Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 222,057 | 0 | G→A | 12.1% | 282.3 ‑9.9 ‑0.0 | 983 | D200D (GAC→GAT) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (31/89): ref base (389/473): total (420/563) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.94e-05 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 1337 total aligned reads displayed.
GATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGC > NC_014034/221957‑222157
|
tccgtcgcgtccgtgggaccggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 2:3607744/98‑1 (MQ=14)
ggggcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:4298196/97‑1 (MQ=11)
ctggcgtatccgtgggatcggtcgggtccgttggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 1:1305871/93‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGCCGGGCGCGGGGGATCGGTCGGGCCCGGGGGCTCGGTCGGGGcc > 1:4885343/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCg > 2:1371855/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatgGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGGGGGTCCGGGGGACTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 1:341041/1‑101 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:834492/1‑101 (MQ=14)
gtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTcctg > 2:4917700/1‑99 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTACGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGGTCGGtgg > 2:1914837/1‑99 (MQ=11)
cgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGAGGGATCGGTCGGGGccaagg > 2:82249/1‑97 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGtgg > 2:3515628/1‑99 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATAGGGCGGGTcggggg > 1:2340859/1‑96 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg < 1:1126833/101‑1 (MQ=14)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGACGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGgg > 2:3872353/1‑101 (MQ=14)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGGTcggccgg > 1:1964455/1‑95 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGgg > 2:2606577/1‑101 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa > 1:4401161/1‑101 (MQ=14)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggctcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa < 2:3943671/101‑1 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtggGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa > 2:4804714/1‑101 (MQ=14)
tcttccgatctcggtcggagccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:4113566/91‑1 (MQ=14)
tctcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:4665892/98‑1 (MQ=11)
ggccgtggggtggggcggctccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:5354774/99‑1 (MQ=11)
gcccggaggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCCTGCGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:4777011/94‑1 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGGTCGGTCGGGTCCggggggtg > 2:4339911/1‑94 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtc > 2:1838335/1‑101 (MQ=14)
tacgtgtgatcgctcgggtccgtcgggtcggtgggTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:4282727/99‑1 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTTGGGTCCGTGGGGtcag > 2:2086487/1‑99 (MQ=11)
gtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTGCGGGCCGGGGGATCGGGGGGGTCACTAGGGTCGGTGGGGGGCGTAGGAtacgc > 2:888208/1‑97 (MQ=2)
gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:1223071/101‑1 (MQ=11)
tgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGtgggtg > 2:5657249/1‑100 (MQ=11)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcgggc > 1:3952069/1‑99 (MQ=11)
gggatcggttggatccgggggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 1:5237514/101‑1 (MQ=11)
gggatcggtggggtccgtgggatcggtcgtGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 1:2206783/101‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGAGGGGTGCGTGGGGtcggacg > 2:5388840/1‑101 (MQ=11)
ccagccgcgtccgtgggacctgtcggATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc < 2:735775/93‑1 (MQ=11)
cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGATCGgtcgggtcc > 2:1082918/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCCgtcgggtcgg > 2:3066645/1‑99 (MQ=11)
ggtcgggtccgcggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg > 2:3212298/1‑101 (MQ=11)
ggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccg > 1:1505642/1‑101 (MQ=11)
gtctgatcggtgggaccggtcggATCCGTTGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt < 2:658607/92‑1 (MQ=11)
gtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt < 2:3770902/101‑1 (MQ=11)
gtcggatccgtgggatcngtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgt < 2:2395371/101‑1 (MQ=255)
tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc < 2:3114884/101‑1 (MQ=11)
cgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcg < 2:4537699/101‑1 (MQ=11)
gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg > 1:94991/1‑101 (MQ=11)
gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGCTCGgtcggggccgtggg > 1:2905057/1‑101 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCAGTGGGATCGgcggggtccgtggg > 2:3360319/4‑101 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGGGGGATCGGTCGGAGCCGTAGGGTGGGCCGGGACCGTAGGATCGgtcgggtccggcgc > 1:5537581/4‑100 (MQ=14)
cgttcgggtcgatcggGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTCGGATCGTTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATTCgtggggtacgtcgggtcc < 2:175109/93‑1 (MQ=0)
ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc < 1:100380/101‑1 (MQ=14)
cgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGtggggtccggcgggtccg > 2:118550/1‑101 (MQ=11)
gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggtccgtcgggtccgt > 1:4224916/4‑101 (MQ=14)
gggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg > 2:271014/10‑101 (MQ=11)
gggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATTCGTGGGATCTGTCGGGTCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTcgg > 1:5782523/7‑101 (MQ=11)
cggtcggGTCCGTGGGATCGTGTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcg < 1:2506777/101‑1 (MQ=11)
cgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 2:2482203/97‑1 (MQ=14)
gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTcgggtccgtggggtccgttgtagcggg > 2:5201495/1‑92 (MQ=11)
gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:1712459/101‑1 (MQ=14)
cgatctCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:1667551/96‑1 (MQ=11)
gggttgggggggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCCTGGGAtcggtcg < 1:3129650/92‑1 (MQ=17)
ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg > 1:5689654/1‑101 (MQ=1)
ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcggg > 1:3825396/3‑100 (MQ=11)
aTCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt < 2:1273984/101‑1 (MQ=11)
tcggTGGGTTCGTTCGGGTCCTTGGGATCTGTCGGGTCCGGGGTGGCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:1979854/98‑1 (MQ=9)
ccGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATcg < 2:4463927/101‑2 (MQ=11)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 2:1583958/1‑101 (MQ=14)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcggtgggggccggg > 2:5586102/1‑94 (MQ=11)
ggggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg < 1:4541385/100‑1 (MQ=14)
gggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCgg < 1:3295013/101‑1 (MQ=18)
cggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 2:285289/2‑101 (MQ=255)
ggATGGGTGGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg < 1:2029625/101‑1 (MQ=14)
ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTagg > 2:5145008/1‑101 (MQ=14)
ggAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg < 1:4637239/101‑1 (MQ=14)
gATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa < 2:2239603/101‑1 (MQ=255)
gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa > 1:4027943/1‑101 (MQ=17)
cggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg < 2:4158521/101‑1 (MQ=14)
gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 2:2153388/4‑101 (MQ=255)
tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTGGGAtcggtg > 1:2613154/1‑100 (MQ=14)
ggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:4957986/2‑101 (MQ=255)
ggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg > 2:5466599/1‑101 (MQ=255)
gTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt > 2:5023888/1‑101 (MQ=17)
gTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt > 1:3033746/1‑101 (MQ=17)
ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:69043/101‑1 (MQ=17)
cGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCg > 2:3020036/1‑101 (MQ=17)
cGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCg > 1:5082371/1‑101 (MQ=17)
tcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTg < 1:3682676/99‑1 (MQ=17)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 1:995589/1‑101 (MQ=255)
cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTgg > 2:577092/2‑101 (MQ=17)
gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggg > 2:4035425/1‑101 (MQ=17)
gtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggat < 1:2709028/100‑3 (MQ=14)
aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggg > 1:3088926/1‑100 (MQ=11)
tcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCt < 2:5294910/101‑1 (MQ=255)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggt > 1:2807536/1‑95 (MQ=14)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggt > 1:1362469/1‑95 (MQ=14)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc < 1:1847237/101‑8 (MQ=11)
gcggATCGGGGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc < 1:2120988/100‑8 (MQ=11)
ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGTTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTgggg > 1:3528859/3‑100 (MQ=255)
tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtc < 2:1480128/101‑1 (MQ=255)
gccGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTAGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtc < 1:5412195/100‑1 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCg > 1:1627923/1‑101 (MQ=255)
|
GATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGC > NC_014034/221957‑222157
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 22 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|