| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,466 | A→T | 18.1% | intergenic (+278/‑653) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,466 | 0 | A→T | 18.1% | 137.6 ‑1.1 ‑0.1 | 257 | intergenic (+278/‑653) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (18/28): ref base (100/109): total (118/139) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.29e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.82e-01 | ||||||||||
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
TCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTC > NC_014034/1395366‑1395566
|
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 1:3346848/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc > 1:1406727/1‑101 (MQ=255)
ccccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg < 1:3048061/99‑1 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcg < 2:3146514/101‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgcc < 2:3543428/101‑1 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...Ct > 1:853253/1‑101 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...Ct > 1:2167976/1‑101 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...Ct.t > 1:204845/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...Ct.tt < 1:1499625/101‑1 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...Ct.tt > 1:180940/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTgg > 2:2921948/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCgg > 1:3638668/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGa > 2:848418/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGa > 1:3875017/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGAc > 1:2220055/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCTGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACa > 1:2624157/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACa > 1:1626108/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACa > 1:2443341/1‑101 (MQ=255)
cGAACCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGAACGGTGATCAGCGGTCCCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCt < 2:3503070/101‑1 (MQ=38)
tGCCCCCGCTGCCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc < 1:4159381/101‑1 (MQ=255)
cgCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc < 1:558341/100‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 1:1723007/1‑101 (MQ=255)
ccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtg < 1:3971508/100‑1 (MQ=255)
aCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGGAACgtg > 1:587742/1‑101 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTc > 2:3356045/1‑101 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTc < 1:2726905/101‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGGAACGTGTc > 2:1749675/1‑101 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGTTCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCg > 2:459267/1‑101 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCg > 2:329753/1‑101 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCg < 1:1212377/101‑1 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc > 2:3405164/1‑101 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCt > 1:4207508/1‑101 (MQ=255)
tGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTc > 2:3625845/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGNTGGTAACGTGTCGCTcc > 2:1049215/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc < 2:2875529/101‑1 (MQ=255)
gctgtGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc < 1:295384/97‑1 (MQ=255)
ccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccccc < 1:100034/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 1:785583/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 2:1587702/101‑1 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg > 1:3601996/1‑101 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:971995/101‑1 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:1922950/101‑1 (MQ=255)
tcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt < 2:4177425/101‑1 (MQ=255)
gggtggtgAGGGGCCGCTCCGCCCGCGGGGGCGGGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 2:1188078/100‑1 (MQ=38)
gtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 2:3691073/1‑101 (MQ=255)
gtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 2:4127914/101‑1 (MQ=255)
gtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 1:3950676/1‑101 (MQ=255)
gtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 1:107331/1‑101 (MQ=255)
gctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:2052707/92‑1 (MQ=2)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:546449/9‑101 (MQ=0)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:1539092/9‑101 (MQ=0)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:3481168/9‑101 (MQ=0)
tggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:3782888/94‑1 (MQ=2)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:555779/101‑1 (MQ=255)
gacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:3929102/96‑1 (MQ=2)
gacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:3206203/6‑101 (MQ=2)
gacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:3044448/96‑1 (MQ=2)
cAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:3891808/1‑101 (MQ=255)
cAGCGGTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:271902/101‑1 (MQ=255)
acgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:2748688/5‑101 (MQ=2)
aGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:1283247/101‑1 (MQ=255)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa < 1:2609604/99‑1 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 1:4108360/3‑101 (MQ=2)
gCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc > 2:1731691/1‑101 (MQ=255)
tggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACag < 2:1564782/100‑2 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACagc < 1:3625243/101‑3 (MQ=2)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtct > 2:2483019/1‑101 (MQ=255)
ngccncccccGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.TCCCCGAACCTGTCGGCGG.CGA.ACACCGATACCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtcg < 1:3196898/96‑2 (MQ=0)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 1:3457309/101‑1 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 1:2853850/101‑1 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttc < 1:993780/101‑4 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 1:831056/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg < 1:459324/101‑1 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 1:1309471/101‑5 (MQ=2)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGt > 1:2359869/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaat > 2:145188/1‑95 (MQ=0)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaat < 1:1767511/101‑7 (MQ=0)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGc < 1:1897925/101‑1 (MQ=255)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGGGc > 2:2952045/1‑101 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaatgg < 2:1083294/101‑9 (MQ=2)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCg < 1:3261659/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGcc > 2:1988290/1‑100 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCCGTGCCGTCGCTCGt > 2:4113630/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTTGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTcc < 1:3754861/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTcc < 1:1947437/101‑1 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa < 2:3829519/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAg < 2:2590120/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAg < 2:2219896/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGc > 2:1836906/1‑101 (MQ=255)
aTCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCg > 2:3402862/1‑101 (MQ=255)
cGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCCGc < 1:3128442/101‑1 (MQ=255)
gAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGcc > 2:3085897/1‑101 (MQ=255)
aagcATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt > 1:2418477/4‑101 (MQ=255)
aaaCATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt < 2:587678/101‑1 (MQ=255)
aaaCATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt < 2:2438293/101‑1 (MQ=255)
aaCATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg < 2:2167831/101‑1 (MQ=255)
aaCATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg < 1:2257267/101‑1 (MQ=255)
aCATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGc > 2:630643/1‑101 (MQ=255)
aTCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtc < 2:1626572/101‑1 (MQ=255)
aTCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGCCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtc < 2:544165/101‑1 (MQ=255)
|
TCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTC > NC_014034/1395366‑1395566
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|