BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,021	G→A	22.9%	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,021	0	G→A	22.9%	0.0 ‑1.2 0.0	1865	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (195/233): ref base (696/737): total (891/974)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.95e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2306 total aligned reads displayed.


CATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221921‑222121


gatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                                                                      <  2:2708879‑M1/66‑1 (MQ=255)


  gccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                                    >  2:4129724‑M1/34‑101 (MQ=255)


   ccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                                   >  2:2606349‑M1/33‑101 (MQ=255)


     gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                                 <  1:500288‑M1/71‑1 (MQ=255)


       cggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                               <  1:4305897‑M1/73‑1 (MQ=255)


        ggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                              >  1:3477750‑M1/28‑101 (MQ=255)


          gggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                            <  2:484663/101‑1 (MQ=255)


          gggCGGCGAATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                            <  2:2033743/101‑1 (MQ=18)


            ctgtgcgcttcGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcg                                                                                          <  1:1562652/91‑1 (MQ=14)


            ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                                                                                          <  2:1972480‑M1/78‑1 (MQ=255)


              gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                        <  1:3598397/101‑1 (MQ=255)


                 ggagcggtggggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                     >  1:1654170‑M1/19‑101 (MQ=255)


                   accggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                                   >  1:4495557‑M1/17‑101 (MQ=255)


                    tcggTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                  <  1:521402/98‑1 (MQ=1)


                       gtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                               >  1:4385847‑M1/13‑101 (MQ=255)


                           ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                           >  1:1468412‑M1/9‑101 (MQ=255)


                           ggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGa                                                                           <  2:4235302‑M1/93‑1 (MQ=255)


                            atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGACCCGCgggct                                                                          >  1:2021312/8‑99 (MQ=1)


                             tcggtcggGTCGGTGGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                         <  2:2812526/101‑1 (MQ=11)


                               cgtgGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtggggtccg                                                                       >  1:5104321‑M1/5‑96 (MQ=255)


                                gtcggTTCTGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                      <  2:4511478/101‑1 (MQ=11)


                                 cgtgctcggtcggttccgggggatcggtcgtctccgtgggcTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                     <  2:3734146/96‑1 (MQ=11)


                                  gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcggtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgggcg                                                                    >  1:5723428/2‑101 (MQ=11)


                                  gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCCTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                    >  1:383898/2‑101 (MQ=14)


                                   gtatcgatggggtccgtgggaccggtcgcgtccgtgggACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                   <  2:17605/99‑1 (MQ=11)


                                     atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGat                                                                 <  1:136666‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                     atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCgggg                                                                 >  1:5336480/1‑100 (MQ=11)


                                      tccgtcgcgtccgtgggaccggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                <  2:3607744/98‑1 (MQ=14)


                                       cggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                               >  2:3082057/1‑101 (MQ=11)


                                       cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatcc                                                               <  1:3734374‑M2/101‑5 (MQ=255)


                                       cggtcgggtccgggggatcgggcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                               <  1:2692952/101‑1 (MQ=11)


                                       cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGCCGGGTCCGTGGGGTCGGCCGGGTCCGCGGGGGCGGTCGGGTCGGTGGGGTAGGTCggggca                                                               >  2:853018/1‑98 (MQ=2)


                                        ggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                              >  1:4030612/1‑101 (MQ=11)


                                        ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGGCCGTGGGATCTGTCGGGTACg                                                              >  2:594113/1‑101 (MQ=14)


                                        cgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                              <  1:3065639/100‑1 (MQ=14)


                                         gtgcggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                             <  2:385416/97‑1 (MQ=11)


                                           gggatccgtgggatcggtcgggtccgtaggatccgtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                           <  1:2926367/97‑3 (MQ=14)


                                           cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGGCCGTCGGATCCGtgg                                                           >  2:4307959/1‑99 (MQ=11)


                                           cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGtgg                                                           >  2:2234539/1‑99 (MQ=11)


                                            gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                          <  2:4618579/101‑1 (MQ=14)


                                            gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggg                                                          <  1:5628819‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                            gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagg                                                          <  1:2812687‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                             ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgagatc                                                         <  1:1719951‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                             gctctgtgggatcggtctggtcagtggggtccgtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                         <  2:1057113/96‑1 (MQ=11)


                                              tcttccgatctcggtcggagccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                        <  1:4113566/91‑1 (MQ=14)


                                              atccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGGCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGGTGGGTAGGAGCCGTGggct                                                        >  2:566329/2‑99 (MQ=2)


                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcg                                                      >  1:1105026‑M2/1‑88 (MQ=255)


                                                 cgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcgg                                                     >  2:157504/1‑101 (MQ=11)


                                                  gtgggctcggtcgtgtccgtggtgtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                    <  2:2493545/101‑1 (MQ=11)


                                                  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                    >  1:1949355/1‑101 (MQ=11)


                                                   tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtc                                                   <  2:5363083‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                   tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGatccgtgggatcggtc                                                   <  2:4382178‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                   cgggatcggtcggttccgtggtatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtccgtg                                                   <  2:2334551/100‑2 (MQ=11)


                                                    gggttcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                  <  1:840543/101‑1 (MQ=11)


                                                    gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                  <  1:2474641/101‑1 (MQ=11)


                                                      ggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGGGGtcgggcggt                                                >  2:2938116/6‑100 (MQ=11)


                                                      gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggt                                                <  2:3261505‑M2/101‑20 (MQ=255)


                                                      gatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggg                                                >  1:1832947/1‑101 (MQ=11)


                                                        tcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcggatc                                              >  1:611978/1‑101 (MQ=11)


                                                            tcgggtccgttgggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                          >  2:5455901‑M2/1‑76 (MQ=255)


                                                            tcggatccgtgggaccggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggtccgta                                          <  2:4745859/101‑2 (MQ=11)


                                                             cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgg                                         <  1:5509599‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                                              ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCAGTGGGATCGgcggggtccgtggg                                        >  2:3360319/4‑101 (MQ=11)


                                                              ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg                                        <  2:314142/98‑1 (MQ=11)


                                                               ggtccgtggggtccgtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAACGGTCGCATCCGTCGGAGCGGAGGGGTCCGTAGGCGCggt.gggtcagttcgct                                      >  2:805771/1‑96 (MQ=9)


                                                               ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                       <  1:1217833‑M2/101‑29 (MQ=255)


                                                               ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                       >  2:3943540‑M2/1‑73 (MQ=255)


                                                               gctcggtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgga                                       <  2:4042373/96‑2 (MQ=11)


                                                                  ccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc                                    <  1:4580646/101‑1 (MQ=11)


                                                                  ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                    <  1:100380/101‑1 (MQ=14)


                                                                  ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcg                                    >  1:3144406‑M2/1‑70 (MQ=255)


                                                                   cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGgtcgggtccgtgggagatc                                   >  2:1865217/1‑96 (MQ=11)


                                                                   cgtggcatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                   >  2:3480017‑M2/1‑69 (MQ=255)


                                                                    gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                  <  1:3943784‑M2/101‑34 (MQ=255)


                                                                     tgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                 >  2:4939663‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                                                      gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                >  1:2222338‑M2/1‑66 (MQ=255)


                                                                       gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTggg                               <  1:490359/95‑1 (MQ=11)


                                                                       ggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                               <  1:2606498‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                                       ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTCGGCTAGGGGGGCTCGGTCGGGTGCGTGGGGTGCGTcgg                               >  2:5555418/1‑101 (MQ=2)


                                                                         gtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGag                             >  2:1468319/5‑100 (MQ=11)


                                                                           cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtcc                           <  1:733032‑M2/101‑41 (MQ=255)


                                                                           cggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCCGTgggggcc                           >  1:5418249/1‑97 (MQ=11)


                                                                              cgatctCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc                        <  2:1667551/96‑1 (MQ=11)


                                                                               cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                       >  1:4804995‑M2/1‑57 (MQ=255)


                                                                                  gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                    >  2:1162392‑M2/2‑54 (MQ=255)


                                                                                  aTCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                    <  2:1273984/101‑1 (MQ=11)


                                                                                   tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                   >  2:70385‑M2/1‑53 (MQ=255)


                                                                                   tCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                   >  1:932886‑M2/1‑53 (MQ=255)


                                                                                    ccGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcc                  >  1:2107078‑M2/1‑52 (MQ=255)


                                                                                    ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                  >  2:5044442‑M2/1‑52 (MQ=255)


                                                                                      gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                <  2:2144790‑M2/101‑52 (MQ=255)


                                                                                        gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg              <  1:3354969‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                         ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTagg             >  2:5145008/1‑101 (MQ=14)


                                                                                           gtcggtcggGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt           <  1:4668293/100‑1 (MQ=17)


                                                                                           ctcggtcggGTCCGTTGGAGCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGGGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt           <  1:130119/100‑1 (MQ=14)


                                                                                           aTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTcgggt           >  2:5248816/1‑99 (MQ=14)


                                                                                            tcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc          <  2:1341548‑M2/101‑58 (MQ=255)


                                                                                              ggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccg        <  1:4231024‑M2/101‑60 (MQ=255)


                                                                                                 cggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg     >  1:2330857/1‑101 (MQ=17)


                                                                                                   ggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg   >  1:3246326/1‑101 (MQ=17)


CATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221921‑222121

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG