BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,012	A→G	4.9%	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,012	0	A→G	4.9%	119.3 ‑1.2 0.0	1501	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (35/45): ref base (707/711): total (745/756)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.03e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1786 total aligned reads displayed.


GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT  >  NC_014034/221912‑222112


ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                                                      <  1:1005158‑M1/57‑1 (MQ=255)


gatccgtgggatcggtcggatccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                                      >  2:3243311‑M1/45‑101 (MQ=255)


  tCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGTCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                                    <  2:1326219/101‑1 (MQ=255)


   ccgtgggctcgctcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                   >  2:633055‑M1/42‑101 (MQ=255)


   ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGATCCCTGGGAtcg                                                                                                   <  1:1445810‑M1/60‑1 (MQ=255)


     gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                 <  1:630118‑M1/62‑1 (MQ=255)


     cggtcatcggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                 >  2:373333‑M1/40‑101 (MQ=255)


      tgctatcggtcggatccgtgggatcggtcgggcccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                >  2:2713713‑M1/39‑101 (MQ=255)


       gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                               <  1:236280‑M1/64‑1 (MQ=255)


           tccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                           <  2:75224‑M1/68‑1 (MQ=255)


           gcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                           >  1:1207666‑M1/34‑101 (MQ=255)


            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                          >  1:2215757‑M1/33‑101 (MQ=255)


            ccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                          >  2:2567082‑M1/33‑101 (MQ=255)


               tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                       >  1:2800331‑M1/30‑101 (MQ=255)


               tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                       >  1:2506977‑M1/30‑101 (MQ=255)


                ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                      >  2:3863140/1‑101 (MQ=255)


                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                     >  1:3102927‑M1/28‑101 (MQ=255)


                  gatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                    >  2:3935633‑M1/27‑101 (MQ=255)


                    tcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtc                                                                                  >  1:1597771/4‑101 (MQ=1)


                     ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                 <  1:1663322‑M1/78‑1 (MQ=255)


                      ggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccg                                                                                >  2:2213199/2‑99 (MQ=11)


                      cgtggggtcggtcgggtccgtgGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                >  1:962312‑M1/23‑101 (MQ=255)


                      cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                <  1:902159‑M1/79‑1 (MQ=255)


                       gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                               <  2:2627027‑M1/80‑1 (MQ=255)


                       gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                               <  1:2567273‑M1/80‑1 (MQ=255)


                       gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                               <  1:564177‑M1/80‑1 (MQ=255)


                        tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                              >  1:1285665‑M1/21‑101 (MQ=255)


                           gatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGatcggtcggg                                                                           <  1:681642‑M1/84‑2 (MQ=255)


                           gatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcggg                                                                           <  2:2400988‑M1/84‑2 (MQ=255)


                              cggtcgggtcggtcggGTCAGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCTGTCGGTTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                        <  2:1188742/93‑1 (MQ=11)


                                gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGACGGGTCGGTGGGATGGGTCGGATCCGt                                                                      >  2:1242439/1‑101 (MQ=17)


                                  cggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                    <  2:1038503‑M1/91‑1 (MQ=255)


                                   gggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                   <  1:1527217‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                   ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGCCGGGGCCGCGGGATCGGTGGGAGCCGTggg                                                                   >  2:400282/10‑101 (MQ=11)


                                    gatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                  <  2:4080602‑M1/93‑1 (MQ=255)


                                    gCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                  >  1:395282/1‑101 (MQ=255)


                                         gtggtctcgggcggatccgtggtatgggtcgggcccgtgggaTCAGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                             <  2:2125512/95‑1 (MQ=11)


                                         gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                             >  1:2053915/1‑101 (MQ=255)


                                          ggggagcggtcgggtccgtcggatcggtcggggccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                            <  1:1761330/99‑1 (MQ=11)


                                           cggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcg                                                           >  2:2479920/1‑101 (MQ=11)


                                            ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGtcggtcgg                                                          >  1:1069037/1‑101 (MQ=11)


                                             gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcgGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCggg                                                         >  1:3473768/1‑101 (MQ=11)


                                              atcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGCGGTGTGTCgggg                                                        >  2:1806838/1‑100 (MQ=11)


                                              atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTTgggg                                                        >  2:2928477/1‑100 (MQ=11)


                                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGATCCGTGGGAtcggtcggagccg                                                     >  2:1562481/1‑96 (MQ=14)


                                                 ggtcgcgtccgtgcgatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                     <  2:931597/101‑1 (MQ=11)


                                                  gtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                    <  2:3631362/101‑1 (MQ=14)


                                                  gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCCCGTAGGATCCGTGGGCTCGGTCGGATCCgg                                                    >  2:2815186/1‑100 (MQ=14)


                                                  gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCCGTCGGATCCGt                                                    >  2:2346185/1‑101 (MQ=11)


                                                  gtcgggtccgtcgggtcggtggagtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                    <  2:1391844/101‑1 (MQ=11)


                                                  gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCTGt                                                    >  2:164188/1‑101 (MQ=11)


                                                  ggcggttccgtcggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                    <  2:67801/99‑1 (MQ=14)


                                                   tcgggtccgtgggatctgtcgggtccgtcggatcgtTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                   <  2:3132493/101‑2 (MQ=11)


                                                    cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                  >  1:1334645/1‑99 (MQ=11)


                                                     gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                 <  2:853433/101‑1 (MQ=11)


                                                     ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                 <  1:3808615‑M2/101‑4 (MQ=255)


                                                      ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCgcggga                                                >  2:341558/1‑96 (MQ=11)


                                                       gtccgtggggtcggtcgggtccgtgggggcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                               <  1:3724070/101‑1 (MQ=11)


                                                       gtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggaa                                               <  1:3404635‑M2/101‑6 (MQ=255)


                                                         ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGtcg                                             >  2:2047117/1‑101 (MQ=14)


                                                         ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                             >  1:2718227‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                           gtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                           <  2:3317316/101‑1 (MQ=14)


                                                           gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggg                                           <  1:809076‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                            tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTAGGATCGgtcgggtccgtc                                 >  2:3796209/1‑101 (MQ=11)


                                                              ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtccgtcgg                                        >  1:4194611/1‑101 (MQ=11)


                                                               gagcggtcgggtccgtggggtccgtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggg                                       <  2:3003489/98‑1 (MQ=11)


                                                                   ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                                   <  1:3251374‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                    gtcgggtccggcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                                  <  1:2302692/101‑1 (MQ=11)


                                                                     tcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggggccgtg                                 <  1:3158934‑M2/101‑20 (MQ=255)


                                                                     tcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtg                                 >  2:2875276‑M2/1‑82 (MQ=255)


                                                                       ggtgtcatgggataagccggATCCGTGGGTCCGCCCTGGTCCGTGGTTTGGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGAGGGGTCCgtccgatccgtggg                               <  2:1886258/94‑1 (MQ=2)


                                                                       ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                               <  2:1726255/98‑1 (MQ=255)


                                                                       ggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                               >  1:1136406/4‑101 (MQ=11)


                                                                         gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATGGgtcggggcggaggggc                             >  2:1503531/1‑91 (MQ=11)


                                                                          tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcggatc                            <  1:2934253/101‑1 (MQ=11)


                                                                             gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggt                         >  1:3647280‑M2/1‑74 (MQ=255)


                                                                              tggggtcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc                        <  1:4023238/101‑2 (MQ=11)


                                                                              tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc                        >  2:1957752/1‑100 (MQ=11)


                                                                              tgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGtcgggtccgtcggatccggg                        >  1:3010524/1‑99 (MQ=11)


                                                                                gttgccatcggTTTCGTGGGATCGGCTTGAACGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.TGGGGTCCGTCGGa                     <  1:2617244/94‑1 (MQ=2)


                                                                                  ggcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                    <  1:3540579/99‑1 (MQ=14)


                                                                                    cggtcggGCCGGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcg                  <  1:2002913/101‑1 (MQ=11)


                                                                                     ggtgggATCCGTGGGATCGGCCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccg                 <  2:4208227/101‑3 (MQ=11)


                                                                                     ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                 <  2:3577439‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                                                                       tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc               <  2:3067073/101‑1 (MQ=11)


                                                                                        cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGAtcggtcg              >  1:2871925/1‑101 (MQ=11)


                                                                                        cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgg              >  1:1913944‑M2/1‑63 (MQ=255)


                                                                                        cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgg              <  1:465808‑M2/101‑39 (MQ=255)


                                                                                         ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg             >  1:3346899/1‑101 (MQ=11)


                                                                                          gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGAtccgtgggc            >  2:3481738/1‑100 (MQ=14)


                                                                                           gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggat           >  1:1837309‑M2/2‑60 (MQ=255)


                                                                                            tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc          <  1:2129555‑M2/101‑43 (MQ=255)


                                                                                             cggtgGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg         >  1:3858107‑M2/3‑58 (MQ=255)


                                                                                             cggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc         >  1:4095445/6‑101 (MQ=17)


                                                                                             cggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATcc         >  2:495153/6‑101 (MQ=17)


                                                                                             ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatgggtagggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg         <  1:3612704‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                                                             ccGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg         <  2:2276439‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                                                                   gATCGGTCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgga   >  2:1107477‑M2/1‑52 (MQ=255)


                                                                                                   gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgga   >  2:577393‑M2/1‑52 (MQ=255)


                                                                                                   gATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa   >  1:2435017/1‑101 (MQ=255)


GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT  >  NC_014034/221912‑222112

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG