Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 3,258,963 | +C | 100% | coding (778/1971 nt) | efeU → | ferrous iron permease EfeU |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 3,258,963 | 1 | .→C | 100.0% | 38.9 | 174 | coding (778/1971 nt) | efeU | ferrous iron permease EfeU |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (82/78): ref base (0/14): total (82/92) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 9.47e-05 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.30e-01 |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
CAATGCCTCGGTCGCGGGCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.A.CCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCGTCCGGGCGCCTCCTT > NC_014034/3258863‑3259058
|
aTGCCTCGGTCGCGGGCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.A.cc > 2:3398697/1‑101 (MQ=255)
cTCGGTCGCGGGCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.A.ccctgc > 1:2906663/1‑97 (MQ=255)
ttggTCGCGGGCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCCTGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.A.ccctgcc < 1:4183681/99‑6 (MQ=255)
cgcgGGCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGctct < 2:4122425/101‑1 (MQ=255)
cgGGCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTc < 2:1782467/101‑1 (MQ=255)
gggCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTcc > 1:3435996/1‑101 (MQ=255)
gggCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTcc < 1:1739653/101‑1 (MQ=255)
ggCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCt < 1:1094615/101‑1 (MQ=255)
ggCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCt < 1:4140199/101‑1 (MQ=255)
ggCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCt < 2:2651388/101‑1 (MQ=255)
ggCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCt > 1:1704446/1‑101 (MQ=255)
gCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTg < 1:3936289/101‑1 (MQ=255)
gCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTg < 1:1688601/101‑1 (MQ=255)
gCACCGTGCTTTCGGCCCTCTTTGGCTATCCCGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTg < 2:524812/101‑1 (MQ=255)
cACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTgc > 1:70089/1‑101 (MQ=255)
cGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGcc < 1:4060196/101‑1 (MQ=255)
gTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGccc > 1:2793866/1‑101 (MQ=255)
atcttttCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGccc < 1:186290/97‑1 (MQ=255)
gCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCcg > 1:3255917/1‑101 (MQ=255)
gCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCcg < 1:3613685/101‑1 (MQ=255)
cTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCcgc > 2:1354594/1‑101 (MQ=255)
cTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCcgc > 1:2713727/1‑101 (MQ=255)
cTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCcgc < 1:2394226/101‑1 (MQ=255)
cTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACACCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCcgc < 2:1981992/101‑1 (MQ=255)
tttCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGcccagat > 2:186252/1‑97 (MQ=255)
ttCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCgcgc < 1:1985818/101‑1 (MQ=255)
cGGCGCTTTTTGACAATCACGTCAGCCGGGCCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGcgccc < 2:1995276/101‑1 (MQ=255)
cGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGcgccc > 2:1899060/1‑101 (MQ=255)
cGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGcgccc < 2:4033640/101‑1 (MQ=255)
ggCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGcgcccg > 2:2873700/1‑101 (MQ=255)
gcgcTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGcgcccgc < 2:2363612/101‑1 (MQ=255)
gcgcTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGcgcccgc < 1:1696562/101‑1 (MQ=255)
gcTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCgcccgccc > 1:3205540/1‑101 (MQ=255)
tctTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGccccc > 2:1964954/1‑101 (MQ=255)
ctTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGcccccc < 2:3842670/101‑1 (MQ=255)
tttGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCt < 1:939639/101‑1 (MQ=255)
tttGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCt > 2:1660828/1‑101 (MQ=255)
ttGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCtt < 1:3821496/101‑1 (MQ=255)
tGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTc > 2:3032578/1‑101 (MQ=255)
tGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTc > 1:2043332/1‑101 (MQ=255)
tGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTc > 1:2334480/1‑101 (MQ=255)
ggCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTcc < 1:904490/101‑1 (MQ=255)
cTATCACGACAGCCCGCCCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGc < 2:76074/101‑1 (MQ=255)
cTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGc > 2:3085994/1‑101 (MQ=255)
cTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTCCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGc > 1:1906898/1‑101 (MQ=255)
tATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCa < 1:3351259/101‑1 (MQ=255)
tCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTGCC.CCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCaaa < 1:48508/101‑1 (MQ=255)
tCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCaaa < 2:437978/101‑1 (MQ=255)
cACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCaaaa > 2:1719471/1‑101 (MQ=255)
cACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCaaaa > 1:2206742/1‑101 (MQ=255)
cACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCCCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCCGCCGCTCTTACTGCGCCCCGCCCCCGCCCCCCTTCCGCaaaa > 1:3856688/1‑101 (MQ=255)
ccGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAg < 2:2325913/100‑1 (MQ=255)
cGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAgg < 2:2575320/101‑1 (MQ=255)
cGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAgg < 2:2210541/101‑1 (MQ=255)
gACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGc > 1:3690492/1‑101 (MQ=255)
cggCCCGACCCAGGCCGGGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.TTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCt < 2:3516910/99‑1 (MQ=255)
cAGCCCGCCCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC..TG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTg < 2:2813453/101‑1 (MQ=255)
cAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCt < 1:3534091/101‑1 (MQ=255)
gCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGa < 2:939300/101‑1 (MQ=255)
cccGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGAt < 1:2382152/101‑1 (MQ=255)
ccGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATc < 2:2136890/101‑1 (MQ=255)
gACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCg < 1:1365886/101‑1 (MQ=255)
ccccAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGa < 1:1492796/100‑1 (MQ=255)
aCCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGa > 1:773229/1‑101 (MQ=255)
aCCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGa > 2:1520622/1‑101 (MQ=255)
cccAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGAt < 2:1544555/101‑1 (MQ=255)
cccAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGAt < 1:2885178/101‑1 (MQ=255)
cggggCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGa < 1:2558079/99‑1 (MQ=255)
cAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGa > 1:2847490/1‑101 (MQ=255)
cAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGa > 1:572816/1‑101 (MQ=255)
aGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGAc > 2:2935621/1‑101 (MQ=255)
ggCGAGGTCGCCCTCGGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGAccc < 2:70074/101‑1 (MQ=255)
gCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGAcccc < 1:1696434/101‑1 (MQ=255)
aagaggcGCCCGTTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTGCC.CCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCt < 2:811303/95‑1 (MQ=255)
gAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTGCC.CCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCtt < 1:1775772/101‑1 (MQ=255)
gAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCtt > 1:1970605/1‑101 (MQ=255)
aGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTc > 1:4236260/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTcc < 1:1660943/101‑1 (MQ=255)
ggTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTcc < 1:724823/101‑1 (MQ=255)
gccccccTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTGCC.CCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCg < 1:1886472/97‑1 (MQ=255)
gTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCg < 2:2474981/101‑1 (MQ=255)
gTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCg > 1:2681925/1‑101 (MQ=255)
tCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGc > 2:1127675/1‑101 (MQ=255)
tCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGc > 1:3885120/1‑101 (MQ=255)
gCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTGCC.CCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGcac < 1:1048931/101‑1 (MQ=255)
gCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGcac > 1:2474958/1‑101 (MQ=255)
ctctGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTGCC.CCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAg < 2:3356057/101‑1 (MQ=255)
ctGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAgcg < 1:3032803/101‑1 (MQ=255)
tGGGCGGCGTTCCTGGCC.TTGCC.CCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGAGGACCCCTTCCGCACAAgcgc < 2:125165/101‑1 (MQ=255)
gggCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGcc < 1:1312689/101‑1 (MQ=255)
ggCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCg > 1:1011642/1‑101 (MQ=255)
gCCGCGTTCCTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCGt < 2:1053460/101‑1 (MQ=255)
cgcgTTCCTGGCC.GTGCC.CCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCGTcc < 1:2122038/101‑1 (MQ=255)
gTTCCTGGCC.GTGCC.CCGGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCGTCCggg < 2:3804083/101‑1 (MQ=255)
tCCTGGCCGGGG.C.CCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCGTCCGGgcg < 2:2813753/101‑1 (MQ=255)
ccTGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCGTCCGGgcgc > 2:1366380/1‑101 (MQ=255)
tGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGCTCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCGTCCGGGCGcct > 1:1935976/1‑101 (MQ=255)
tGGCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCGTCCGGGCGcct > 2:1493079/1‑101 (MQ=255)
ggCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCGTCCGGGCGcctc > 1:3747822/1‑101 (MQ=255)
gCC.GTG.ACCCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCGTCCGGGCGcctcc > 1:1167971/1‑101 (MQ=255)
|
CAATGCCTCGGTCGCGGGCACCGTGCTTTCGGCGCTCTTTGGCTATCACGACAGCCCGACCCAGGGCGAGGTCGCCCTCTGGGCCGCGTTCCTGGCC.GTG.A.CCTGCCGCTCTTCCTGCGCCCCGCGCCCGCCCCCCTTCCGCAAAAGGCCTGATCCGATGACCCCTTCCGCACAAGCGCCGTCCGGGCGCCTCCTT > NC_014034/3258863‑3259058
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|