BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,093	A→G	1.6%	D188D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,093	0	A→G	1.6%	8.6 ‑1.0 ‑0.4	542	D188D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/8): ref base (232/299): total (235/307)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.64e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.45e-01

Only 100 of 652 total aligned reads displayed.


GATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCG  >  NC_014034/221993‑222193


 gtccgggggATCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                                     <  1:310716/94‑1 (MQ=17)


 gtccggcggATCCGTGGGGTCCGGCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAt                                                                                                     <  1:1333016/95‑1 (MQ=11)


  tcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGtc                                                                                                    <  1:4245902/101‑1 (MQ=11)


  tccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtc                                                                                                    >  2:5293375/4‑101 (MQ=11)


  tccgggggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                                    <  2:2345082/95‑1 (MQ=14)


   cggtcggGTCCGTGGGATCGTGTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                   <  1:2506777/101‑1 (MQ=11)


   cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGTGTCGGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                   <  2:1979556/101‑1 (MQ=14)


   cggtcggATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcc                                                                                                   <  2:3940706/101‑2 (MQ=11)


   ccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAGCGGTCGGGGGCGTCGCGTCCGTGGGAtcg                                                                                                   >  2:1537444/6‑101 (MQ=9)


   ccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcc                                                                                                   <  2:289137/99‑2 (MQ=11)


   ccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcc                                                                                                   <  1:536058/99‑2 (MQ=11)


    cgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                                  <  1:3373930/97‑1 (MQ=14)


    cgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                                  >  1:1559958/5‑101 (MQ=14)


     gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                 >  1:662365/4‑101 (MQ=14)


     gtcggATCGCTGGTACCGGTGTGTTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgt                                                                                                 <  2:542442/101‑1 (MQ=11)


      tgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                <  2:3243311/99‑1 (MQ=17)


       cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                               <  1:3837058/101‑1 (MQ=14)


       cgcaTCCGTATGAGCGGGAGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGtccgtcg                                                                                               <  2:844931/98‑1 (MQ=2)


        gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                              >  1:260756/4‑101 (MQ=11)


        gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                              >  1:2194280/4‑101 (MQ=14)


        ggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                              >  2:112852/1‑101 (MQ=17)


        ggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                                                                                              <  1:2978759/101‑1 (MQ=11)


        ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtggg                                                                                              >  2:4500502/1‑101 (MQ=11)


         ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                                                                                             >  2:5765725/3‑100 (MQ=14)


         ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtgggtcggg                                                                                             >  1:4519160/3‑100 (MQ=17)


         gATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGa                                                                                             <  1:1731677/101‑1 (MQ=11)


          gtCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt                                                                                            <  1:396677/100‑3 (MQ=14)


          gtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgggg                                                                                            >  1:2378664/2‑99 (MQ=14)


          aTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGATCCGTGGGAt                                                                                            >  1:5648149/1‑101 (MQ=11)


            cgggcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                          <  1:594171/96‑1 (MQ=18)


            ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCAGATcg                                                                                          >  1:1667650/1‑100 (MQ=14)


            ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGACGGGTGCGTGGGATGGGTGGGATCCGTAGGGACAGTGAAAacggtcgggtac                                                                                          >  2:897257/1‑97 (MQ=11)


            ccGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                          <  1:3281131/101‑1 (MQ=11)


            ccGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                          >  2:1913889/1‑101 (MQ=14)


             cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCCTGGGAtcggtcgggcccg                                                                                         >  1:5699862/1‑96 (MQ=11)


             cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                         >  2:1847127/1‑101 (MQ=14)


             cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                         >  2:493194/1‑101 (MQ=14)


              gtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                        >  1:2774375/4‑101 (MQ=17)


              gtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                        <  1:5481442/98‑1 (MQ=18)


              gcaggATCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                        <  2:3588556/98‑1 (MQ=14)


              gTGGGATCGGTCGGGTGCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                        <  1:4606649/101‑1 (MQ=14)


              gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg                                                                                        >  1:5400310/1‑100 (MQ=14)


                cggctccgtcggTTTCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                      <  2:5108757/94‑1 (MQ=18)


                 ggATGGGTGGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg                                                                                     <  1:2029625/101‑1 (MQ=14)


                 ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg                                                                                     >  1:1047048/1‑101 (MQ=14)


                 ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                     >  1:1433572/1‑101 (MQ=255)


                 ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGGTCCGTggg                                                                                     >  2:2107564/1‑101 (MQ=17)


                  gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                    >  1:4027943/1‑101 (MQ=17)


                     cggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                                                                                 <  2:2230143/101‑1 (MQ=14)


                     cgggggggTCCTTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                 <  2:1010867/96‑1 (MQ=14)


                      cgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                >  2:2476782/5‑101 (MQ=255)


                       gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                               >  2:2153388/4‑101 (MQ=255)


                         cggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg                                                                             <  2:425986/101‑1 (MQ=17)


                          gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                            >  1:4109330/1‑101 (MQ=17)


                          gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGAtcggtcgg                                                                            >  2:681693/1‑101 (MQ=17)


                          ggatCCGTAGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                                                            >  2:3065465/4‑101 (MQ=14)


                           gttgcGTGGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                                                           <  2:776428/97‑1 (MQ=14)


                            gTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                          >  2:5023888/1‑101 (MQ=17)


                            gTCCGTCGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                          <  2:4590301/101‑1 (MQ=17)


                             tCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTAGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                         <  2:3168522/101‑1 (MQ=18)


                             tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGGCGGGTc                                                                         >  1:2883464/1‑101 (MQ=11)


                              ccGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc                                                                        >  2:1628551/1‑101 (MQ=17)


                                gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGt                                                                      >  1:1949722/1‑101 (MQ=17)


                                 tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGta                                                                     <  1:963172/101‑2 (MQ=17)


                                   ggATCGGTTGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                   <  2:2770041/101‑1 (MQ=255)


                                     gtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                                                 <  1:2709028/100‑3 (MQ=14)


                                     aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCGGTGGGGCCCGCGGCGTCGGTGGCGGGCGTggggt                                                                 >  2:4200935/1‑100 (MQ=11)


                                      tcggtcggATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatc                                                                <  2:5645548/101‑4 (MQ=14)


                                       ctgtcggGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcg                                                               <  1:5218902/99‑5 (MQ=14)


                                        ggtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg                                                              <  2:4078165/101‑6 (MQ=14)


                                          tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                                                            <  1:1847237/101‑8 (MQ=11)


                                            gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGCggg                                                          >  2:4010723/4‑101 (MQ=255)


                                             ggaccGTGGGATGGGGGGGGGCGGTAGGATCTGTCGGGTCCGCCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa                                                         <  1:3539023/98‑1 (MQ=18)


                                              gtCCGTGGGGTCCGTTGGGCCCGGGGGATCGGTGGGGTCCGGCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAt                                                        <  2:558596/100‑1 (MQ=18)


                                                ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcg                                                      >  2:3024191/1‑101 (MQ=255)


                                                 cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcgg                                                     >  1:3449220/1‑101 (MQ=255)


                                                  gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggt                                                    <  1:1275705/101‑1 (MQ=255)


                                                  gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggt                                                    >  1:2118838/1‑101 (MQ=255)


                                                  gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGCGCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCATCGGGCTGGTGGGCtcggc                                                    >  2:5196096/1‑100 (MQ=21)


                                                   tGGGATGGGTCGGGTGCGTACGGTGCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtc                                                   <  2:1290869/101‑1 (MQ=18)


                                                      gATCGGTCGGGTCCGTAGGGTCGGTCGGGTCCTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGa                                                <  2:1742173/101‑1 (MQ=255)


                                                      gATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtcggc                                                >  2:4459167/1‑100 (MQ=255)


                                                        tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAcc                                              <  1:320172/101‑1 (MQ=255)


                                                         cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCg                                             >  1:92421/1‑101 (MQ=255)


                                                          ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGc                                            >  1:3061479/1‑101 (MQ=255)


                                                            tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTg                                          <  2:3449015/101‑1 (MQ=255)


                                                             cggGTCCGTGGGATTGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGCCCGTGGGATCGGTCGGCCCCGTAGGGTCGGTGGGGCCGGTCGGGccagggg                                         >  2:1456474/1‑96 (MQ=2)


                                                             cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGt                                         <  2:380805/101‑1 (MQ=255)


                                                                 tttgTAGGACCTGTGGGTTCCGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCTGATCCGGGGGATCTGTCTGGTCCGTGGGGCTGGTTGGATCGGTCGGACCGCTGTcgcc                                     <  1:4764048/98‑1 (MQ=18)


                                                                   ngTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGNnnncnn                                   >  1:837300/2‑99 (MQ=255)


                                                                    gTAGGATAGGGTGGGTCCGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgcc                                  <  1:369348/101‑1 (MQ=25)


                                                                       ggATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCgccgccgcc                               <  1:5024169/101‑1 (MQ=255)


                                                                        gATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGccgccgccg                              <  1:4459439/101‑1 (MQ=255)


                                                                               cgggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAc                       >  2:2560089/1‑101 (MQ=255)


                                                                                   tctgccgggtccgtGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAg                   <  2:4333896/96‑1 (MQ=255)


                                                                                   tccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAg                   >  1:1206364/1‑101 (MQ=255)


                                                                                       gcggggccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccg               <  2:1226811/100‑1 (MQ=255)


                                                                                         gggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggc             >  2:5362567/1‑101 (MQ=255)


                                                                                          ggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggcc            <  2:136646/101‑1 (MQ=255)


                                                                                                   gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCTCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGcc   >  1:4931545/1‑101 (MQ=255)


GATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCG  >  NC_014034/221993‑222193

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG