BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,027	G→C	11.5%	P210P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,027	0	G→C	11.5%	0.0 ‑0.5 ‑0.0	1880	P210P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (104/109): ref base (766/871): total (888/992)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.10e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2373 total aligned reads displayed.


GGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221928‑222127


ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                                     <  2:4110845/101‑1 (MQ=255)


cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                                     >  2:1415058‑M1/29‑101 (MQ=255)


cggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                                     <  1:599320‑M1/73‑1 (MQ=255)


  ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                                   >  1:5092939‑M1/27‑101 (MQ=255)


         gggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                            <  1:4641065‑M1/82‑1 (MQ=255)


          ggatcggtggggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                           >  1:1095037‑M1/19‑101 (MQ=255)


           gatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGa                                                                                          <  2:4385580‑M1/84‑1 (MQ=255)


                gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                     <  1:2436316/101‑1 (MQ=11)


                 tgggagcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc                                                                                    <  2:3228432/95‑2 (MQ=11)


                   ggCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                  <  1:1554660/101‑1 (MQ=255)


                    gatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCggcggg                                                                                 >  2:699247/3‑96 (MQ=11)


                     atccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                <  1:3038273‑M1/94‑1 (MQ=255)


                     atccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                <  1:4419333‑M1/94‑1 (MQ=255)


                       tggtcggGTCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                              <  2:1537354/100‑1 (MQ=255)


                        ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCAGTAGGAtcgg                                                                             >  2:596376/1‑101 (MQ=11)


                        ggtaggATCGGTCGGATCCTTTGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                             <  1:5705475/101‑1 (MQ=11)


                          tgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGtcggtc                                                                           >  2:1315628/3‑101 (MQ=11)


                          tgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                           <  1:426030‑M1/99‑1 (MQ=255)


                          gggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                           <  2:4724732/93‑1 (MQ=11)


                          cgtgctcggtcggttccgggggatcggtcgtctccgtgggcTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                           <  2:3734146/96‑1 (MQ=11)


                           gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                          >  2:3119045‑M1/2‑101 (MQ=255)


                              gtcggtcgggtccgtggggtccgtccgatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                       <  2:1949244/100‑1 (MQ=11)


                              gtcgggggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                       <  1:3577253/94‑3 (MQ=11)


                              atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcgaca                                                                       <  2:423420/101‑4 (MQ=11)


                               gtgggcgggtccgtgggatgggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                      <  1:2089635/96‑1 (MQ=11)


                                cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatcc                                                                     <  2:2820263‑M2/101‑5 (MQ=255)


                                cggtcgggtccgtcggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcagatcggaag                                                                     >  1:1291522/1‑91 (MQ=11)


                                ccgtcgggtccgtggggtcggtccggtccgtgggaccgGTCCGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  2:1724529/99‑1 (MQ=11)


                                ccggcggatccgtagggtcggtgggctccgtggggtctgtCGGCTCCGTCGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  2:4845814/97‑1 (MQ=11)


                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg                                                                    <  2:5372082‑M2/101‑6 (MQ=255)


                                  gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgt                                                                   >  1:3795063‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                  ggcgggtccgggggagcggtcgggtccgtgggatcggtGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                   <  1:827932/99‑1 (MQ=11)


                                  ggcggatccgtgggatcgggcggggccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                   <  1:3310138/99‑1 (MQ=11)


                                  gcggggtccgtggggtcggtcgggtccgggggttccgtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGt                                                                   <  1:912349/98‑1 (MQ=11)


                                   tcgggtccgggggatcggtcgggtcggtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                                  <  1:1210254/101‑2 (MQ=11)


                                    ggggtccgggggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                 <  1:3987331/100‑3 (MQ=14)


                                    cgggtccgttggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                 <  2:2703253/101‑3 (MQ=14)


                                    cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGGCCGTCGGATCCGtgg                                                                 >  2:4307959/1‑99 (MQ=11)


                                    cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                 <  1:3234987/101‑3 (MQ=14)


                                     gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                <  2:4618579/101‑1 (MQ=14)


                                     gggcccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATGGGCCGGGTGCGGGGGAAGGGTCGCGGCCTTGGCGTGGGCCGGGTCCGtgga                                                                >  2:344689/1‑98 (MQ=2)


                                     aggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggg                                                                <  2:2022370‑M2/100‑10 (MQ=255)


                                      ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggctcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                               <  2:3943671/101‑1 (MQ=11)


                                      ggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagga                                                               >  2:5460943‑M2/1‑91 (MQ=255)


                                      gatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTCCGTGGGa                                                               >  2:45200/3‑101 (MQ=11)


                                      gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga                                                               <  1:5293186‑M2/99‑11 (MQ=255)


                                        tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatc                                                             <  1:144819‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                           ggtggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                          <  2:5681462/98‑1 (MQ=14)


                                              ggatcggtcgggtcgggggggtccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                       <  1:1939786/101‑1 (MQ=11)


                                              ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGtcggtagg                                                       >  2:3854849/1‑101 (MQ=11)


                                                atccgtgggatcggtcgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                                                     <  1:2687832/101‑1 (MQ=14)


                                                  cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc                                                   <  2:5146147/101‑1 (MQ=255)


                                                     gcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc                                                <  1:5393829/100‑1 (MQ=11)


                                                       gggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtagg                                              >  2:5556476‑M2/1‑74 (MQ=255)


                                                       gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGCTCGgtcggggccgtggg                                              >  1:2905057/1‑101 (MQ=11)


                                                        ggtccgtggggtccgtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAACGGTCGCATCCGTCGGAGCGGAGGGGTCCGTAGGCGCggt.gggtcagttcgct                                            >  2:805771/1‑96 (MQ=9)


                                                        ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                             >  1:5182766‑M2/1‑73 (MQ=255)


                                                        gatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGCCCGGGGGATGGgaagggtccggggct                                             >  2:5258841/3‑96 (MQ=11)


                                                         atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGACCGGCCGGGTCCGTAGGCTCGggcgggtccgtcggct                                            >  1:3893104/2‑99 (MQ=14)


                                                           ccgtgggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                          <  1:100380/101‑1 (MQ=14)


                                                           ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                                          >  2:2230037‑M2/1‑70 (MQ=255)


                                                            cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                         <  1:3680644‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                                            cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTGCGGtcgggtccgtggggtccg                                         >  1:5607738/1‑101 (MQ=11)


                                                             gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggcccgt                                        >  2:1245045/1‑101 (MQ=11)


                                                             gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcggggccgtggggtccgc                                        >  1:2207578/1‑100 (MQ=11)


                                                              taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTg                                       >  2:2120871/3‑101 (MQ=14)


                                                               gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGacccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                      <  1:4979941‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                                               gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                      <  2:2326511‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                                               gggatcgggcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTACGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCCGTgg                                      <  1:4884471/101‑1 (MQ=11)


                                                                 ggtcgggcggatCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                    >  1:4175608‑M2/3‑64 (MQ=255)


                                                                  gtcggctgcgtCCGTCGGAACTGTGGGGTGGCTGGGATTGGTCGGGGCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAt                                   <  1:344733/91‑1 (MQ=0)


                                                                  atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                   >  1:4332252‑M2/1‑63 (MQ=255)


                                                                     cgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                <  2:2482203/97‑1 (MQ=14)


                                                                      gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                               <  1:1712459/101‑1 (MQ=14)


                                                                       tgggATCGGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                              <  2:863580/99‑1 (MQ=255)


                                                                          ggtccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                           <  1:182838‑M2/99‑47 (MQ=255)


                                                                          gATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGa                           <  1:3113207/101‑1 (MQ=11)


                                                                          gAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggga                           >  1:2569904‑M2/1‑55 (MQ=255)


                                                                              cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                       >  2:1847127/1‑101 (MQ=14)


                                                                               gtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                      >  1:2774375/4‑101 (MQ=17)


                                                                               gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggg                      <  2:3595687‑M2/101‑52 (MQ=255)


                                                                                taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc                     <  1:476235/99‑2 (MQ=14)


                                                                                ggggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                     <  1:4541385/100‑1 (MQ=14)


                                                                                  gggtccgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                   <  1:1639060/92‑1 (MQ=18)


                                                                                  ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                   <  2:5038015/101‑1 (MQ=14)


                                                                                   gATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgga                  <  1:2318489‑M2/101‑56 (MQ=255)


                                                                                      cgggggggTCCTTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg               <  2:1010867/96‑1 (MQ=14)


                                                                                       ggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg              <  2:3315289‑M2/101‑60 (MQ=255)


                                                                                       ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg              >  2:1131421/1‑101 (MQ=17)


                                                                                        ggggggGCCGTCGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggt             <  1:4076400/98‑1 (MQ=14)


                                                                                         tcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg            <  1:1999128‑M2/101‑62 (MQ=255)


                                                                                          cggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg           >  1:718301/1‑101 (MQ=17)


                                                                                           ggatCCGTAGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg          >  2:3065465/4‑101 (MQ=14)


                                                                                             gTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggat        >  2:1636600‑M2/1‑36 (MQ=255)


                                                                                              tccgtggggtcggtgggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatc       >  1:1360194‑M2/1‑35 (MQ=255)


                                                                                              tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc       >  2:4030365‑M2/1‑35 (MQ=255)


                                                                                               ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg      >  1:5495228‑M2/1‑34 (MQ=255)


                                                                                                 gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggt    <  2:260528‑M2/101‑70 (MQ=255)


                                                                                                  tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc   >  2:4947479‑M2/1‑31 (MQ=255)


                                                                                                   gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcg  <  2:2954158‑M2/101‑72 (MQ=255)


GGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221928‑222127

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG