BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,006	C→G	1.4%	T217T (ACG→ACC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,006	0	C→G	1.4%	33.3 ‑0.8 ‑0.7	1845	T217T (ACG→ACC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (16/10): ref base (949/869): total (965/880)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.30e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.21e-01

Only 100 of 2250 total aligned reads displayed.


TCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCG  >  NC_014034/221906‑222106


 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                                     <  2:2132546‑M1/52‑1 (MQ=255)


   tcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                                   <  1:4306284‑M1/54‑1 (MQ=255)


   ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                                   >  1:1636627/1‑101 (MQ=255)


       gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgtggggt                                                                                               >  1:1838445‑M1/44‑99 (MQ=255)


       aTCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                               >  1:2497073/1‑101 (MQ=255)


         ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                             >  2:4618413‑M1/42‑101 (MQ=255)


          cgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                            >  1:5299301‑M1/41‑101 (MQ=255)


          cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAccgg                                                                                            <  2:5036415‑M1/61‑1 (MQ=255)


             ggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                         >  2:1022009‑M1/38‑101 (MQ=255)


               gatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGatcggtcgga                                                                                       <  1:3385236‑M1/66‑2 (MQ=255)


                  cGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                    >  2:3460952/1‑101 (MQ=255)


                          tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                            >  2:3262715‑M1/25‑101 (MQ=255)


                          tccgtgggatcggtcggctccgtgGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                            >  2:5376118‑M1/25‑101 (MQ=255)


                              tgggatcggtcgggtccgtcGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                        <  1:2986024‑M1/81‑1 (MQ=255)


                              gcggatcggtcgggtccgtgGGATC.CGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                        >  1:5201781‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                ggatcggtcgggtccgtgGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                      <  1:2024051‑M1/83‑1 (MQ=255)


                                ggatcgggcggatccgtgGGATC.GGTAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                      >  1:605412‑M1/19‑101 (MQ=255)


                                ggATGGGTGGGATCCGTGGGGTC.GGTCGGGTGTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                      <  1:5496234/101‑1 (MQ=11)


                                  gtccGTGGGATCGGGCGGATC.CGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                    <  1:5011975/98‑1 (MQ=14)


                                  aTGCGTGGGCTCGGTCGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                    >  1:5618691/1‑101 (MQ=255)


                                    acGTGTGCTC.GTCCGATCTGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                  <  1:2874166/100‑1 (MQ=11)


                                         ggCTCGGTCGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                             <  1:1554660/101‑1 (MQ=255)


                                            tccgtgGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                          >  1:4912595‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                            tccgtcggATC.GGTGGGCTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                          <  2:677901/98‑1 (MQ=11)


                                             gcgtgGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATccgtggggtcc                                                         >  1:4685946‑M1/6‑97 (MQ=255)


                                             ccgtcggATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGAtcg                                                         >  2:3089971/3‑101 (MQ=11)


                                             ccgggggatc.gctcgggtccgtgggctcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                         <  2:3959704/96‑1 (MQ=14)


                                              cgtgGGGTC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtggggtccg                                                        >  1:5104321‑M1/5‑96 (MQ=255)


                                               gtcggTTC.TGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                       <  2:4511478/101‑1 (MQ=11)


                                               gtcggATC.GGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                       >  1:2231073/1‑101 (MQ=11)


                                                tgggatc.ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTgggggacgtg                                                      >  2:2848280/3‑94 (MQ=11)


                                                tgggatc.ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGGCCGGGTCCGTGGGAgcggtc                                                      >  2:1656896/3‑101 (MQ=11)


                                                tgggatc.ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCGGTgggggccgtg                                                      >  2:5679725/3‑94 (MQ=11)


                                                tgGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                      >  2:1543541‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                gtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggt                                                       <  2:3357847/92‑1 (MQ=11)


                                                ggGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                      >  1:4108048‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                 gggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                      <  2:4724732/93‑1 (MQ=11)


                                                 gggatc.ggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGACCGGGGGACCGGTCGGGTGCGGGGGAtcggtcg                                                     >  2:4059528/2‑101 (MQ=11)


                                                 gggatc.ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCCTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                     >  1:383898/2‑101 (MQ=14)


                                                  gggtc.ggtcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                                    <  1:3096852/98‑1 (MQ=11)


                                                   gatc.ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCggg                                                   >  1:732316/1‑101 (MQ=11)


                                                    atc.ggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGt                                                  >  2:1740961/1‑101 (MQ=11)


                                                      c.ggtcgtgtccgtgcgatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                <  2:3859105/101‑1 (MQ=11)


                                                        ggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCg                                               >  1:402503/1‑101 (MQ=11)


                                                        ggtcggatccgtgggatcggtgggatccgtaggatcGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                               >  1:3275739/1‑101 (MQ=11)


                                                        ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                               >  2:251845/1‑101 (MQ=11)


                                                        cgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATGGGGGGGGTCCGGGGGATCGGGCGGGTCCg                                               >  2:1442061/2‑101 (MQ=11)


                                                         gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                              >  1:834492/1‑101 (MQ=14)


                                                         ggggggtccgtgggatcgggcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                              <  1:1361883/98‑1 (MQ=11)


                                                         gcggggtccgtggggtcggtcgggtccgggggttccgtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGt                                              <  1:912349/98‑1 (MQ=11)


                                                          tcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                             <  1:3739548/101‑2 (MQ=14)


                                                          tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtg                                             >  2:2985857‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                          tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgta                                             <  1:4489936‑M2/101‑8 (MQ=255)


                                                           cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGtgg                                            >  2:1953420/1‑99 (MQ=14)


                                                           cgggtccgtgggagcgggcgggtccgtgggagcgggCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                                            <  1:318061/101‑3 (MQ=14)


                                                           cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgagatcggaa                                            >  2:802990/1‑92 (MQ=14)


                                                            gggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGGGGGtggggagg                                           >  2:1255982/1‑94 (MQ=11)


                                                            aggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggg                                           <  2:2022370‑M2/100‑10 (MQ=255)


                                                              gtgttgggggtcggtggggtcggtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggt                                         <  1:145524/95‑3 (MQ=1)


                                                               tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatc                                        <  1:2345208‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                               tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGGtc                                        >  2:3146215/1‑101 (MQ=11)


                                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcg                                       >  1:1105026‑M2/1‑88 (MQ=255)


                                                                 cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcgg                                      <  1:3499258‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                                  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                     >  1:1949355/1‑101 (MQ=11)


                                                                  gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                     <  2:4244898/101‑1 (MQ=11)


                                                                    gggatcgggcggatccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtcg                                   <  2:4821668/101‑1 (MQ=14)


                                                                       gtcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                                <  2:4136321/100‑1 (MQ=11)


                                                                        tcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                               <  2:4926860/101‑1 (MQ=11)


                                                                         cggtcggttccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                              <  1:2132663/101‑1 (MQ=255)


                                                                         cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc                              <  2:5146147/101‑1 (MQ=255)


                                                                          ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccg                             <  1:3956454‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                                                          ggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccg                             >  1:5708758/1‑101 (MQ=11)


                                                                           gtcggctccggaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCCTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgt                            <  1:2718118/101‑1 (MQ=11)


                                                                           gtcggatccgtgggttccgtcggACCCGTGGGATCGCTCGGATTCTGGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgt                            <  2:582978/101‑1 (MQ=11)


                                                                            tcgggtccgttgggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtg                           >  2:5455901‑M2/1‑76 (MQ=255)


                                                                            gcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc                           <  1:5393829/100‑1 (MQ=11)


                                                                            gcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc                           <  1:1290874/100‑1 (MQ=11)


                                                                             ccggtcgttgggatgtgtcggCTCCGTGTGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg                          <  2:2611623/93‑3 (MQ=1)


                                                                              gggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtagg                         >  2:5556476‑M2/1‑74 (MQ=255)


                                                                              ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGCTCGggccggtgcgtggt                         >  2:1147686/4‑98 (MQ=11)


                                                                              ggatccgtcgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                         <  2:4316367/98‑1 (MQ=11)


                                                                               gatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGCCCGGGGGATGGgaagggtccggggct                        >  2:5258841/3‑96 (MQ=11)


                                                                                  ccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc                     <  1:4580646/101‑1 (MQ=11)


                                                                                  ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                     <  1:100380/101‑1 (MQ=14)


                                                                                  ccgggggctcggtcggATCCCCGGCATCTGTGGGATGCTTGGGATCGGCCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGCCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcg                     <  2:4375091/101‑2 (MQ=9)


                                                                                    gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                   >  2:1327625‑M2/1‑68 (MQ=255)


                                                                                      aggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTgg                 <  1:4361177/100‑1 (MQ=14)


                                                                                        ggcgcggcggCTCCGGGGGATTGGTCGAGTCCGTAGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGa               <  2:876664/94‑1 (MQ=11)


                                                                                        gatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg               >  1:3614316‑M2/1‑64 (MQ=255)


                                                                                          tccgggggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc             <  2:2345082/95‑1 (MQ=14)


                                                                                            cgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg           >  2:3596699/5‑101 (MQ=14)


                                                                                             gtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt          >  2:3739442‑M2/1‑59 (MQ=255)


                                                                                             gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgt          <  2:1857166/101‑1 (MQ=11)


                                                                                              tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg         <  1:120866‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                                                               gggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg        >  1:1710941/2‑101 (MQ=17)


                                                                                                gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgg       >  1:2635436/4‑101 (MQ=11)


                                                                                                ggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg       <  1:4210960‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                                ggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCAGGTCCGTGGGATAGGACGGGTCCGTCGTGTTCGTCGGGtacgtcgg       >  2:2265183/1‑101 (MQ=2)


                                                                                                  gtcCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat     >  1:4819508‑M2/2‑54 (MQ=255)


                                                                                                    ccGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg   >  2:2712980‑M2/1‑52 (MQ=255)


TCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCG  >  NC_014034/221906‑222106

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG