BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	221,976	A→G	7.7%	D227D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	221,976	0	A→G	7.7%	84.1 ‑0.4 ‑0.4	571	D227D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (21/24): ref base (267/259): total (288/283)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.43e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.39e-01

Only 100 of 1480 total aligned reads displayed.


TCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGG  >  NC_014034/221876‑222084


 cGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                                             <  2:125353/101‑1 (MQ=255)


     gtgggatcggtcggatccgtgggatctgtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                                                         >  1:3553560‑M1/76‑101 (MQ=255)


      aGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                                        >  1:2641239/1‑101 (MQ=255)


        ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                                      <  2:1505725‑M1/29‑1 (MQ=255)


          ttCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                                                                    >  1:2775774/1‑101 (MQ=255)


          atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggat                                                                                                    <  1:2512305‑M1/31‑3 (MQ=255)


                 ggtcccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                                             >  2:3270758‑M1/64‑101 (MQ=255)


                 ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggg                                                                                             <  2:2555344‑M1/38‑1 (MQ=255)


                   gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                           >  1:1837309‑M1/62‑101 (MQ=255)


                    tccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                          >  1:362584‑M1/61‑101 (MQ=255)


                     ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                         <  1:4130607‑M1/42‑1 (MQ=255)


                      cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg                                                                                        <  1:3214136‑M1/43‑1 (MQ=255)


                       gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgt                                                                                       <  1:2121169‑M1/44‑7 (MQ=255)


                       gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggg                                                                                       <  2:2660809‑M1/44‑2 (MQ=255)


                        tgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                      >  2:3843852‑M1/57‑101 (MQ=255)


                           ggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                                                                                   <  1:3284898‑M1/48‑1 (MQ=255)


                              gggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                >  1:1324002‑M1/51‑101 (MQ=255)


                               ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                               >  1:2323484‑M1/50‑101 (MQ=255)


                                 tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTg                                                                             <  1:2907175‑M1/54‑1 (MQ=255)


                                 tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTg                                                                             <  1:2841187‑M1/54‑1 (MQ=255)


                                 tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTg                                                                             <  2:3114676‑M1/54‑1 (MQ=255)


                                  gggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                            <  1:2154302‑M1/55‑1 (MQ=255)


                                   ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                           <  1:4042555‑M1/56‑1 (MQ=255)


                                    ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                          <  1:1005158‑M1/57‑1 (MQ=255)


                                        cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                      <  1:2266379‑M1/61‑1 (MQ=255)


                                         gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                     <  1:583440‑M1/62‑1 (MQ=255)


                                           gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                   >  1:1633042‑M1/38‑101 (MQ=255)


                                              gtcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                >  1:338305‑M1/35‑101 (MQ=255)


                                                cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                              <  1:643290‑M1/69‑1 (MQ=255)


                                                 ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggatcggtcggatgcg                                                             <  1:2051820‑M1/70‑6 (MQ=255)


                                                  gtgggatccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                            >  1:2371589‑M1/31‑101 (MQ=255)


                                                       gtcggtggtatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                       >  2:2906751‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                                        tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                      >  1:189487‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                                         ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                     <  2:4092789‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                                          cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                    <  1:902159‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                                           gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                   >  2:3394741‑M1/22‑101 (MQ=255)


                                                            tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                  >  1:1505829‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                                            ggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                  >  1:2722509‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                                                  cggtcgggtcggtcggGTCAGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCTGTCGGTTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                            <  2:1188742/93‑1 (MQ=11)


                                                                  ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGCTCGGTCGGGTCCGTTGGAtggggcgggccc                                            >  2:2746760/2‑97 (MQ=14)


                                                                  ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                            <  1:2990604/100‑1 (MQ=1)


                                                                   ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGAGCCg                                           <  2:1329742‑M1/88‑1 (MQ=255)


                                                                   cctGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCATGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATTGGGTGGGTCCg                                           >  2:52963/3‑101 (MQ=14)


                                                                    gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                          >  1:3425264‑M1/13‑101 (MQ=255)


                                                                    gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGt                                          <  2:3526656‑M1/89‑1 (MQ=255)


                                                                     tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                         >  2:434983/1‑101 (MQ=255)


                                                                     tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                         <  2:3457453/101‑1 (MQ=255)


                                                                     gggggtgggtgggATCGGTGGGGTGCGTGGGATGGGGCGGGTCCGTGGCCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                         <  1:2443565/94‑1 (MQ=11)


                                                                        gtccgtggggatc.gtcgggttcgtcggataggtcgggcccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                     <  2:1085615/93‑1 (MQ=1)


                                                                        ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                      >  2:2267852/9‑101 (MQ=11)


                                                                         gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                     >  1:1140137/5‑101 (MQ=11)


                                                                          tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                    >  2:101109‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                                           cggtcggATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                   <  1:1567549/101‑1 (MQ=255)


                                                                           cctttggatcggtcggctccgttgaatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                   <  2:1928788/96‑1 (MQ=11)


                                                                           ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg                                   >  2:599597/3‑101 (MQ=11)


                                                                            ctttggctcggtcgggtccgtgtgatcggtcggatccttgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                  <  2:3929308/94‑1 (MQ=11)


                                                                             gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcggg                                 >  1:1429088/4‑100 (MQ=11)


                                                                              tgtgttcggttgtgtccgtgtgatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                <  2:838437/96‑1 (MQ=11)


                                                                              tgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggggccgtgGGGTCCGTCGGATGCGGGGGATCGGTAGGAGCCGTGGGGTGGGTCGGGTCCGTGGGAacggag                                >  2:3987546/3‑99 (MQ=2)


                                                                              tgGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                >  2:368240‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                                              gggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                <  1:499849/96‑1 (MQ=11)


                                                                               ggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                               <  1:1767007/97‑1 (MQ=14)


                                                                               ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtcggtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcg                               <  1:3671072/94‑1 (MQ=14)


                                                                               gagaggcgtcgggtcgggggggtcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                               <  1:3882292/94‑1 (MQ=11)


                                                                                  gtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCATGGGATCGGACGGATCCGTGGGATCCGTCgggg                            >  1:4236554/5‑100 (MQ=14)


                                                                                  atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGAgccgtcggaa                            >  2:2459118/1‑99 (MQ=11)


                                                                                   tcgttcggctccgttggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                           <  2:1680231/101‑1 (MQ=11)


                                                                                   tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                           >  2:1785381/1‑101 (MQ=14)


                                                                                    cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                          <  1:1707791/101‑1 (MQ=11)


                                                                                     ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGCATCCGTGGGAACGGGCGGGACCg                         >  2:283179/1‑101 (MQ=11)


                                                                                     ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggctCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCGGCGTGGTCGGTCGGATCCGTGGGCtcgcggggcgcgg                         >  2:741676/1‑91 (MQ=9)


                                                                                     ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCg                         >  1:1237739/1‑101 (MQ=11)


                                                                                     ggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGCGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGCGCGGTCGGGTCCg                         >  1:3823883/1‑101 (MQ=11)


                                                                                      gtcgggtccgtcgggtcggtggagtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                        <  2:1391844/101‑1 (MQ=11)


                                                                                      gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                        >  1:3073678/1‑101 (MQ=11)


                                                                                       tcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGCTCGGCTCCGtg                       >  1:737430/1‑100 (MQ=11)


                                                                                       tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                       >  2:654820‑M2/1‑100 (MQ=255)


                                                                                       tcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                       >  1:3490550‑M2/1‑100 (MQ=255)


                                                                                       gggggcgcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                       >  2:1599643‑M2/8‑100 (MQ=255)


                                                                                        cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                      >  2:3059587‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                                                        cggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGtgg                      >  1:2586394/1‑99 (MQ=11)


                                                                                         gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                     >  2:1869665/1‑101 (MQ=11)


                                                                                         gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                     <  2:2116016‑M2/101‑4 (MQ=255)


                                                                                         ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGGTCCGTGgg                     >  2:91787/4‑101 (MQ=11)


                                                                                          ggtccgtgggatcggtcggttccgtgggctccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                    <  2:3616844/101‑1 (MQ=11)


                                                                                          ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgGGTCCGTGGGATCGGTCGCGTCCGAGGGGTCGGTCGGGTACGCGGGTTCGGTCGCGTCCGtggac                    >  1:1974556/1‑97 (MQ=11)


                                                                                          gggccgtgagatcggtcgggtccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                    <  1:3133541/98‑1 (MQ=11)


                                                                                           gtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                   >  1:953538‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                                                           ggccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                   >  2:2176769‑M2/3‑96 (MQ=255)


                                                                                           atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTGGGGTCCGTGggtt                   >  1:1074696/2‑99 (MQ=14)


                                                                                            tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                  >  2:2388423‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                                                             ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGtcg                 >  2:2047117/1‑101 (MQ=14)


                                                                                               gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggg               <  1:809076‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                                               gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTTGGGGGCGTGGGAgcggg               >  2:3764851/1‑100 (MQ=11)


                                                                                               gtgggagcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt               <  2:317248/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                taggaacggtcgggtccggggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc              <  1:3956909/99‑1 (MQ=11)


                                                                                                ggggatcggtcggatccctgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc              <  2:2609777/100‑1 (MQ=14)


                                                                                                 gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg             <  2:29636‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                                                                  ggatcggtgggatccggcgggtcggtgggATCCGTGGGATCGGTGGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCCGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtcgg            <  1:3763214/101‑1 (MQ=14)


                                                                                                    atcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggc          >  2:2314216/1‑100 (MQ=11)


TCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGG  >  NC_014034/221876‑222084

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 12 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 30 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG