BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,000	C→G	4.7%	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,000	0	C→G	4.7%	69.6 ‑1.3 ‑1.1	838	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (25/16): ref base (409/388): total (434/404)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.63e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.65e-02

Only 100 of 1707 total aligned reads displayed.


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100


   gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGa                                                                                                   >  2:577393‑M1/54‑101 (MQ=255)


     tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                                                 <  1:1739115‑M1/50‑1 (MQ=255)


      cggtggggtccgtggggtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                                >  1:1804370‑M1/51‑101 (MQ=255)


       ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                               <  1:3549974‑M1/52‑1 (MQ=255)


       cgtcggctccgtgggatcggtcggccccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                               >  2:3696192‑M1/50‑101 (MQ=255)


          cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                            <  2:2606988‑M1/55‑1 (MQ=255)


          cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                            >  2:2450178/1‑101 (MQ=255)


           gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGATCCGTggg                                                                                           <  2:3256810‑M1/56‑1 (MQ=255)


            ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                                          <  1:1005158‑M1/57‑1 (MQ=255)


            ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                          <  1:838518‑M1/57‑1 (MQ=255)


              tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgtggggtc                                                                                        <  2:4058641‑M1/59‑4 (MQ=255)


               ccgtgggctcgctcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                       >  2:633055‑M1/42‑101 (MQ=255)


               ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGATCCCTGGGAtcg                                                                                       <  1:1445810‑M1/60‑1 (MQ=255)


                 gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                     <  1:583440‑M1/62‑1 (MQ=255)


                  tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                    >  2:3140854‑M1/39‑101 (MQ=255)


                       tccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                               <  2:75224‑M1/68‑1 (MQ=255)


                        ctggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                              >  1:2960254‑M1/33‑101 (MQ=255)


                        cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                              <  1:643290‑M1/69‑1 (MQ=255)


                          gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatcctt                                                                            <  2:464862‑M1/71‑3 (MQ=255)


                              gatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                        <  2:1983390‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                 ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                     <  1:1597840‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                   gtggtgtcagTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                   <  2:2536326/92‑1 (MQ=11)


                                   gtgggatcggtcgggtccgttGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                   >  2:1843887‑M1/22‑101 (MQ=255)


                                   gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                   >  1:413635/1‑101 (MQ=255)


                                     tggatcgggcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                 >  2:2662828‑M1/20‑101 (MQ=255)


                                        gtcagTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                              <  1:2746347/97‑1 (MQ=14)


                                         tcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATc                                                             >  1:3959863‑M1/16‑101 (MQ=255)


                                          cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                            <  2:3617721‑M1/87‑1 (MQ=255)


                                            gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGt                                                          <  2:3526656‑M1/89‑1 (MQ=255)


                                            gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                                                          <  1:2666999‑M1/89‑2 (MQ=255)


                                             tcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                         <  1:2891093‑M1/90‑1 (MQ=255)


                                             tGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTg                                                         <  1:3752227/101‑1 (MQ=11)


                                               gggttcggcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                       <  1:1954835/93‑1 (MQ=11)


                                               gggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                       <  1:365302‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                               gggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                       <  2:2060389‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                                ggtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggg                                                      >  2:1763729/6‑100 (MQ=11)


                                                 gtcggtgggATCCGTCCGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                                                     <  2:2757341/100‑1 (MQ=11)


                                                 gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                     >  1:1140137/5‑101 (MQ=11)


                                                   ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                   >  1:40378/3‑101 (MQ=11)


                                                       gggttcggtcgaatccgtgggagcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                               <  1:2336914/97‑1 (MQ=11)


                                                       gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTgggcgctcgag                                               >  1:248344/2‑93 (MQ=11)


                                                       gagaggcgtcgggtcgggggggtcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                               <  1:3882292/94‑1 (MQ=11)


                                                       cggATCGGTCAGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg                                               >  1:2831246/1‑101 (MQ=11)


                                                         gatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCggg                                             >  2:4165040/1‑101 (MQ=11)


                                                         gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGCGGGaacagggggg                                             >  2:2960032/1‑92 (MQ=11)


                                                         gatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGATCGGGACCGAGGCGTGGATCGGAACCGTGGGAacggcgggg                                             >  2:1667699/1‑96 (MQ=11)


                                                          gccggtcgggtcggtgggatcgggcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                            <  2:1519648/99‑1 (MQ=11)


                                                          atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat                                            >  1:3409028/1‑99 (MQ=255)


                                                          atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGACGGGTCCGTGGGGTCGGCGGGGTCCCCGGAATCGGCAGGGt                                            >  2:1919114/1‑101 (MQ=2)


                                                            cggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                          <  1:2112022/101‑1 (MQ=11)


                                                            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                          <  1:4232605/101‑1 (MQ=14)


                                                            cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                          <  1:2183644/101‑1 (MQ=11)


                                                             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCg                                         >  2:1431821/1‑101 (MQ=11)


                                                             ggtcgggtccggagggtccgtcggttccgggggatcGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                         <  2:2153840/101‑1 (MQ=11)


                                                             ggtcgggtcagtgggatcgctcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                         <  1:2401164/101‑1 (MQ=14)


                                                             ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGCCGGTGGGGTCCGCGGCACCGCTCGGCTCCg                                         >  2:2241074/1‑101 (MQ=1)


                                                             gctcgggtccttcggatgggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                         <  2:2309744/99‑1 (MQ=11)


                                                             cgtgtggtccgttggattgggagagtacgggggatcggtcgGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                         <  2:2363105/96‑1 (MQ=11)


                                                              gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGATCCGt                                        >  1:2606507/1‑101 (MQ=11)


                                                               tcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                       >  1:348268/1‑100 (MQ=11)


                                                               tcggggccgtgggatcggtcggggccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                       <  1:203595/101‑2 (MQ=11)


                                                               gggggcgcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                       >  2:1599643‑M2/8‑100 (MQ=255)


                                                                cgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                      >  1:2552420/1‑99 (MQ=11)


                                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                      >  1:1334645/1‑99 (MQ=11)


                                                                cggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                      >  2:1334545‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                                cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcagatcggaag                                      >  1:1524402/1‑91 (MQ=11)


                                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                     <  1:512702‑M2/101‑4 (MQ=255)


                                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                     <  2:853433/101‑1 (MQ=11)


                                                                  ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggga                                    >  1:3366797‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                                  gggcggtggggtcggtgggggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                    <  1:1661893/96‑1 (MQ=11)


                                                                   gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggat                                   >  2:2891090‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                                    tccgtggggtccgtcggctccgtgggatcggccggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGAATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                  <  2:681565/101‑1 (MQ=11)


                                                                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                 >  1:926703‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                                     ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                 <  1:739757‑M2/101‑8 (MQ=255)


                                                                      cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCAGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcgg                                >  1:3617097/1‑101 (MQ=14)


                                                                       gtggtatcggtcgggtcagtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                               <  2:3035144/101‑1 (MQ=11)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                               >  2:3084440‑M2/1‑92 (MQ=255)


                                                                       gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGCGGGAtcggt                               >  1:2273787/1‑101 (MQ=11)


                                                                        tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                              <  2:2839475‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                                         gggatctgttgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             <  2:3366311/101‑1 (MQ=11)


                                                                         cggagctggcgggtccgtggggtccgtcggGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             <  2:114776/92‑1 (MQ=11)


                                                                             tcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtc                         >  1:3035439‑M2/1‑86 (MQ=255)


                                                                              cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                        <  1:997243‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                                              cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggataggtcgggtcc                        <  1:3270999‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                                               ggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcgg                       >  1:1294404/1‑99 (MQ=11)


                                                                                gtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                      >  2:1055683‑M2/1‑83 (MQ=255)


                                                                                 tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtc                     >  1:317293/1‑101 (MQ=255)


                                                                                  cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg                    <  1:1883820‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                                                  cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTCGGATCCgtggggtccgtcg                    <  1:3117300/101‑1 (MQ=11)


                                                                                       ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggaccggtcgggtccgtggggtcg               <  2:3777439‑M2/101‑26 (MQ=255)


                                                                                          taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtggggtccgtcggggccggg            >  2:3851074/3‑99 (MQ=11)


                                                                                          gcgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTg            <  1:3820588/93‑1 (MQ=11)


                                                                                           cgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTgg           <  1:1213927/94‑1 (MQ=11)


                                                                                            ggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg          <  2:3457229‑M2/101‑31 (MQ=255)


                                                                                              gtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAt        >  1:1071470/5‑101 (MQ=11)


                                                                                              atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgagggatcgggcgggg        <  2:926618‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                                                                              atcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggc        >  2:3976285/1‑99 (MQ=11)


                                                                                                ccgtcggATCTGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcc      <  2:1298320/99‑2 (MQ=11)


                                                                                                   tcggTTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc   <  2:1219327/101‑1 (MQ=14)


                                                                                                   tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtg   >  2:3921103/1‑100 (MQ=11)


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG