| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,039 | 0 | A→G | 36.9% | 0.0 ‑0.8 ‑18.8 | 1825 | D206D (GAT→GAC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (294/377): ref base (526/622): total (824/1001) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.35e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.55e-19 | ||||||||||
Only 100 of 2449 total aligned reads displayed.
ATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGG > NC_014034/221940‑222136
|
aTGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt > 1:5618691/1‑101 (MQ=255)
tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGATCcgtggggtc < 1:1770779‑M1/95‑4 (MQ=255)
ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:1542919‑M1/96‑1 (MQ=255)
cgcgggatcggtcggctccgtgggatcggtggggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 2:2995844/97‑1 (MQ=11)
gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:5196645/101‑1 (MQ=11)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 2:3354764‑M1/3‑101 (MQ=255)
tggttcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 2:2636373/97‑1 (MQ=11)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCCTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:383898/2‑101 (MQ=14)
tcgggcgggctcgtgggcttggtcgggtccttgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:3754952/101‑1 (MQ=14)
gtcgggtccgtgggatcggttgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 2:4402833/1‑101 (MQ=11)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGGGGGAtcggtgggatgcgg > 2:4060926/1‑95 (MQ=11)
tgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGGCCGtg > 1:1464306/6‑100 (MQ=11)
cgggagccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTccttg > 2:2031728/7‑98 (MQ=11)
gggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGTGTCTGtgg > 1:2511582/5‑99 (MQ=11)
gggatccgtgggatcggtcgggtccgtaggatccgtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg < 1:2926367/97‑3 (MQ=14)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgg < 1:2036144‑M2/101‑9 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGtgg > 2:1953420/1‑99 (MQ=14)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccctgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGTTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg < 2:3878715/101‑3 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtag < 1:4789636‑M2/101‑9 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGtgg > 2:2234539/1‑99 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg < 2:4618579/101‑1 (MQ=14)
ggtcgggggggtcgggcgggtccgtggggtnggtcgGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa < 1:2714200/101‑1 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga > 2:3089496‑M2/1‑91 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatgggtcggGGCAGGTCGAGTGGGCGGGGCGGTGGGATCGCTGGGGTCGGTGGGTTCTGACGGGCCCGTGGGAtg > 2:486524/1‑100 (MQ=2)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGGtc > 2:3146215/1‑101 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatc > 2:4257887‑M2/1‑89 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 1:1864088/101‑1 (MQ=14)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcg < 1:401196‑M2/101‑14 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcg > 1:1105026‑M2/1‑88 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggt < 2:1140647‑M2/101‑16 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGAGGGGTGCGTGGGGtcggacg > 2:5388840/1‑101 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:2714051/1‑101 (MQ=14)
ggatcggtcgggtccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:2139748/101‑1 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt > 1:4890617/1‑101 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggt > 2:495627‑M2/1‑81 (MQ=255)
gtcggatccgtgggttccgtcggACCCGTGGGATCGCTCGGATTCTGGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgt < 2:582978/101‑1 (MQ=11)
tcggatccgtgggaccggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggtccgta < 2:4745859/101‑2 (MQ=11)
gcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc < 1:5393829/100‑1 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtagga > 2:5061610‑M2/1‑73 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATACGTGGGATCGGTCGGGGCTGTGGGATCGgtcgggtacgcgggat > 2:1650653/1‑95 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 2:5165441‑M2/1‑71 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 1:2361508‑M2/1‑71 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc < 1:100380/101‑1 (MQ=14)
ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatacgtgggatcggtcgggtccgagggatag < 1:4452513‑M2/101‑32 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcg > 1:3144406‑M2/1‑70 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg > 2:5471094‑M2/1‑69 (MQ=255)
cgtggcatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg > 2:3480017‑M2/1‑69 (MQ=255)
gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggt < 1:940742‑M2/101‑34 (MQ=255)
cggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggcgggtgcggcgggtcgggca > 2:324105/2‑96 (MQ=11)
atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt > 2:4526699/1‑101 (MQ=14)
tccgggggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:2345082/95‑1 (MQ=14)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc < 1:3607972‑M2/101‑41 (MQ=255)
ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccg < 1:5719401‑M2/101‑42 (MQ=255)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt < 1:621111‑M2/101‑43 (MQ=255)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgt < 2:1857166/101‑1 (MQ=11)
gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:2635436/4‑101 (MQ=11)
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ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg > 1:4105015‑M2/1‑52 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg < 2:806086‑M2/101‑50 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCAGATcg > 1:1667650/1‑100 (MQ=14)
cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 1:1572276/1‑101 (MQ=14)
gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 2:2144790‑M2/101‑52 (MQ=255)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtc < 2:528684‑M2/101‑53 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcg < 1:4353032‑M2/101‑54 (MQ=255)
cgtgtcttgagggTCGGTCGGAGCGGTGGGAGCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 2:5663917/91‑1 (MQ=11)
cggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 2:285289/2‑101 (MQ=255)
cggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 1:373334/2‑101 (MQ=18)
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ctcggtcggGTCCGTTGGAGCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGGGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 1:130119/100‑1 (MQ=14)
tcgggcggGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCCGATcctacggacc < 2:3972216/101‑9 (MQ=11)
ccgtcggatCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatcc < 1:393593‑M2/99‑59 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg < 2:4325206‑M2/101‑60 (MQ=255)
gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGGGGGtcggtcgg > 2:1423706/1‑101 (MQ=14)
ggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCggg > 2:1731578/1‑101 (MQ=14)
gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 2:885214‑M2/1‑36 (MQ=255)
gTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggat > 1:3482350‑M2/1‑36 (MQ=255)
gTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt > 1:3059930/1‑101 (MQ=17)
tccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 1:4207384‑M2/1‑35 (MQ=255)
tccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatc < 2:1247729‑M2/101‑67 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg > 1:1221677‑M2/1‑34 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg > 1:5495228‑M2/1‑34 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTAGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:3360524/101‑1 (MQ=255)
ccGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:1965922/101‑1 (MQ=17)
cgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg > 1:5299301‑M2/1‑33 (MQ=255)
gtcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGt < 1:852359/98‑1 (MQ=17)
ggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcg > 2:1022009‑M2/1‑30 (MQ=255)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggggtcggtgg < 1:2246451‑M2/101‑72 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTgg > 2:696094/1‑101 (MQ=255)
gggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg > 1:4548581‑M2/1‑29 (MQ=255)
ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggttcgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcgg < 1:4985288‑M2/101‑73 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGATCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:2842467/1‑101 (MQ=255)
ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTagg > 2:1322209/1‑101 (MQ=17)
ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:5077194/1‑101 (MQ=18)
aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggat > 1:4285224/1‑99 (MQ=17)
tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc < 1:74513‑M2/101‑76 (MQ=255)
tcggtcggATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc < 2:2496931/101‑4 (MQ=14)
ggtcggCGCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTTGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcgg < 2:5561854/101‑6 (MQ=14)
gtcggatccgtgggatctgtccgatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgt > 2:3608345‑M2/1‑23 (MQ=255)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggt > 1:1362469/1‑95 (MQ=14)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg < 1:3243511‑M2/101‑81 (MQ=255)
|
ATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGG > NC_014034/221940‑222136
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 14 ≤
ATCG
< 22 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|