BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,997	G→C	13.7%	T220T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,997	0	G→C	13.7%	209.2 ‑1.6 ‑0.0	725	T220T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (46/56): ref base (324/299): total (370/355)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.02e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.89e-01

Only 100 of 1675 total aligned reads displayed.


TGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221897‑222097


ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatgggtagggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                                      <  1:3612704‑M1/42‑1 (MQ=255)


 cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg                                                                                                     <  1:570478‑M1/43‑1 (MQ=255)


 cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                                                     <  1:2560651‑M1/43‑1 (MQ=255)


   tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtc                                                                                                   >  1:955828‑M1/57‑101 (MQ=255)


    gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                                                  <  1:1537563‑M1/46‑1 (MQ=255)


    gggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                                                  >  2:4072784‑M1/56‑101 (MQ=255)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                            <  1:3549974‑M1/52‑1 (MQ=255)


               ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                                       <  1:1005158‑M1/57‑1 (MQ=255)


                gtCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                      <  1:2966243/100‑1 (MQ=255)


                   cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                   <  2:2242944‑M1/61‑1 (MQ=255)


                   cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                   <  1:633119‑M1/61‑1 (MQ=255)


                     tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                 >  1:2758910‑M1/39‑101 (MQ=255)


                       tCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                               >  2:3687661/1‑101 (MQ=255)


                       ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                               >  1:2839694‑M1/37‑101 (MQ=255)


                           cggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                           <  1:114800‑M1/69‑1 (MQ=255)


                           cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                           >  1:3408097‑M1/33‑101 (MQ=255)


                            ggtcggatccgggggatcggtcgggtccgtgGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                          >  1:3643499‑M1/32‑101 (MQ=255)


                             gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatcctt                                                                         <  2:464862‑M1/71‑3 (MQ=255)


                               cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGgccgcgg                                                                       <  1:161685‑M1/73‑4 (MQ=255)


                                 ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGa                                                                     <  2:2061228‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                 gatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                     <  2:1983390‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                   ggggTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                   >  1:2413805/4‑101 (MQ=255)


                                     gttCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                 <  2:327056/99‑1 (MQ=255)


                                      gtggtgtcagTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                <  2:2536326/92‑1 (MQ=11)


                                      gtgggatcggtcgggtccgttGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                >  2:1843887‑M1/22‑101 (MQ=255)


                                      gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                <  1:4025297‑M1/80‑1 (MQ=255)


                                       ggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                               >  1:2349501‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                             tcGTGGGCGCGGTCGGATGTGGGGGGTGCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                         <  1:1813002/100‑1 (MQ=14)


                                             cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                         <  2:3617721‑M1/87‑1 (MQ=255)


                                             ccGTGCGATCGGTCGCATTCGTGGGGTCCATCCGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATcg                                                         <  2:2606316/100‑2 (MQ=14)


                                             cagtcgggtcggtcggATCGGTGGGCTCGGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         <  2:843546/93‑1 (MQ=11)


                                              ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                        <  2:3978469‑M1/88‑1 (MQ=255)


                                                tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                      <  2:3457453/101‑1 (MQ=255)


                                                tGGGATCGGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGtc                                                      <  2:3157492/101‑2 (MQ=11)


                                                 cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                     >  2:1577195‑M1/11‑101 (MQ=255)


                                                   gatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                   >  2:630054‑M1/9‑101 (MQ=255)


                                                    gtccgtcggGTCCGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                  <  2:309194/97‑1 (MQ=11)


                                                    cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                  >  1:1755928/1‑101 (MQ=255)


                                                    atccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                  >  1:692825‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                                     tgcgtagggtcggtggggaccgagggaactgacgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                 <  2:1332094/92‑1 (MQ=11)


                                                      tcgtgggctcggtccgatccgttggctcggtccggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                <  2:2154157/93‑1 (MQ=11)


                                                        gtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtcggt                                              >  2:749689/10‑101 (MQ=11)


                                                         tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTCCGGtcggtc                                             >  1:471390/3‑101 (MQ=11)


                                                         tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                             >  1:1888505‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                         tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgatccgtggggtccgtg                                             >  1:2047255‑M1/3‑94 (MQ=255)


                                                          gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                            >  1:2122395‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                           gggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                           >  1:2905311/7‑101 (MQ=14)


                                                           ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                           >  1:3484173/1‑101 (MQ=11)


                                                           ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                           <  1:2204152/101‑1 (MQ=11)


                                                            gatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgga                                          <  1:1371767/101‑2 (MQ=11)


                                                             atcggtggggcccgtgggagcggtcgggtccgggggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTTCGTGGGATCGGTCGGGt                                         <  1:3124385/101‑1 (MQ=11)


                                                             atcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                         <  2:3537223/101‑3 (MQ=14)


                                                             atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGACGGGTCCGTGGGGTCGGCGGGGTCCCCGGAATCGGCAGGGt                                         >  2:1919114/1‑101 (MQ=2)


                                                             atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGt                                         >  1:791631/1‑101 (MQ=11)


                                                               cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTCGGGGcc                                       >  1:2686710/1‑101 (MQ=11)


                                                                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGCATCCGTGGGAACGGGCGGGACCg                                      >  2:283179/1‑101 (MQ=11)


                                                                ggtcgcgtccgtgcgatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                      <  2:931597/101‑1 (MQ=11)


                                                                gctcgggtccttcggatgggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                      <  2:2309744/99‑1 (MQ=11)


                                                                cgccgcgtccgtggcatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                      <  2:3379864/95‑1 (MQ=11)


                                                                 gtcgtggccgtgggatctgtcggatccgtgggatcgGTCGGAGCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                     <  2:1667000/101‑1 (MQ=11)


                                                                  tgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGtg                                    >  2:1761211/6‑100 (MQ=11)


                                                                  tctgggccgtgggggcggtcgggtacgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                    <  2:3921351/95‑2 (MQ=11)


                                                                   cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                   >  2:3776454‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                                    gggtccttgggatcggtcggggccgtgggaccggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGgg                                  <  2:2660437/101‑1 (MQ=11)


                                                                    ggggccgtgggatcggtcggatccgtgggagcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAgg                                  <  1:1454041/101‑1 (MQ=11)


                                                                     ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggga                                 >  1:3366797‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                                      gtccgttggttcggtcgggtccgtgggatctggtggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                <  2:294278/101‑1 (MQ=11)


                                                                      gtccgtggggtcggtcgggtccgtgggggcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                <  1:3724070/101‑1 (MQ=11)


                                                                      gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggagcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                <  1:409747/101‑1 (MQ=14)


                                                                      gtccgtgagatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                <  1:1679235/101‑1 (MQ=14)


                                                                      ggccgtgggatcgggcgggtcggtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                <  1:3952586/99‑1 (MQ=14)


                                                                       tccgtggggtccgtcggctccgtgggatcggccggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGAATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                               <  2:681565/101‑1 (MQ=11)


                                                                         cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                             >  2:576749/1‑101 (MQ=11)


                                                                          gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                            >  1:3793247/1‑101 (MQ=11)


                                                                           gggggtctgtggggtccgtggggtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                           <  1:902114/100‑1 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcggatctgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGTGAGCGTTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtcg                          <  2:2890874/101‑1 (MQ=14)


                                                                             ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgg                         <  2:2446254‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                             ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                         >  2:2746141/1‑101 (MQ=11)


                                                                             ggagcgggggggtgcgtgggagcgggcggATCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                         <  1:421225/92‑1 (MQ=11)


                                                                               tctggtcggatccgtgggatgggtcggatcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                       >  2:4168513‑M2/4‑87 (MQ=255)


                                                                               gtcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                       <  1:227749/100‑1 (MQ=11)


                                                                               gtcggtcgggtccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggt                       <  1:1221668/100‑1 (MQ=255)


                                                                               atcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTTGGATCGGTCGGGCACGTGGGGTCAgtcgggt                       >  1:3190876/1‑101 (MQ=11)


                                                                                 cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                     <  1:2500916‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                                                 cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggataggtcgggtcc                     <  1:3270999‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                                                   gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgg                   <  2:1285569‑M2/101‑19 (MQ=255)


                                                                                   ggggggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                   <  1:1069575/98‑1 (MQ=11)


                                                                                    tcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccggg                  >  1:2609968/1‑99 (MQ=11)


                                                                                    tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtc                  >  2:3021084/1‑101 (MQ=255)


                                                                                     cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg                 <  2:1105012/101‑1 (MQ=11)


                                                                                          gcgtgggaacggtcggGTGCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc            <  1:1968538/100‑1 (MQ=11)


                                                                                            gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggt          <  1:306192‑M2/101‑28 (MQ=255)


                                                                                            gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt          <  1:3861088/101‑1 (MQ=11)


                                                                                             tcggatcggtgggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc         <  1:130866‑M2/99‑29 (MQ=255)


                                                                                             taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtggggtccgtcggggccggg         >  2:3851074/3‑99 (MQ=11)


                                                                                              gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTgg        >  2:1191368/1‑101 (MQ=255)


                                                                                              gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcg        >  2:102097‑M2/1‑72 (MQ=255)


                                                                                               ggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg       <  2:1505725‑M2/101‑31 (MQ=255)


                                                                                               ggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTggg       <  2:141761/101‑1 (MQ=14)


                                                                                                   cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc   >  2:236242‑M2/1‑67 (MQ=255)


TGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221897‑222097

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG