Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,948,851 | +G | 90.0% | coding (1069/2472 nt) | quiP ← | acyl‑homoserine‑lactone acylase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,948,851 | 1 | .→G | 90.0% | 65.6 0.0 ‑0.5 | 219 | coding (1069/2472 nt) | quiP | acyl‑homoserine‑lactone acylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (80/117): ref base (9/13): total (89/130) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.08e-01 |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
TGATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.GCCC.ACCCTCGGGGCTGCGGTA.CGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGC > NC_014034/1948751‑1948943
|
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cGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggccc > 2:2132536/1‑100 (MQ=255)
gACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggccca > 1:3319710/1‑99 (MQ=255)
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gcagcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCAGCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggcccaaccc < 2:418464/101‑7 (MQ=255)
cagcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggcccaaccct < 2:2377801/101‑8 (MQ=255)
agcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggcccaaccctc > 1:2581584/1‑93 (MQ=255)
agcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggcccaaccctc > 2:2462170/1‑93 (MQ=255)
gcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCAGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCg > 2:1160257/1‑101 (MQ=255)
aCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCggg > 2:3600615/1‑101 (MQ=255)
cGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGc < 2:432524/101‑1 (MQ=255)
gggCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCCCCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCt < 1:2818742/101‑1 (MQ=255)
gggCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCt > 2:1452723/1‑101 (MQ=255)
gggCCGTTTGCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCt < 2:3649932/101‑1 (MQ=255)
ggCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTg > 2:2028639/1‑101 (MQ=255)
ggCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTg > 2:3232979/1‑101 (MQ=255)
gCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGc > 2:2768541/1‑101 (MQ=255)
cGTTTTCGGTCCAGAGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCgg > 2:1839370/1‑101 (MQ=255)
gTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGt > 1:1085659/1‑101 (MQ=255)
ttttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTa > 2:2232723/1‑101 (MQ=255)
ttttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTa > 2:2918356/1‑101 (MQ=255)
ttttCGGTCCAGCGCAGGGGGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTa > 1:2089947/1‑101 (MQ=255)
tttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTag > 1:847762/1‑100 (MQ=255)
tttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGGGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGtcg > 2:1584901/1‑99 (MQ=255)
ttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTagc < 2:3063624/101‑3 (MQ=255)
ttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTagc < 1:1430727/101‑3 (MQ=255)
tCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTagcg > 2:3535934/1‑98 (MQ=255)
tCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTagcg > 2:3833969/1‑98 (MQ=255)
ggTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTagcgct > 2:3737210/1‑96 (MQ=255)
ggTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGGGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTagcgcc > 1:1902747/1‑96 (MQ=255)
gTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTc < 2:2340641/101‑1 (MQ=255)
gTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGCCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTc < 1:266559/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCggg > 1:3106814/1‑101 (MQ=255)
aGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGc < 1:1448510/101‑1 (MQ=255)
aGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGc < 1:566646/101‑1 (MQ=255)
cgcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGt < 1:1866582/101‑1 (MQ=255)
cgcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGt > 1:580552/1‑101 (MQ=255)
gcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtt < 2:1531691/101‑1 (MQ=255)
cAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGttt > 1:2268553/1‑101 (MQ=255)
cAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGttt > 1:3697491/1‑101 (MQ=255)
cAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGttt < 2:1869721/101‑1 (MQ=255)
gggtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGAGCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTc < 2:693690/101‑1 (MQ=255)
gggtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTc < 2:2153755/101‑1 (MQ=255)
gggtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTc < 1:2311289/101‑1 (MQ=255)
tgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGa > 1:44770/1‑101 (MQ=255)
gagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGAt > 2:3972019/1‑101 (MQ=255)
gagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGAt < 1:888891/101‑1 (MQ=255)
agggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATc < 1:3982258/101‑1 (MQ=255)
ggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCaa < 1:3667904/101‑1 (MQ=255)
gtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAg < 1:3874755/101‑1 (MQ=255)
gaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGtt < 2:1322607/101‑1 (MQ=255)
gaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGtt < 1:1556332/101‑1 (MQ=255)
gaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGtt > 1:978601/1‑101 (MQ=255)
gaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGtt > 2:3509829/1‑101 (MQ=255)
aTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTc < 2:1741809/101‑1 (MQ=255)
cGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCt < 2:2581393/101‑1 (MQ=255)
cGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCt < 1:1287187/101‑1 (MQ=255)
gcgcGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcg < 1:4133944/101‑1 (MQ=255)
cgGCATCCTTGGCCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcgacg < 1:3295346/101‑1 (MQ=255)
ggCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcgacga > 2:1777868/1‑101 (MQ=255)
gCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGaa > 2:3097497/1‑101 (MQ=255)
gCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGaa < 2:659651/101‑1 (MQ=255)
gCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGaa > 1:1801764/1‑101 (MQ=255)
tCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAg > 2:853226/1‑101 (MQ=255)
cTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGCTCAAGTTCCTCGACGAACAggc > 2:564488/1‑100 (MQ=255)
cTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGt > 2:3305237/1‑101 (MQ=255)
cTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGt < 2:3717081/101‑1 (MQ=255)
ttGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTc > 2:1076745/1‑101 (MQ=255)
ttGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTc > 2:3216675/1‑101 (MQ=255)
gACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCt > 1:3928356/1‑101 (MQ=255)
ctccGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCt < 2:1590325/99‑1 (MQ=255)
aCCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTc < 1:1746728/101‑1 (MQ=255)
aCCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTc < 2:167486/101‑1 (MQ=255)
aCCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTc < 2:2727499/101‑1 (MQ=255)
ccGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCtag > 1:1590434/1‑99 (MQ=255)
cGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGt > 1:4148420/1‑101 (MQ=255)
gatctaTCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCa < 2:1922024/96‑1 (MQ=255)
gACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCAt < 1:3421149/101‑1 (MQ=255)
aCGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATc < 2:3390205/101‑1 (MQ=255)
cGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCg < 2:79442/101‑1 (MQ=255)
gATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCgg < 1:2864410/101‑1 (MQ=255)
gATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCgg < 1:2619946/101‑1 (MQ=255)
gATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCgc > 1:3203798/1‑100 (MQ=255)
aTCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCaagatc > 1:1922150/1‑96 (MQ=255)
aTCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGc < 1:4163095/101‑1 (MQ=255)
aTCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGc < 1:802861/101‑1 (MQ=255)
cACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGa > 2:767713/1‑101 (MQ=255)
aCCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGTCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGaa < 1:1656844/101‑1 (MQ=255)
ccTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAg < 2:2181979/101‑1 (MQ=255)
ccTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAg < 2:2102868/101‑1 (MQ=255)
ttGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAggc < 2:1236591/101‑1 (MQ=255)
ttGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAggc < 1:2432571/101‑1 (MQ=255)
ttGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAggc < 1:1753264/101‑1 (MQ=255)
tGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAggcg < 1:3233218/101‑1 (MQ=255)
gCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAggcgg < 2:479545/101‑1 (MQ=255)
gCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAggcgg < 2:1769444/101‑1 (MQ=255)
cGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAggcggc > 1:3593719/1‑101 (MQ=255)
gggTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGgcggcg < 2:4148158/101‑1 (MQ=255)
gtgAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGAt < 1:2918575/101‑1 (MQ=255)
tgAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATg > 2:3067480/1‑101 (MQ=255)
|
TGATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.GCCC.ACCCTCGGGGCTGCGGTA.CGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGC > NC_014034/1948751‑1948943
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 22 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|