑101 (MQ=11)
gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 1:4793747‑M1/2‑101 (MQ=255)
gtatcgatggggtccgtgggaccggtcgcgtccgtgggACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:17605/99‑1 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCGGCGGGAccgggcgg > 2:4537644/1‑101 (MQ=11)
tccgtcgcgtccgtgggaccggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 2:3607744/98‑1 (MQ=14)
cggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 2:3082057/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggagcggtggggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:2025134/101‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtcggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcagatcggaag > 1:1291522/1‑91 (MQ=11)
cgggcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 1:4571134/101‑1 (MQ=11)
cggctggctccgtggactcggccagggccatggggtccgtcggATGCGTGAGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:599262/93‑1 (MQ=9)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGatcgg < 1:2482345‑M2/101‑6 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg < 2:2622972‑M2/101‑6 (MQ=255)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 1:3698284/101‑1 (MQ=14)
gtcggatccgggggatcggtcggagccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt < 2:5059018/101‑1 (MQ=11)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGGGGGGTCCGtg > 2:4753557/1‑100 (MQ=11)
tcgggtccgggggatcggtcgggtcggtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg < 1:1210254/101‑2 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGAGCGGAGGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCgggcacgtcgg > 1:941952/1‑93 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGa > 2:4957725/1‑101 (MQ=14)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga > 1:4198499‑M2/1‑91 (MQ=255)
gtgttgggggtcggtggggtcggtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggt < 1:145524/95‑3 (MQ=1)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTTGGTTCGGT.GGGTcccgtgggtgc > 2:3129461/1‑92 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcg > 1:5094476‑M2/1‑88 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtaga > 1:4666168/1‑98 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcgg < 2:1332337‑M2/101‑15 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggt < 1:3992263‑M2/101‑16 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtc < 1:2117044‑M2/101‑17 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGAGGGGTGCGTGGGGtcggacg > 2:5388840/1‑101 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:2714051/1‑101 (MQ=14)
gtcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt < 2:4136321/100‑1 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGgtcgggc > 2:807686/1‑100 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgggtcc > 1:1565522/1‑101 (MQ=11)
cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtcc < 2:5481152‑M2/101‑23 (MQ=255)
gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgg < 2:5600051‑M2/101‑25 (MQ=255)
cgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg > 2:3747103/1‑99 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtgggggcggtgg > 2:4041900/1‑94 (MQ=14)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg > 2:5163627/4‑101 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtggga < 1:5195530‑M2/101‑29 (MQ=255)
tccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtc < 1:3810343/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc < 1:100380/101‑1 (MQ=14)
cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcgg > 1:1742489‑M2/1‑69 (MQ=255)
gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatgggg < 2:1259815‑M2/101‑34 (MQ=255)
gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 2:1662746‑M2/101‑36 (MQ=255)
gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:5296944‑M2/101‑36 (MQ=255)
aggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTgg > 2:4635132/2‑101 (MQ=14)
gatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGCGGATCCGTgggg > 1:4479992/1‑100 (MQ=11)
gtccgtcggATGCGTGGGGTCCGTGCGGTAGGTGGGATCGGTCGGGCTCCTCGGATCGGTTGGGTAGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAt < 1:4091836/97‑1 (MQ=2)
atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:1872244/101‑1 (MQ=14)
gggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 2:4319356/100‑1 (MQ=17)
cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 1:4353595/101‑1 (MQ=14)
ggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg < 1:2230159‑M2/101‑46 (MQ=255)
gtcCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat < 1:195957‑M2/100‑48 (MQ=255)
ggccgtGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 2:3462879‑M2/3‑54 (MQ=255)
aTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAt > 1:4282987/1‑101 (MQ=11)
tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatc < 1:639247‑M2/101‑49 (MQ=255)
ccGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcc > 2:1155708‑M2/1‑52 (MQ=255)
ccGTAGGATCGGTCGGGTCCATCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:3353221/101‑1 (MQ=14)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCCGCGGGGtcggtcggggccg > 1:3054419/1‑96 (MQ=14)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg > 1:5400310/1‑100 (MQ=14)
gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 1:3919903‑M2/101‑52 (MQ=255)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtc < 2:528684‑M2/101‑53 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:3463096‑M2/101‑54 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:4894484‑M2/101‑54 (MQ=255)
cggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 2:285289/2‑101 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 2:4404063‑M2/101‑55 (MQ=255)
gATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa > 1:2332469/1‑101 (MQ=18)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatcc > 2:4247781‑M2/1‑43 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 1:758115/1‑101 (MQ=17)
gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 2:2153388/4‑101 (MQ=255)
tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:4989662/101‑1 (MQ=17)
cggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg < 2:878358‑M2/101‑63 (MQ=255)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgg < 1:1859259‑M2/101‑63 (MQ=255)
tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 2:3240537/1‑101 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaaccgcgggatcggt < 2:5704523‑M2/101‑70 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggt < 1:2802719‑M2/101‑70 (MQ=255)
gatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggg < 1:2921368‑M2/101‑74 (MQ=255)
|
TGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGG > NC_014034/221930‑222129
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|