Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,412,228 | C→G | 7.1% | C534S (TGT→TCT) | RCAP_rcc01318 ← | outer membrane autotransporter barrel domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,412,228 | 0 | C→G | 7.1% | 27.9 ‑3.5 ‑0.0 | 210 | C534S (TGT→TCT) | RCAP_rcc01318 | outer membrane autotransporter barrel domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/11): ref base (111/84): total (115/95) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.06e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
CCCGCGATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGCCGT > NC_014034/1412129‑1412328
|
cgcgATCGGCGCGGAGAAGTTCTTTCCGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGAcaca < 2:2934080/101‑1 (MQ=255)
gATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGc > 2:2637376/1‑101 (MQ=255)
gATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGc > 2:2629801/1‑101 (MQ=255)
gATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGc > 1:3214250/1‑101 (MQ=255)
aTCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGcc > 2:4102667/1‑101 (MQ=255)
aTCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGcc < 1:737007/101‑1 (MQ=255)
gggCGGGGAGAAGGTCTTTCCGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGt < 2:2715008/100‑1 (MQ=255)
gggCGCGGAAAAGGTCTTTCCGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGt < 1:1532568/100‑1 (MQ=255)
cGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGt > 2:2745141/1‑101 (MQ=255)
cGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGt > 2:1166621/1‑101 (MQ=255)
cGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGt < 1:1875131/101‑1 (MQ=255)
ggCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGCGCCGTCAACTGCGAAGGCGGTGCCCGCAAGACACAGACCGtc > 2:2168021/1‑101 (MQ=255)
gcggGGAGAAGGTCTTTCCGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGtct < 1:337775/101‑1 (MQ=255)
gcgGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTcc > 1:2670619/1‑101 (MQ=255)
gggAGAAGGTCTTTCCGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTccc < 1:2247316/100‑1 (MQ=255)
gagaAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCcgc > 2:1954855/1‑101 (MQ=255)
agaAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCcgcg > 1:67023/1‑101 (MQ=255)
aaGGCCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGc > 2:449439/1‑101 (MQ=255)
gTCTTTCCGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATa < 1:3373386/101‑1 (MQ=255)
gTCTTTACCCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATa < 2:2393691/101‑1 (MQ=255)
tCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTACCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAg > 1:3643496/1‑101 (MQ=255)
cTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAgg > 1:63491/1‑101 (MQ=255)
cTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAgg > 1:3097066/1‑101 (MQ=255)
tttACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAggt < 1:3411962/101‑1 (MQ=255)
ttgcgcccgccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAggtg < 1:4064210/98‑1 (MQ=255)
accccccccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAggtggt < 1:481545/98‑1 (MQ=255)
gcccgccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGc > 2:921603/1‑101 (MQ=255)
gcccgccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGc > 2:3790635/1‑101 (MQ=255)
ccccgccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGc < 2:3021215/100‑1 (MQ=255)
gccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCAc < 2:3438513/101‑1 (MQ=255)
ccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCAcc < 2:3554711/101‑1 (MQ=255)
cAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACcg < 2:1034321/101‑1 (MQ=255)
cAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACcg > 1:2383850/1‑101 (MQ=255)
cAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACcg > 2:2882221/1‑101 (MQ=255)
cAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACcg > 1:3488686/1‑101 (MQ=255)
tgtCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCgcgc > 2:3980962/1‑101 (MQ=255)
gtCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGcc > 2:3841905/1‑101 (MQ=255)
tCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGccc < 2:526182/101‑1 (MQ=255)
tCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGccc < 1:1195992/101‑1 (MQ=255)
tGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCcgc > 1:1156274/1‑101 (MQ=255)
aTCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCcgcgc > 1:3858490/1‑100 (MQ=255)
cGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACt < 1:375746/101‑1 (MQ=255)
cGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTggg < 1:2705301/101‑1 (MQ=255)
gAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGc > 1:2284691/1‑101 (MQ=255)
gAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGc > 1:2929455/1‑101 (MQ=255)
gAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGc > 2:1799806/1‑101 (MQ=255)
gAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGc > 2:1588231/1‑101 (MQ=255)
gAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGc < 1:1249438/101‑1 (MQ=255)
aGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCg > 1:197555/1‑101 (MQ=255)
gTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTc < 1:22438/101‑1 (MQ=255)
gTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTc > 1:958435/1‑101 (MQ=255)
gcgcACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCaa < 1:1415768/101‑1 (MQ=255)
gcACCACGGTGCGGTTAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCCTCAACa < 2:592239/101‑1 (MQ=255)
caccacGGTGCCGTCAANTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACAt < 2:1074407/101‑1 (MQ=255)
acGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGc > 1:841989/1‑101 (MQ=255)
acGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGc < 2:3926633/101‑1 (MQ=255)
ggTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCt < 2:204134/101‑1 (MQ=255)
gTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCtt < 1:1391236/101‑1 (MQ=255)
ggCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTc < 2:3107906/100‑1 (MQ=255)
gCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGNCTTcn > 1:917568/1‑100 (MQ=255)
gCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCg > 1:1035143/1‑101 (MQ=255)
cGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAg > 2:1786099/1‑101 (MQ=255)
gTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAgg > 1:212149/1‑101 (MQ=255)
gTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAgg > 1:2915367/1‑101 (MQ=255)
tCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGc < 1:3790892/101‑1 (MQ=255)
tCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGc > 1:2759255/1‑101 (MQ=255)
aaCTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCa > 2:1867180/1‑101 (MQ=255)
aCTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCAc < 1:3260733/101‑1 (MQ=255)
aCTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCAc > 1:2315466/1‑101 (MQ=255)
cTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCAcc > 1:1953061/1‑101 (MQ=255)
tGCGAAGGTGGTCCCCCCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCt < 1:2625217/101‑1 (MQ=255)
gggAAAGTGGTGCCCGCAAGAGACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTg < 1:1091542/99‑1 (MQ=9)
gCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTg > 2:4172160/1‑101 (MQ=255)
cGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTgg > 1:584314/1‑101 (MQ=255)
cGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTgg < 1:4102928/101‑1 (MQ=255)
cGAAAGTGGTGCCCGCAAGAGACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTgg < 2:1179008/101‑1 (MQ=2)
gAAAGTGGTGCCCGCAAGAGACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGc < 1:2514917/101‑1 (MQ=9)
aGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGccc > 1:2982517/1‑101 (MQ=255)
ggtggtGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCg > 2:3175679/1‑101 (MQ=40)
agtggtgCCCGCAAGAGACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCg < 2:2977851/100‑1 (MQ=18)
gtggtgCCCGCAAGAGACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGc > 1:1813343/1‑101 (MQ=14)
tggtgCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGcc > 2:2311328/1‑101 (MQ=40)
ggtgCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCa < 1:101631/101‑1 (MQ=255)
gCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcgg < 2:1252831/101‑1 (MQ=255)
ccccGCAAGCCACAGCCCGTCTCCCGCGGCATGGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcgg < 2:94832/100‑1 (MQ=255)
cccGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcggt > 2:1428715/1‑101 (MQ=255)
cggaaGACACAGGCCGTTTCCCGCGGTATAGGTGGTGCCCACTGCACCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCCCCTGGCCCGCCAcggtcg < 2:696159/98‑1 (MQ=17)
cGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcggtcg < 2:1482691/101‑1 (MQ=255)
cAAGACCCAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcggtcggt < 2:3690586/101‑1 (MQ=255)
cAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcggtcggt < 1:3044015/101‑1 (MQ=255)
cAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCCCCAcggtcggc > 2:1091448/1‑100 (MQ=255)
cAAGACACAGGCCGCCCCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCCCCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcggtcggt < 2:773089/101‑1 (MQ=255)
aaGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcggtcgggg > 1:796130/1‑99 (MQ=255)
aaGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTAAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTg > 2:169115/1‑101 (MQ=255)
aGACACAGGCCGCCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGc < 2:2279982/101‑1 (MQ=255)
gACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCCCCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGcc < 1:1608981/101‑1 (MQ=255)
acacAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCACGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGGCACGGTCGGTGCCg > 2:2806092/1‑101 (MQ=255)
cacaGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGCCgg > 2:3330343/1‑100 (MQ=255)
cacaGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGCCGt > 2:3647770/1‑101 (MQ=255)
cacaGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGCCGt < 2:212111/101‑1 (MQ=255)
|
CCCGCGATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGCCGT > NC_014034/1412129‑1412328
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|