Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,823,740 | +C | 100% | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687 → / → RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,823,740 | 1 | .→C | 100.0% | 30.9 | 144 | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687/RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (83/49): ref base (0/12): total (83/61) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.68e-05 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.13e-01 |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.C.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCC > NC_014034/1823640‑1823835
|
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.c.c < 2:1124261/101‑1 (MQ=255)
gCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.c.ccc < 1:740546/101‑2 (MQ=255)
cGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.c.cccg < 1:1446239/101‑3 (MQ=255)
cGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.c.cccg < 2:2791943/101‑3 (MQ=255)
aGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.c.cccggc < 2:3814887/101‑5 (MQ=255)
gCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.c.cccggct < 1:3813848/101‑6 (MQ=255)
cAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTg > 2:1778697/1‑101 (MQ=255)
cAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTg < 2:2747342/101‑1 (MQ=255)
cAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTg < 2:783694/101‑1 (MQ=255)
aGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTgcc < 1:4199422/101‑1 (MQ=255)
aGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTgcc > 2:615220/1‑101 (MQ=255)
gCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTgccg < 1:312876/101‑1 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTgccgcc < 2:2316645/101‑1 (MQ=255)
ggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGccgccg < 1:1772675/101‑1 (MQ=255)
ggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGccgccg > 1:3372015/1‑101 (MQ=255)
gTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCgg < 1:1205891/101‑1 (MQ=255)
tGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGt > 2:2098994/1‑101 (MQ=255)
tGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGt < 2:2394656/101‑1 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGtt < 1:1100306/101‑1 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGtt > 2:3935889/1‑101 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTc < 2:3979469/101‑1 (MQ=255)
gcggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCg < 2:2915697/101‑1 (MQ=255)
ggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGcc > 1:8402/1‑101 (MQ=255)
ggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGcc > 1:4038873/1‑101 (MQ=255)
gcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCg < 2:4146566/101‑1 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCgg > 2:1804228/1‑101 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGttagatcgg > 2:2292821/1‑94 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGt > 2:2650471/1‑101 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGt < 2:2055071/101‑1 (MQ=255)
tGTCAGCGTTTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCGGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTcg < 2:1201816/101‑1 (MQ=255)
tGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTcg > 2:3966398/1‑101 (MQ=255)
tGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTcg > 2:386121/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTcggg < 2:143581/101‑1 (MQ=255)
gCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcgg > 1:300982/1‑101 (MQ=255)
cGATTTCGCCGCGATTAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGATCGCCGGTcgggcggc > 2:1359549/1‑100 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGGCgggggggc > 1:3954290/1‑101 (MQ=255)
tCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcgg < 1:1670480/101‑1 (MQ=255)
cgccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcggg > 1:252372/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcggg > 1:3452587/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcggg < 1:615284/101‑1 (MQ=255)
cgcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCtt < 1:2932400/101‑1 (MQ=255)
gcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTc < 2:1063082/101‑1 (MQ=255)
cgATCAAGCGGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTACCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.C.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTcc < 1:652184/101‑1 (MQ=255)
gATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCg > 2:2975253/1‑101 (MQ=255)
tCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGc > 2:1211996/1‑101 (MQ=255)
caggCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGTcc < 1:3130553/98‑1 (MQ=255)
cAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCGCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGcc < 1:1069327/101‑1 (MQ=255)
acgCTGTTGAAGTTGGCCACCTCGAATCGGACGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.C.CACCGG.CCCCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGTGGGGGCGGGCTTCCGGCCg < 2:682842/99‑1 (MQ=255)
aGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGc > 1:2607436/1‑101 (MQ=255)
gCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGAA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCt > 2:3277426/1‑101 (MQ=255)
tGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTACGGNCGCTGc > 1:2095017/1‑101 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc > 1:235171/1‑101 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc > 2:2879634/1‑101 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 2:967196/101‑1 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 1:3421061/101‑1 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCGCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 2:1962240/101‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa < 1:1400359/101‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa < 1:2848862/101‑1 (MQ=255)
gAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAg > 1:754706/1‑101 (MQ=255)
gAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAg < 1:2099132/101‑1 (MQ=255)
gAAGTTGGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAg < 1:625916/101‑1 (MQ=255)
aGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct > 2:1498673/1‑101 (MQ=255)
aGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgct > 2:3258107/1‑101 (MQ=255)
gTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGCCACC.C.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctg < 1:2756581/101‑1 (MQ=255)
tttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgc > 2:3692132/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgc > 2:2472552/1‑101 (MQ=255)
ttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.C.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgct < 1:1778816/101‑1 (MQ=255)
ttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgct > 1:2247438/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctc > 1:3294027/1‑101 (MQ=255)
cgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccct > 2:3421385/1‑101 (MQ=255)
gccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc > 2:1765588/1‑101 (MQ=255)
tcTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc < 2:3922411/100‑1 (MQ=255)
ccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc > 2:1838238/1‑101 (MQ=255)
cgcGTAACGGGCGGTGAGGGGGCCGGGGGCACC.C.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg < 2:2937407/99‑1 (MQ=255)
cTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGAA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg > 1:3864151/1‑101 (MQ=255)
tCGTAGCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgt < 2:2512847/101‑1 (MQ=255)
tCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgt > 1:2513031/1‑101 (MQ=255)
tCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgt > 1:3810657/1‑101 (MQ=255)
cGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctccaga > 1:3922671/1‑98 (MQ=255)
cGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTTCCtccgtc > 2:4128753/1‑101 (MQ=255)
gTAGCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.C.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 2:1651233/101‑1 (MQ=255)
tAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg > 2:2566556/1‑101 (MQ=255)
tAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg > 1:1601701/1‑101 (MQ=255)
agcGGGGGGTGAGGGGGNGGGGGGCACC.C.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa < 2:745985/99‑1 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.C.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa < 2:3466802/101‑1 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa > 1:2619297/1‑101 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa > 2:2613426/1‑101 (MQ=255)
cGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGt > 1:1940673/1‑101 (MQ=255)
gggCGGTGAAGGGGCGGGGGGCACC.C.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTg < 1:3682021/101‑1 (MQ=255)
gggCGGTGAAGGGGCCGAGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGGCGGTCGGACGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTg > 2:3516701/1‑101 (MQ=255)
ggCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTgg > 2:4029382/1‑101 (MQ=255)
ggTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCgg > 2:2918381/1‑101 (MQ=255)
tagaGGGGCGGGGGGCA.A.C.CCGGCCTTCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTg < 2:300937/98‑1 (MQ=255)
gAAGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGc > 2:251361/1‑101 (MQ=255)
aGGGGCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCgg > 2:1280431/1‑101 (MQ=255)
gggCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCgggg > 2:503934/1‑101 (MQ=255)
ggCCGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCggggg > 1:784302/1‑100 (MQ=255)
gCCGGGGGCACC.C.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTc < 2:564377/101‑1 (MQ=255)
cGGGGGCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg < 1:1830992/101‑1 (MQ=255)
ggCA.ACC.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGcc > 2:2001719/1‑101 (MQ=255)
|
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.C.CCGG.CTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCC > NC_014034/1823640‑1823835
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 32 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|