| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,090 | 0 | G→C | 5.4% | 57.4 ‑4.9 ‑0.8 | 552 | P189P (CCC→CCG) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (6/24): ref base (238/284): total (244/308) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.27e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.55e-01 | ||||||||||
Only 100 of 688 total aligned reads displayed.
TGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGG > NC_014034/221990‑222190
|
tgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTg > 1:954902/1‑101 (MQ=11)
cgtttccgtgggATCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCTGGTCCGTCGGGTCCGTgg < 2:5292896/91‑1 (MQ=17)
gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTggg < 1:2898060/95‑1 (MQ=11)
ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTCGGCTAGGGGGGCTCGGTCGGGTGCGTGGGGTGCGTcgg > 2:5555418/1‑101 (MQ=2)
ggtcggtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa < 2:2561160/99‑1 (MQ=14)
gtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAt < 1:5097013/97‑1 (MQ=11)
gtccgggggATCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAt < 1:4855131/94‑1 (MQ=11)
tcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGtc < 1:3505051/101‑1 (MQ=11)
gcggtcggTTCCGTGGGGTGGGTCGGGTCCGAGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtc < 1:4061173/100‑1 (MQ=11)
cggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCCGTgggggcc > 1:5418249/1‑97 (MQ=11)
ccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAGCGGTCGGGGGCGTCGCGTCCGTGGGAtcg > 2:1537444/6‑101 (MQ=9)
cgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 2:2482203/97‑1 (MQ=14)
gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:662365/4‑101 (MQ=14)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgt < 2:4072653/101‑1 (MQ=11)
cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGGCCCGTGGGAtccgtcg > 1:1694798/1‑101 (MQ=11)
cgcaTCCGTATGAGCGGGAGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGtccgtcg < 2:844931/98‑1 (MQ=2)
gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTTGGCTCGGTGGGGCCCCTGGGGtcggccgg > 1:3415605/4‑101 (MQ=11)
ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg > 1:5689654/1‑101 (MQ=1)
ggtcggtaggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg < 2:4923909/93‑2 (MQ=11)
ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg > 2:5340265/3‑100 (MQ=14)
ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcggg > 1:3972460/3‑100 (MQ=14)
tcggTGGGTTCGTTCGGGTCCTTGGGATCTGTCGGGTCCGGGGTGGCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:1979854/98‑1 (MQ=9)
gcggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc < 1:4302373/95‑1 (MQ=17)
ccggaggATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:5124492/96‑1 (MQ=14)
ccGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATcg < 2:4463927/101‑2 (MQ=11)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGACGGGTGCGTGGGATGGGTGGGATCCGTAGGGACAGTGAAAacggtcgggtac > 2:897257/1‑97 (MQ=11)
ccGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTcc > 2:1913889/1‑101 (MQ=14)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCg > 2:3583581/1‑101 (MQ=14)
cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 2:1847127/1‑101 (MQ=14)
gTGGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 2:4613201/101‑1 (MQ=14)
tcggATCGGGGGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 1:3855091/99‑1 (MQ=18)
taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc < 2:3753911/99‑2 (MQ=14)
taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc < 1:476235/99‑2 (MQ=14)
cggATCCGTGGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 1:2672462/100‑1 (MQ=18)
ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg > 1:1047048/1‑101 (MQ=14)
ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGGTCCGTggg > 2:2107564/1‑101 (MQ=17)
gtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:2761118/100‑1 (MQ=17)
gtcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 1:1770950/100‑1 (MQ=14)
gtccgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 1:3323735/94‑1 (MQ=255)
aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt > 2:4341076/1‑101 (MQ=14)
aTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 1:994961/101‑1 (MQ=14)
cggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg < 2:2230143/101‑1 (MQ=14)
cgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 2:1166784/97‑1 (MQ=255)
gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 2:2153388/4‑101 (MQ=255)
tggggTCTGTGGCATCGGTCGGATCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:3924698/99‑1 (MQ=17)
tcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc < 1:1914200/101‑1 (MQ=14)
cggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg > 2:2897893/1‑101 (MQ=17)
cggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg < 2:425986/101‑1 (MQ=17)
gggTCCGTTGGAGCCGGCCGGTCCCTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:5769918/101‑1 (MQ=0)
gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:1969701/1‑101 (MQ=17)
gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcggtcgg > 2:1275622/1‑101 (MQ=17)
ggatCCGTAGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg > 2:3065465/4‑101 (MQ=14)
gTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt > 2:5023888/1‑101 (MQ=17)
tCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTAGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:3168522/101‑1 (MQ=18)
ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:907104/101‑1 (MQ=17)
ccGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTcc < 1:1584052/101‑1 (MQ=11)
ccGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGGGCGGGCggggcg > 2:3997403/1‑98 (MQ=11)
tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGta > 2:1638966/1‑100 (MQ=17)
ggATCGGTTGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 2:2770041/101‑1 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 2:5748528/101‑1 (MQ=255)
gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGTTCGGCCGGGTCCGTggga > 1:2138483/1‑100 (MQ=17)
gtctgtcggATCCGCGGGGTCGGCCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggat < 2:4510337/97‑3 (MQ=14)
gtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggat < 2:76072/97‑3 (MQ=17)
aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCGGTGGGGCCCGCGGCGTCGGTGGCGGGCGTggggt > 2:4200935/1‑100 (MQ=11)
aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCggcggct > 1:5389854/1‑95 (MQ=14)
tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc < 1:5340555/101‑4 (MQ=14)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggagat > 1:3548918/1‑97 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggtcc > 1:4199801/1‑98 (MQ=11)
cggtcggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCTGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg < 1:2423181/101‑5 (MQ=11)
cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg > 1:4511750/1‑97 (MQ=14)
ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCTGGTCCGTcgggtccg > 1:1480221/1‑97 (MQ=11)
ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcgg > 2:3278181/1‑96 (MQ=14)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggt > 1:558543/1‑95 (MQ=14)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTaggatcggt > 1:3020692/1‑95 (MQ=14)
gtcggATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggt > 1:5001604/1‑95 (MQ=14)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggccgg > 2:1071575/1‑92 (MQ=14)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcg > 2:3024191/1‑101 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcg > 1:3120379/1‑101 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcg < 1:307269/101‑1 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggt < 1:1275705/101‑1 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGCGCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCATCGGGCTGGTGGGCtcggc > 2:5196096/1‑100 (MQ=21)
ggggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtc < 2:662308/100‑1 (MQ=255)
gATCGGTCGGGTCCGTAGGGTCGGTCGGGTCCTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGa < 2:1742173/101‑1 (MQ=255)
gATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGa > 1:456491/1‑101 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCg > 2:5415538/1‑101 (MQ=255)
gtcggGTCCGTAGGATCGGGCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGGCCGCt < 2:5607446/101‑1 (MQ=255)
tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTg < 2:3449015/101‑1 (MQ=255)
cggGTCCGTGGGATTGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGCCCGTGGGATCGGTCGGCCCCGTAGGGTCGGTGGGGCCGGTCGGGccagggg > 2:1456474/1‑96 (MQ=2)
gTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgc < 1:2291469/101‑1 (MQ=255)
gTAGGATAGGGTGGGTCCGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgcc < 1:369348/101‑1 (MQ=25)
aGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgccgc > 1:3233105/1‑101 (MQ=255)
gATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGccgccgccg < 1:4459439/101‑1 (MQ=255)
gtcgggtccgtcgggtccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAg > 1:1347330/1‑101 (MQ=255)
tccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAg < 2:1362381/101‑1 (MQ=255)
tccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAg > 1:1206364/1‑101 (MQ=255)
gtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggcc > 2:2359296/1‑101 (MQ=255)
gggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggc > 1:790921/1‑101 (MQ=255)
gggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggc > 1:2843451/1‑101 (MQ=255)
gtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCa < 1:2058741/101‑1 (MQ=255)
cgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAc > 1:2568837/1‑101 (MQ=255)
|
TGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGG > NC_014034/221990‑222190
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|