| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,033 | 0 | G→C | 11.1% | 0.0 ‑12.8 ‑0.5 | 1798 | T208T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (61/140): ref base (759/835): total (820/978) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.88e-06 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.11e-01 | ||||||||||
Only 100 of 2414 total aligned reads displayed.
CGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGG > NC_014034/221934‑222133
|
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tCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccgtg < 1:3261705/101‑2 (MQ=11)
cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:5494938/1‑101 (MQ=255)
ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:2713129/1‑101 (MQ=255)
ggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGggggatcggtcgggcacg < 2:1760554‑M1/88‑6 (MQ=255)
tGGGCTCGGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 2:5079805/101‑1 (MQ=255)
tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 1:1100130/1‑101 (MQ=255)
ggggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 1:4684404‑M1/11‑101 (MQ=255)
ggtcggtgggGTCGGTCGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 1:4908482/99‑1 (MQ=11)
gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGCTCGGTCGGATCGGGCGGAGCCCTGGGa > 2:2529633/9‑101 (MQ=11)
tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGATCcgtggggtc < 1:1770779‑M1/95‑4 (MQ=255)
ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTGGGGTTCGTGGGAtgg > 1:2352213/3‑99 (MQ=11)
ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCAGTAGGAtcgg > 2:596376/1‑101 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg > 1:372721/5‑101 (MQ=11)
gtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggt > 2:5393539/10‑101 (MQ=11)
gtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggt < 2:3357847/92‑1 (MQ=11)
tgggatcggtggggtccgtggggtccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:5221356/99‑1 (MQ=11)
tgggagcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:2938283/99‑1 (MQ=14)
gatcggttggatccgtggggtcggtcgggtccgtggGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgga < 2:1579820/101‑2 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcgGATCGGTGGGATCCGTTGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTCGGATCCGCCggg > 1:3606653/1‑101 (MQ=11)
gtcggtcgggtccgttggatcggtcgggtccgtggggTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt < 1:764829/100‑1 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGt > 2:4884303/1‑101 (MQ=14)
agcgggcgggtctggggggtcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt < 1:2031839/99‑1 (MQ=11)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtagatcg > 2:2655326/1‑95 (MQ=14)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCGGTCGGATcc > 1:533861/1‑101 (MQ=11)
gggtgggtccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg < 1:5112581/97‑1 (MQ=1)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCgg > 2:4980921/1‑100 (MQ=14)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGGGGGAtcggtgggatgcgg > 2:4060926/1‑95 (MQ=11)
tgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGGCCGtg > 1:1464306/6‑100 (MQ=11)
tgggatccgtgcgatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGtg > 2:3629922/6‑100 (MQ=11)
tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGGCCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGACCAGTGCGGTCGGCCgggcgagtg > 2:2732662/1‑95 (MQ=11)
gggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGTGTCTGtgg > 1:2511582/5‑99 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg > 1:3069372/1‑99 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggg < 2:2074120‑M2/101‑10 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggga < 1:4494209‑M2/101‑11 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga > 2:3089496‑M2/1‑91 (MQ=255)
gctctgtgggatcggtctggtcagtggggtccgtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 2:1057113/96‑1 (MQ=11)
gtccgtgggatcgggcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 1:5750382/101‑1 (MQ=11)
gtccgtgggatcggccgggtccgtggggtcggtcggGTCCGTGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 2:4411847/101‑1 (MQ=14)
gtccggtggatcggtcggagccgtgggatcggtcggGTCCGAGGGATCTGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:957161/101‑1 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCggggggtc > 2:1875006/1‑94 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGGtc > 2:3146215/1‑101 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 1:1864088/101‑1 (MQ=14)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcg > 2:2999001‑M2/1‑88 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 2:1976276/101‑1 (MQ=11)
gtcgagtccgtcgcgtccgcgggacccgtcggGTTCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgt < 2:4325259/92‑1 (MQ=2)
gtaatgttcgggtccgtgggttcggttggTTCCGTGGTCTTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:4807918/94‑1 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCCTCGGGtcggtcgg > 2:1665930/1‑101 (MQ=14)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCGGTGGGATCGgtcggg > 1:3493261/1‑101 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggg < 1:863656‑M2/101‑20 (MQ=255)
gcgggcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatc > 2:2877620‑M2/2‑80 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtcc > 1:55105‑M2/1‑79 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgggtcc > 1:1565522/1‑101 (MQ=11)
cgggcgggtccggggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatcc < 1:1362309/101‑1 (MQ=11)
tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc < 2:3876341/101‑1 (MQ=11)
cgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcg < 2:239280/101‑1 (MQ=11)
gggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg > 1:5424134/1‑101 (MQ=11)
ggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggga > 2:4548153/1‑100 (MQ=11)
gccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 1:5636289‑M2/2‑71 (MQ=255)
ccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc < 1:4580646/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc < 1:100380/101‑1 (MQ=14)
cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggnnncnn > 1:1658679/1‑99 (MQ=11)
cgtggcatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg > 2:3480017‑M2/1‑69 (MQ=255)
tgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc < 1:3927333‑M2/101‑35 (MQ=255)
cgtttccgtgggATCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCTGGTCCGTCGGGTCCGTgg < 2:5292896/91‑1 (MQ=17)
ggcgcggcggCTCCGGGGGATTGGTCGAGTCCGTAGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGa < 2:876664/94‑1 (MQ=11)
gtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGag > 2:1468319/5‑100 (MQ=11)
atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt > 2:21685/1‑101 (MQ=14)
tgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:3243311/99‑1 (MQ=17)
cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 1:3837058/101‑1 (MQ=14)
gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:2635436/4‑101 (MQ=11)
gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 2:1162392‑M2/2‑54 (MQ=255)
gtcCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 1:649893‑M2/2‑54 (MQ=255)
aTCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt < 2:1273984/101‑1 (MQ=11)
tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 2:70385‑M2/1‑53 (MQ=255)
cggtgGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg > 1:4305837‑M2/3‑52 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg < 2:806086‑M2/101‑50 (MQ=255)
taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc < 2:3753911/99‑2 (MQ=14)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:3157222‑M2/101‑54 (MQ=255)
gggATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 2:5182631/101‑1 (MQ=14)
ctcggtcggGTCCGTTGGAGCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGGGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 1:130119/100‑1 (MQ=14)
aTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt > 2:560327/1‑101 (MQ=18)
tcgggcggGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCCGATcctacggacc < 2:3972216/101‑9 (MQ=11)
cggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg < 2:4158521/101‑1 (MQ=14)
ggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCGGTCGGGGCGGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGAtcggtcg > 1:4226141/2‑101 (MQ=17)
cggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg < 2:425986/101‑1 (MQ=17)
gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:4109330/1‑101 (MQ=17)
tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 1:4013512‑M2/1‑35 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg > 1:1221677‑M2/1‑34 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg < 2:227540‑M2/101‑68 (MQ=255)
ccGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:4643306/101‑1 (MQ=255)
ccGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:1965922/101‑1 (MQ=17)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaaccgcgggatcggt < 2:5704523‑M2/101‑70 (MQ=255)
gtcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGt < 1:4382445/98‑1 (MQ=17)
gggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc > 1:2234661‑M2/2‑31 (MQ=255)
cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGgg > 1:5008125/2‑101 (MQ=17)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGATCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:2842467/1‑101 (MQ=255)
gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGTTCGGCCGGGTCCGTggga > 1:2138483/1‑100 (MQ=17)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccg > 1:3370285‑M2/1‑24 (MQ=255)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggggccg < 2:1337522‑M2/101‑78 (MQ=255)
|
CGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGG > NC_014034/221934‑222133
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 22 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|