Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 2,123,403 | Δ1 bp | 96.4% | coding (769/1077 nt) | wza ← | polysaccharide export protein Wza |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 2,123,403 | 0 | A→. | 96.4% | 13.6 ‑1.0 ‑1.0 | 158 | coding (769/1077 nt) | wza | polysaccharide export protein Wza |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (81/71): ref base (4/1): total (85/73) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.76e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.01e-01 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
ACGAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAAGGGCTTGA.C.ATTTGGGCCAACAAATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGC > NC_014034/2123303‑2123498
|
aCGAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGa > 2:3597796/1‑101 (MQ=255)
cGAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGag > 2:3767012/1‑100 (MQ=255)
cGAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGag > 2:1041684/1‑100 (MQ=255)
cGAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGag > 1:3436779/1‑100 (MQ=255)
gAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGagg > 2:4000397/1‑99 (MQ=255)
gAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGagg > 2:1040317/1‑99 (MQ=255)
gAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCAGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTAGagg > 1:638103/1‑99 (MQ=255)
aaGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAGgg > 1:872713/1‑101 (MQ=255)
aaGATACCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAGgg > 2:1201863/1‑101 (MQ=255)
aGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAGggc > 1:1098217/1‑100 (MQ=255)
taTGCCGCGGGCATAGGCTTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTAATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCt < 2:2799598/100‑1 (MQ=255)
aTGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCtt > 2:3089190/1‑101 (MQ=255)
aTGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCtt > 2:2443857/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGCCCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTg > 1:2386507/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGCGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTg < 2:1487319/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.c > 1:3407953/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.cg < 1:506328/101‑2 (MQ=255)
cgGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.cgat > 1:3161360/1‑98 (MQ=255)
ggCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGCTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.cgatct < 1:3621334/101‑6 (MQ=255)
cATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.cgatctgg > 1:2339248/1‑94 (MQ=255)
cATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.cgatctgg < 2:2559740/101‑8 (MQ=255)
tCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.cgatctggcc > 1:1179005/1‑92 (MQ=255)
tCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.cgatctggcc < 2:2566675/101‑10 (MQ=255)
tCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.cgatctggcc < 2:1989286/101‑10 (MQ=255)
cGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.cgatctggccc > 2:894946/1‑91 (MQ=255)
cGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.cgatctggccc > 1:2598316/1‑91 (MQ=255)
tCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATa > 2:3600092/1‑101 (MQ=255)
tCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGACTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATa > 1:2061258/1‑101 (MQ=255)
ccTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAg < 1:3167981/101‑1 (MQ=255)
tCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGc < 2:373253/101‑1 (MQ=255)
cGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcc < 2:2876582/101‑1 (MQ=255)
cGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcc > 2:126344/1‑101 (MQ=255)
ggCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcct < 1:2776717/101‑1 (MQ=255)
ggCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcct < 1:2440149/101‑1 (MQ=255)
gCCTGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctc < 1:2910113/101‑1 (MQ=255)
gCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctc < 2:4208559/101‑1 (MQ=255)
gCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCACCTGGGTCAGTGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctc < 2:2386331/101‑1 (MQ=255)
ccAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctcc > 1:1387374/1‑101 (MQ=255)
ccAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctcc > 2:1804017/1‑101 (MQ=255)
cAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctcct > 2:3055976/1‑101 (MQ=255)
cAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctcct < 1:933879/101‑1 (MQ=255)
cAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGcctcct < 2:2668633/101‑1 (MQ=255)
aGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTg > 2:2985426/1‑101 (MQ=255)
ccgccgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCAc < 1:708298/101‑1 (MQ=255)
gccgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCg < 2:3955401/101‑1 (MQ=255)
cgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTc > 2:4114877/1‑101 (MQ=255)
cgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTc < 2:2598125/101‑1 (MQ=255)
cgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTc < 1:2563113/101‑1 (MQ=255)
cgACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTc > 2:155401/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGATG.ATTTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTgc > 1:3623517/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTgc < 1:1016491/101‑1 (MQ=255)
gcgGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTgcc > 2:179472/1‑101 (MQ=255)
tGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCg < 2:2365378/101‑1 (MQ=255)
tGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCg < 1:3801051/101‑1 (MQ=255)
tGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCg < 1:108304/101‑1 (MQ=255)
tGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCg < 1:2152240/101‑1 (MQ=255)
aTCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGAc > 1:3720203/1‑101 (MQ=255)
aTCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGAc < 1:602162/101‑1 (MQ=255)
cGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGc > 1:1854908/1‑101 (MQ=255)
gCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCt < 2:3623264/101‑1 (MQ=255)
gCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCt < 2:766324/101‑1 (MQ=255)
ccTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTg > 2:2663724/1‑101 (MQ=255)
ccTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTg < 2:1947723/101‑1 (MQ=255)
cTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTga < 1:155425/101‑1 (MQ=255)
cTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTga > 1:3944953/1‑101 (MQ=255)
cTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTga > 1:125522/1‑101 (MQ=255)
cTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTga > 1:2818084/1‑101 (MQ=255)
cTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGACAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTga > 1:3649746/1‑101 (MQ=255)
tGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTgac > 2:3331902/1‑101 (MQ=255)
tGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTgac > 2:2063382/1‑101 (MQ=255)
tCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACa > 1:763882/1‑101 (MQ=255)
cAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACAt < 1:3680181/101‑1 (MQ=255)
aGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATc > 1:1772331/1‑101 (MQ=255)
aGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATc > 1:3195610/1‑101 (MQ=255)
aGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATc > 2:1434798/1‑101 (MQ=255)
aGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATc < 1:1838359/101‑1 (MQ=255)
gTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGcc < 2:125498/101‑1 (MQ=255)
aTGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGtt > 2:1592459/1‑101 (MQ=255)
gTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGtttt < 1:3446718/101‑1 (MQ=255)
gTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGtttt < 1:3860190/101‑1 (MQ=255)
gTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGtttt > 1:2275432/1‑101 (MQ=255)
ttCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgca > 2:489344/1‑101 (MQ=255)
tCCAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgcag < 1:3056201/101‑1 (MQ=255)
ccAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgcagc < 1:179510/101‑1 (MQ=255)
ccAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgcagc > 2:2635925/1‑101 (MQ=255)
cAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgcagca < 1:1114624/101‑1 (MQ=255)
cAGCGTCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTgcagca > 1:3854751/1‑101 (MQ=255)
tCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCggg > 1:4081803/1‑101 (MQ=255)
tCAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCggg > 1:1413163/1‑101 (MQ=255)
cAGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCgggc > 1:2535253/1‑100 (MQ=255)
aGATCGATCGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgtt < 1:2454964/101‑1 (MQ=255)
gatcgatcGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgttg > 1:4135362/1‑101 (MQ=255)
gatcgatcGTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgttg > 2:1165923/1‑101 (MQ=255)
atcgatcgTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgttgt > 2:1789255/1‑101 (MQ=255)
atcgatcgTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGgttgt > 1:396954/1‑101 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGttgttg > 1:1518857/1‑101 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGttgttg > 1:2792539/1‑101 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGttgttg > 2:3141272/1‑101 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGctgttg > 2:3414463/1‑101 (MQ=255)
cgatcgTCG.AGGGCTTGA.CGATCTGGCCCAGCAGATAGGCCTCCCGCACCGTCTGCCGCCGGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGtggttg > 2:4022478/1‑101 (MQ=255)
|
ACGAAGATGCCGCGGGCATCGGCCTTGTCCTCGGCCAGACCGCCGACGCGGGTGATCGCCTGGGTCAGGGTGATGTTTTCCAGCGTCAGATCGATCGTCGAAGGGCTTGA.C.ATTTGGGCCAACAAATAGGCCTCCTGCACCGTCTGCCGCCCGACGCTGACGACATCGCCGTTTTGCAGCACCGGGTTGTTGGCGC > NC_014034/2123303‑2123498
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|