BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,985	G→A	11.3%	D224D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,985	0	G→A	11.3%	140.8 ‑0.4 0.0	573	D224D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (31/34): ref base (259/249): total (290/283)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.93e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1608 total aligned reads displayed.


CTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGG  >  NC_014034/221885‑222084


    ggTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                                                 >  1:294323/1‑101 (MQ=255)


     gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgt                                                                                                <  1:4155689‑M1/35‑1 (MQ=255)


           tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                          <  1:2129555‑M1/41‑1 (MQ=255)


           gtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                          <  2:445340/101‑1 (MQ=255)


            ccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                         <  2:2276439‑M1/42‑1 (MQ=255)


             cgtgtgttctgtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                                        >  2:559319‑M1/59‑101 (MQ=255)


             cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                                        <  1:2560651‑M1/43‑1 (MQ=255)


              gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                                       >  1:1561005‑M1/58‑101 (MQ=255)


              gagggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                                       <  1:3517480‑M1/44‑1 (MQ=255)


               tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                      <  1:437936‑M1/45‑1 (MQ=255)


               gcAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                      <  1:3400876/100‑1 (MQ=255)


                       gtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                              <  1:3926953‑M1/53‑1 (MQ=255)


                        tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTg                                                                             <  2:3114676‑M1/54‑1 (MQ=255)


                          ggATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                           <  1:2679598/101‑1 (MQ=255)


                           ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                          <  1:1005158‑M1/57‑1 (MQ=255)


                           gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                          <  1:4072407‑M1/57‑1 (MQ=255)


                                 tcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                    <  1:1500412‑M1/63‑1 (MQ=255)


                                 gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgggc                                                                    >  2:3002182/1‑99 (MQ=255)


                                  gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                   <  2:2912264‑M1/64‑1 (MQ=255)


                                       cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                              >  1:2215757‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                        ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                             >  1:2053802‑M1/32‑101 (MQ=255)


                                         gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                            >  2:2623458‑M1/31‑101 (MQ=255)


                                            ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                         <  2:285639‑M1/74‑1 (MQ=255)


                                             ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                        <  1:3844111‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                             ggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                        <  1:1768783‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                               tgcgtgggagcggtcgggtgcgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                      >  1:1983516‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                     >  1:2607179‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                                 ggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccg                                                    >  2:2213199/2‑99 (MQ=11)


                                                 cgtggggtcggtcgggtccgtgGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                    >  1:962312‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                                 cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                    <  2:4144505‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                                  gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                   >  2:742564/1‑101 (MQ=255)


                                                   ggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                  >  1:2349501‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                                     ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                <  1:3628716‑M1/83‑1 (MQ=255)


                                                      gatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcggg                                               <  2:2400988‑M1/84‑2 (MQ=255)


                                                          ggTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                           <  1:1895736/100‑1 (MQ=11)


                                                           gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                          <  1:3466737/101‑1 (MQ=255)


                                                             cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                        >  1:1840215/11‑101 (MQ=11)


                                                              ggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                       <  2:1604174‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                                                atccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                     <  1:90893‑M1/94‑1 (MQ=255)


                                                                 tcctaagcgtcggtcgggtccgtgggagcgggctggttcgtggtaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                    <  2:3792112/92‑1 (MQ=14)


                                                                 tccgtgGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                    >  1:2746966‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                                  tcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                   <  2:1031411/96‑1 (MQ=11)


                                                                  ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                   >  2:40363‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                                  ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                   >  1:1149972‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                                  ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                   <  2:2477945/99‑1 (MQ=11)


                                                                  ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                   <  1:817489/99‑1 (MQ=11)


                                                                  ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAacg                                   >  2:2565599/3‑101 (MQ=11)


                                                                    gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCCGATCGGCGGGATCGGTCGGATACGGGGGAgcggc                                 >  2:1196629/4‑100 (MQ=11)


                                                                    gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGACCCGGggggtgggg                                 >  1:2875656/4‑95 (MQ=11)


                                                                    gtgggatcggtcgggtccgtgagatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                 >  1:2404725/4‑101 (MQ=11)


                                                                     tgtgttcggttgtgtccgtgtgatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                <  2:838437/96‑1 (MQ=11)


                                                                     tggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgtgaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                <  1:3159312/96‑1 (MQ=11)


                                                                     tgggctcggtcgggtccgtgggatcggtcggctccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                <  2:669117/96‑1 (MQ=11)


                                                                     tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgatccgtggggtccgtg                                <  1:1410360‑M1/99‑8 (MQ=255)


                                                                     tgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                >  1:643782‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                                      cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCATGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg                               >  1:525762/1‑101 (MQ=11)


                                                                         atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgggcggat                            >  2:3880583/1‑99 (MQ=14)


                                                                         atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGt                            >  2:3549605/1‑101 (MQ=11)


                                                                          tcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                           <  2:1681962/101‑1 (MQ=11)


                                                                          tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                           >  2:1785381/1‑101 (MQ=14)


                                                                          tcggtcgggtccgggggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                           <  2:1338843/101‑1 (MQ=11)


                                                                           cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                          <  1:3976791/101‑1 (MQ=11)


                                                                           ccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                          <  1:1627026/99‑1 (MQ=14)


                                                                            ggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                         <  2:2121024/101‑1 (MQ=11)


                                                                            ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCg                         >  1:1237739/1‑101 (MQ=11)


                                                                            cgtgggactcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                         <  2:3699258/92‑1 (MQ=11)


                                                                             gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCgg                        >  2:362533/1‑100 (MQ=14)


                                                                             gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCCGTCGGATCCGt                        >  2:2346185/1‑101 (MQ=11)


                                                                             gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCgg                        >  2:1512880/1‑100 (MQ=11)


                                                                             gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTCGGATTGGTAGGGTCCGt                        >  2:1954709/1‑101 (MQ=11)


                                                                              tcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGCTCGGCTCCGtg                       >  1:737430/1‑100 (MQ=11)


                                                                              tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTGGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCGGtg                       >  2:1282562/1‑100 (MQ=14)


                                                                               cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCGGtgg                      >  2:2803054/1‑99 (MQ=14)


                                                                               cgcgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                      <  2:306147/98‑3 (MQ=11)


                                                                                gggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                     <  1:1696391/101‑1 (MQ=11)


                                                                                gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGGCGGGCCCGTCgg                     >  2:3955003/1‑101 (MQ=11)


                                                                                ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGGTCCGTGgg                     >  2:91787/4‑101 (MQ=11)


                                                                                 ggttcgtgggggcggcggcgtccgtcgagtccgtcgGGTCCGTGCTATCGGTCGGGTCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                    <  2:2686504/101‑1 (MQ=2)


                                                                                 ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTggga                    <  1:2814060‑M2/101‑5 (MQ=255)


                                                                                  gttcgtgggatccgtggggttcgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                   <  2:1879235/98‑1 (MQ=11)


                                                                                  gtctgttggatcgttctggtccgtttggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtggtat                   <  2:3470222/101‑6 (MQ=11)


                                                                                  gtccgtggagtccgtggggtccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                   <  2:3397510/101‑1 (MQ=11)


                                                                                    ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGtcg                 >  2:2047117/1‑101 (MQ=14)


                                                                                     cgggggatcggtcggatccgggggatgggtcggGGCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                <  1:227777/98‑1 (MQ=11)


                                                                                       tgggatcggtcggggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGAtcggac              >  1:2488738/1‑99 (MQ=11)


                                                                                        gggatcggtcgggtccgtggggtccgtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGGGGGGTCCGTCgggttcgggg             >  2:1431424/1‑93 (MQ=14)


                                                                                         ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGAtcggtcgg            >  1:3776711/1‑101 (MQ=11)


                                                                                         ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg            <  1:3035369‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                                          gatcggtctgatccgtgggatcggtcggATCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGAGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCCgccggg           >  2:3204492/1‑101 (MQ=14)


                                                                                             gcctccggttcgtcggttccgtaggGTCCGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc        <  2:3273090/95‑1 (MQ=11)


                                                                                              ggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg       <  1:358060/101‑1 (MQ=11)


                                                                                               gtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgt      >  1:596753/1‑101 (MQ=11)


                                                                                               ggggggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt      <  1:1069575/98‑1 (MQ=11)


                                                                                                 cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg    >  2:6226/1‑99 (MQ=11)


                                                                                                 cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgg    >  1:371379‑M2/1‑81 (MQ=255)


                                                                                                 cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg    <  2:1105012/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                 cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTCGGATCCgtggggtccgtcg    <  1:3117300/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                  gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccggggg   <  1:3249115‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                                  gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg   <  1:3341067‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                                  gggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtggg   >  1:1317539‑M2/1‑80 (MQ=255)


CTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGG  >  NC_014034/221885‑222084

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG