Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,395,474 | T→G | 19.6% | intergenic (+286/‑645) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,395,474 | 0 | T→G | 19.6% | 130.0 ‑0.7 ‑0.2 | 242 | intergenic (+286/‑645) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (19/29): ref base (88/106): total (107/135) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.19e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.59e-01 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
CCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCC > NC_014034/1395374‑1395574
|
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...Ct.t > 1:204845/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...Ct.tt > 2:4159119/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...Ct.tt > 1:180940/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...Ct.tt < 1:1499625/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTg < 2:3152866/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTg < 1:3062779/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTg < 2:1919368/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTg > 1:555843/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTgg > 2:2921948/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGc < 2:550473/101‑1 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTc > 1:261755/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCg > 1:2938501/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCg > 2:3457057/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGa > 2:848418/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGa > 1:544229/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGAc > 2:2183707/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGAc > 1:2220055/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCTGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACa > 1:2624157/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACa < 1:3741846/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACa > 1:988216/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACa > 1:1626108/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAg < 2:3716934/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAg > 2:3913696/1‑101 (MQ=255)
cGAACCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGAACGGTGATCAGCGGTCCCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCt < 2:3503070/101‑1 (MQ=38)
gAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTg < 1:848362/101‑1 (MQ=255)
aCTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 1:814588/101‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 2:4210035/101‑1 (MQ=255)
cTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa < 2:3003445/101‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 1:1723007/1‑101 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg < 2:2730245/101‑1 (MQ=255)
ccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtg < 1:3971508/100‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTc > 2:3356045/1‑101 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGGAACGTGTc > 2:1749675/1‑101 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGTTCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCg > 2:459267/1‑101 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCg < 1:1212377/101‑1 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCt > 1:4207508/1‑101 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCt < 2:1713654/101‑1 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc < 2:2875529/101‑1 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc < 2:3311789/101‑1 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CG.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc > 1:3676267/1‑101 (MQ=255)
ccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccccc < 1:100034/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 2:1587702/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc < 1:1279773/101‑1 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg < 1:2392989/101‑1 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 2:1330952/1‑101 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:971995/101‑1 (MQ=255)
atcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg < 1:2183852/101‑1 (MQ=255)
gggtggtgAGGGGCCGCTCCGCCCGCGGGGGCGGGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 2:1188078/100‑1 (MQ=38)
gtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 1:107331/1‑101 (MQ=255)
gctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:2052707/92‑1 (MQ=2)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:157014/101‑1 (MQ=255)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:7210/101‑1 (MQ=255)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCCACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:2074133/93‑1 (MQ=2)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:3481168/9‑101 (MQ=0)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:555779/101‑1 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:3876146/101‑1 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 2:366066/1‑101 (MQ=255)
gacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:3206203/6‑101 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 1:4108360/3‑101 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACagc > 2:640582/1‑99 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 2:2443157/101‑1 (MQ=255)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctt < 1:3858616/101‑2 (MQ=2)
ngccncccccGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.TCCCCGAACCTGTCGGCGG.CGA.ACACCGATACCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtcg < 1:3196898/96‑2 (MQ=0)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt < 1:41447/101‑3 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 1:2853850/101‑1 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 1:3457309/101‑1 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 1:5830/101‑1 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttc > 1:1979495/1‑98 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg < 1:459324/101‑1 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 1:3511728/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 1:1447941/1‑101 (MQ=255)
ccccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 1:2263797/99‑5 (MQ=0)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 1:1309471/101‑5 (MQ=2)
cccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaa < 2:2682562/100‑6 (MQ=0)
ccccccGCGGGGGTGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTg < 2:1047259/101‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaat < 1:1767511/101‑7 (MQ=0)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaat < 1:2748894/101‑7 (MQ=0)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGc < 1:1897925/101‑1 (MQ=255)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGc < 1:2472404/101‑1 (MQ=255)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGGGc > 2:2952045/1‑101 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaatgg < 2:1083294/101‑9 (MQ=2)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCG...GG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaatgg < 1:3321997/101‑9 (MQ=2)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGt < 1:3626098/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGcc > 2:1988290/1‑100 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCCGTGCCGTCGCTCGt > 2:4113630/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa < 2:3829519/101‑1 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa < 2:2359693/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAg < 2:2590120/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGc > 2:1836906/1‑101 (MQ=255)
aTCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCg > 2:3624506/1‑101 (MQ=255)
aTCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCg > 2:3402862/1‑101 (MQ=255)
cGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCCGc < 1:3128442/101‑1 (MQ=255)
gAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGcc > 2:3085897/1‑101 (MQ=255)
aagcATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt > 1:2418477/4‑101 (MQ=255)
aaaCATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt < 2:587678/101‑1 (MQ=255)
aTCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtc < 2:1626572/101‑1 (MQ=255)
gccg...cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgtc < 2:393811/101‑1 (MQ=255)
g...cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCt < 2:1581909/101‑1 (MQ=255)
t.ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcc > 1:3211688/1‑101 (MQ=255)
t.ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcc > 2:1557093/1‑101 (MQ=255)
|
CCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCG...CT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCC > NC_014034/1395374‑1395574
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|