Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 2,449,577 | +G | 1.8% | coding (56/1584 nt) | oppA2 → | oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide‑binding protein OppA |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 2,449,577 | 1 | .→G | 1.8% | 2.1 ‑3.0 ‑0.0 | 166 | coding (56/1584 nt) | oppA2 | oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide‑binding protein OppA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/0): ref base (59/104): total (62/104) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.05e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.45e-01 |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
CGGGTCCTCCCTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCATCCCCGAGGCGAACCTG > NC_014034/2449477‑2449677
|
cGGGTCCTCCCTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGc < 1:2462691/101‑1 (MQ=255)
gggTCCTCCCTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.g > 1:531272/1‑101 (MQ=255)
gggTCCTCCCTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.g < 2:1140828/101‑1 (MQ=255)
gggTCCTCCCTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.g > 2:1274772/1‑101 (MQ=255)
gTCCTCCCTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCCCCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.ggg > 1:3258612/1‑101 (MQ=255)
tcctccCTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGt < 1:3693285/101‑1 (MQ=255)
ctccCTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTgg < 2:3192284/101‑1 (MQ=255)
ctccCTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGgg > 2:2586769/1‑101 (MQ=255)
tccCTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGgc < 2:4130828/101‑1 (MQ=255)
cccTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGgcg < 1:3818178/101‑1 (MQ=255)
cTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.t > 2:297433/1‑101 (MQ=255)
tGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.tt < 1:1612776/101‑1 (MQ=255)
gCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.ttt < 2:2430023/101‑1 (MQ=255)
gCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGgggggctt > 1:4160692/1‑95 (MQ=255)
gCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCCGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.ttt < 2:3788885/101‑1 (MQ=255)
cccTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGgcggcttg > 1:1673211/1‑96 (MQ=255)
ccccACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCg < 2:3551293/101‑1 (MQ=255)
cacaGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGaaa < 1:4231381/101‑1 (MQ=255)
gatctCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAAc < 2:314103/97‑1 (MQ=255)
acaGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAAc < 1:4041031/101‑1 (MQ=255)
acaGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGG.TTTTGGCGGAAc > 2:2752026/1‑101 (MQ=255)
acaGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.GTTGGCCGaaaa > 1:2269264/1‑100 (MQ=255)
aGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGGGC.GTTGGCCGGAAccc > 2:1377099/1‑100 (MQ=255)
aGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCg < 2:1089989/101‑1 (MQ=255)
aGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTGGCCCAAAccc > 2:1097517/1‑100 (MQ=255)
aGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGC.GTTGGCCGAAAccc > 2:166751/1‑100 (MQ=255)
tCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGCGGGGGGGGGT.TTTGGCCGGAAcccg > 1:141036/1‑99 (MQ=255)
tCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTg < 2:2502509/101‑1 (MQ=255)
tCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.GTTGGGCGAAAACgcg > 2:775227/1‑99 (MQ=255)
ccACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.CTTCGGCGAGAccccgc > 1:2631414/1‑97 (MQ=255)
acaGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCtt < 1:1377199/101‑1 (MQ=255)
agGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GAcc < 2:918786/101‑1 (MQ=255)
agGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GAcc < 2:1630353/101‑1 (MQ=255)
gAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGC.TTTGGCCGAAACCGGGCTT.TAcccc > 1:1296846/1‑99 (MQ=255)
aCCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGC.TTTTGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGc > 2:3481/1‑101 (MQ=255)
aCCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCAGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTGGGCGCAAACGTGCCT.GCCCGCGGc > 1:3767380/1‑101 (MQ=255)
cccccGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGca < 2:1704047/101‑1 (MQ=255)
cccccGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGca < 2:3262909/101‑1 (MQ=255)
cccccGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGca < 2:392833/101‑1 (MQ=255)
ccccGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.GTTGGCCGAAACCGGGCTT.GACCGCGGcaa > 2:3679884/1‑101 (MQ=255)
cccGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGcaac < 1:680084/101‑1 (MQ=255)
cccGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGcaac < 1:58960/101‑1 (MQ=255)
cGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGcaacaa < 1:1924712/101‑1 (MQ=255)
gCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCaacaac < 1:2146582/101‑1 (MQ=255)
cATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACg < 1:3395846/101‑1 (MQ=255)
aTGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTGGCCGAAACCCTGCTT.GACCGCGGcaaccaacg > 1:294076/1‑96 (MQ=255)
taaaccTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGc < 1:1016118/97‑1 (MQ=255)
tGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGc < 1:2627261/101‑1 (MQ=255)
tGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGC.GTTGGCCGAAACCGAGATTCGACGCCGGC.ACAACGGc > 2:3402214/1‑101 (MQ=255)
gACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCg < 2:431957/101‑1 (MQ=255)
gACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGccaacacagcg > 1:133516/1‑91 (MQ=255)
atctcTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCCCCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCg < 1:3306119/97‑1 (MQ=255)
ttCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCg < 1:3221158/101‑1 (MQ=255)
tCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCgg < 2:3815585/101‑1 (MQ=255)
gCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGaa < 1:4070130/101‑1 (MQ=255)
gCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGaa < 2:2631222/101‑1 (MQ=255)
gCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTGGCCGGAACCGGGCTT.TACCGCGGCAAAAACGGCGGccccgga > 2:823831/1‑97 (MQ=255)
cTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGaaa < 1:2659417/101‑1 (MQ=255)
cTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGCGTTGGGCGGAAACCG.GCTT.GACCCCGGCAACAAAGGGGACCCGGaaa > 1:3992315/1‑101 (MQ=255)
ttCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAAc < 1:1781831/101‑1 (MQ=255)
ttCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGC.TTTTGCCGAAACCCTGCTT.GACCGCGGGCACAACGGCGACCCCGGAAc > 1:852655/1‑101 (MQ=255)
tCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTGGGCGAAAACCGGCTT.GACCGCGGGAACAACAGGGCCCCCGGAACg > 2:901665/1‑101 (MQ=255)
cAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTTGCCGAAACCCTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGGAACGc > 2:1552002/1‑101 (MQ=255)
aGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGCGGGGGGGCGC.TTTGGCGGAACCCGTGTTT.GACCCCGGCAAAAACGCGGCCCCGGAAAcccg > 1:1428103/1‑98 (MQ=255)
aGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTg < 2:3767123/101‑1 (MQ=255)
aGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGG.CTTGGCCGAAAACGTGCTT.GACCCCGGCAACAACGGCGACCCCGGAAcacgg > 2:2277469/1‑97 (MQ=255)
gTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTgg < 1:973568/101‑1 (MQ=255)
cccTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTTGCCGAAAACGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCCGAAACGCTgggg > 1:2472516/1‑99 (MQ=255)
cTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATcc < 1:1081203/101‑1 (MQ=255)
cTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATcc < 2:417777/101‑1 (MQ=255)
cTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTGGGCGAAACCCGGCTT.TGCCCCGGCAAAAACCGAGGACCGGCAACGATGGagac > 2:4198702/1‑98 (MQ=255)
tGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCg < 2:497434/101‑1 (MQ=255)
tGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCCACAACGGGGCCCCCGAAAAGCTGGATCCg > 1:3167325/1‑101 (MQ=255)
gCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTTGCCGAAACCGTGCTT.TACCCCGGCAACAACGGCGGCCCGGGAAAGCTGGATCCGc > 1:2771304/1‑101 (MQ=255)
cTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGGGC.TTTTGCCCAAACCCTGCTT.GACCCCGGCAACAACAGCGACCCGGAAAAGCTGGATCCCca > 2:3963409/1‑101 (MQ=255)
tCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGG.GTTTGCCGGAACCGTGCTT.GACCGCGGCCACAAAGGCGACCCGCAAACGCCGGGTCCGccc > 1:2715046/1‑99 (MQ=255)
aCCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACaa < 1:1157707/101‑1 (MQ=255)
cgccTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCAAAAGAAtt < 1:3882617/101‑1 (MQ=255)
gccTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTc < 2:3184274/101‑1 (MQ=255)
ccTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCg < 1:1685370/101‑1 (MQ=255)
ccTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTTGCCCCAACCGTGCTT.TACCCCGGCAACAACGGCGGCCCGGGAACGCCGGGTCCGCACAAGAAGTCg > 2:626150/1‑101 (MQ=255)
cTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCCACAACGGCGACCCCGGAAAGCCGGGTCCGCACAAGAATTCGa > 2:1156978/1‑101 (MQ=255)
cTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGa > 1:4075475/1‑101 (MQ=255)
tCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGaa < 2:4021952/101‑2 (MQ=255)
tCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTTGCCGAAACCCTGCTT.GACCGCGGCAACAAAGGCGACCCGGGAAAGCTGGATCCGCACAAGAATTCGAc > 1:363890/1‑101 (MQ=255)
cGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGC.TTTTGCCGAAACCGTGCTT.TACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACCAGAATTCGAcc > 2:1739229/1‑101 (MQ=255)
cGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGC.TTTTGCCGAAACCCCGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCCGAAACGCCGGATCCGCACAAGAAATCGAcc > 2:1968124/1‑101 (MQ=255)
gCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCa < 2:2855591/101‑1 (MQ=255)
cTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCAt < 1:3948917/101‑1 (MQ=255)
cTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGGGC.TTTTGCCGGAACCCTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCCGGAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCAt > 1:2595359/1‑101 (MQ=255)
cTGATCGCGCTCATGGC.GGGGGGCGC.TTTTGCCGAAACCGTGCTT.TACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCCCACAAAAAATCGAccct > 2:672312/1‑99 (MQ=255)
aTCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCATccc < 2:2887774/101‑1 (MQ=255)
aTCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCATccc < 2:2424320/101‑1 (MQ=255)
tCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCATcccc < 2:203693/101‑1 (MQ=255)
cgcgCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCATCCCCg < 2:1373383/101‑1 (MQ=255)
cgcgCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCATCCCCg < 2:4072234/101‑1 (MQ=255)
aTGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCATCCCCGAGGCGaa < 1:3680138/101‑1 (MQ=255)
tGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACGAGAATTCGACCATCCCCGAGGCGAAc > 1:3550272/1‑101 (MQ=255)
gC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCATCCCCGAGGCGAACCt < 1:3139335/101‑1 (MQ=255)
gC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCATCCCCGAGGCGAACCt < 1:2218813/101‑1 (MQ=255)
|
CGGGTCCTCCCTGCCCTCCCCACAGTCCACAGAGGAAACCCCCGCATGACCCTTCGCTTCAAGTCCCTGCTCACCGCCGCCTCGCTGATCGCGCTCATGGC.GGGTGGCGC.TTTGGCCGAAACCGTGCTT.GACCGCGGCAACAACGGCGACCCGGAAACGCTGGATCCGCACAAGAATTCGACCATCCCCGAGGCGAACCTG > NC_014034/2449477‑2449677
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 32 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|