BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,015	G→C	7.2%	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,015	0	G→C	7.2%	199.2 ‑0.5 ‑0.1	1463	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (55/53): ref base (649/700): total (708/755)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.17e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.82e-01

Only 100 of 1817 total aligned reads displayed.


CGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221915‑222115


ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGATCCCTGGGAtcg                                                                                                      <  1:1445810‑M1/60‑1 (MQ=255)


ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                      >  2:348217‑M1/42‑101 (MQ=255)


  cggtcatcggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                    >  2:373333‑M1/40‑101 (MQ=255)


    cggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                  >  1:790612‑M1/38‑101 (MQ=255)


     ggatcggtcggctccgttgtatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                 >  2:7531‑M1/37‑101 (MQ=255)


       atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGgatcggtcggat                                                                                               >  2:1489854‑M1/35‑99 (MQ=255)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                            <  1:2861009‑M1/70‑1 (MQ=255)


          ggtcggatccgggggatcggtcgggtccgtgGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                            >  1:3643499‑M1/32‑101 (MQ=255)


           gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                                                                                           <  1:1524937‑M1/71‑2 (MQ=255)


             ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                         >  2:3863140/1‑101 (MQ=255)


                 tcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtc                                                                                     >  1:1597771/4‑101 (MQ=1)


                 tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                     <  2:4083452‑M1/77‑1 (MQ=255)


                 ggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                     <  1:2052160/101‑1 (MQ=255)


                 ggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                     >  1:4196785/1‑101 (MQ=255)


                     tgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                 >  2:4006304‑M1/21‑101 (MQ=255)


                           tcGTGGGCGCGGTCGGATGTGGGGGGTGCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                           <  1:1813002/100‑1 (MQ=14)


                           cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                           >  1:2421040‑M1/15‑101 (MQ=255)


                            ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                          <  1:897152‑M1/88‑1 (MQ=255)


                             gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                         >  1:3322286/1‑101 (MQ=255)


                             gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                         <  1:3466737/101‑1 (MQ=255)


                                  gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                    >  2:583376‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                  gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                    >  1:1140137/5‑101 (MQ=11)


                                  atccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                    <  2:2409636‑M1/94‑1 (MQ=255)


                                    tcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                  <  2:1031411/96‑1 (MQ=11)


                                     cgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGGtccg                                                                 >  1:2200465/5‑99 (MQ=11)


                                      gtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcggg                                                                >  2:2215598/10‑100 (MQ=11)


                                       tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTGGGATCGGTGGGGtcgggg                                                               >  2:681766/3‑99 (MQ=14)


                                       tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                               >  1:1888505‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                       gggggtcgggcgggtgcgggggatcggtcgggtccgtgggaGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                               <  1:309620/96‑1 (MQ=14)


                                          ggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgga                                                            <  1:2125431/99‑2 (MQ=14)


                                          gatctgtcgggtccgtgggatcggacgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgga                                                            >  2:124149/1‑100 (MQ=11)


                                           gtcggttgggtccgtgggatcgggcgggtccgtcggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                           <  1:3142584/100‑1 (MQ=11)


                                           atcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGCGGTGTGTCgggg                                                           >  2:1806838/1‑100 (MQ=11)


                                             tcgttgggtccggcggatccgtcgggtccgtcgggtccgtcGGATCCGTCGGATCTGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         <  2:1388215/96‑1 (MQ=11)


                                              ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGCCCGTGGGATCGGGCGGGGCCg                                                        >  1:1212568/1‑101 (MQ=11)


                                              ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGACGGTCGGGTTCg                                                        >  2:421174/1‑101 (MQ=11)


                                              ggtcggggccgtgggctcggtcgggtccgtgggctcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                        <  2:2586203/101‑1 (MQ=14)


                                              ggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCCGATCCGTGGGATGGGTCTGATCCGCGGCATCGGTCTGGTcgg                                                        >  2:497929/1‑99 (MQ=14)


                                              ggtcgcgtccgtgcgatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                        <  2:931597/101‑1 (MQ=11)


                                               gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGAGGGATCGGTCGGGGCGGTGGGGTCGGTCGGACGGGTGGGAtcggatggttccag                                                       >  2:2349901/1‑91 (MQ=14)


                                               gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                       >  1:1751030/1‑101 (MQ=14)


                                               gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCTGt                                                       >  2:164188/1‑101 (MQ=11)


                                                 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATAGGTCGGATCCGtgg                                                     >  2:3939404/1‑99 (MQ=14)


                                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                    <  2:853433/101‑1 (MQ=11)


                                                   ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                   <  1:559383‑M2/101‑5 (MQ=255)


                                                   ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                   >  2:1179354‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                   ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgGGTCCGTGGGATCGGTCGCGTCCGAGGGGTCGGTCGGGTACGCGGGTTCGGTCGCGTCCGtggac                                                   >  1:1974556/1‑97 (MQ=11)


                                                   ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCgcggga                                                   >  2:341558/1‑96 (MQ=11)


                                                   gggcggtggggtcggtgggggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                   <  1:1661893/96‑1 (MQ=11)


                                                    gtccgtggggtcggtcgggtccgtgggggcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                  <  1:3724070/101‑1 (MQ=11)


                                                    ggccgtgggatcgggcgggtcggtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                  <  1:3952586/99‑1 (MQ=14)


                                                     tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggagg                                                 <  1:1005202‑M2/101‑7 (MQ=255)


                                                       cgggggatcggtcggatccgggggatgggtcggGGCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                               <  1:227777/98‑1 (MQ=11)


                                                        gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                              >  2:3084440‑M2/1‑92 (MQ=255)


                                                        gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                              >  1:3793247/1‑101 (MQ=11)


                                                         tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTAGGATCGgtcgggtccgtc                                    >  2:3796209/1‑101 (MQ=11)


                                                          gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                            <  1:3003714‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                            gatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                          <  1:2495245‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                             gtcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggat                                         <  1:3526909/100‑3 (MQ=11)


                                                              tcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                        >  1:67467/1‑101 (MQ=11)


                                                               cggtcggttccgggggaccggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                       >  1:626480‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                               cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTgggatcggtcgggtcc                                       <  2:2506793‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                                ggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcgg                                      >  1:1294404/1‑99 (MQ=11)


                                                                 gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                                     <  1:2713919‑M2/101‑19 (MQ=255)


                                                                 gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTGCGTGGGATCGgtcgggtccgg                                     >  2:1560901/1‑100 (MQ=11)


                                                                 gtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgt                                     <  1:3391082/101‑1 (MQ=11)


                                                                  tcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccggg                                    >  1:2609968/1‑99 (MQ=11)


                                                                  tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtc                                    >  2:3021084/1‑101 (MQ=255)


                                                                   cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg                                   <  2:1105012/101‑1 (MQ=11)


                                                                    gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccggggg                                  <  1:3249115‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                    gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                                  >  1:3590863/1‑101 (MQ=11)


                                                                    ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                                  <  2:1726255/98‑1 (MQ=255)


                                                                     ggtcggtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggga                                 >  1:4015616‑M2/1‑79 (MQ=255)


                                                                     ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGgtcggatccctgggc                                 >  2:2655895/1‑95 (MQ=11)


                                                                     gatccgtgggatcgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtcggatccgtggga                                 <  1:292788/99‑2 (MQ=11)


                                                                         cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg                             >  2:2831268/1‑101 (MQ=14)


                                                                           tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc                           >  2:1957752/1‑100 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggagcggtcg                          <  2:635753‑M2/101‑30 (MQ=255)


                                                                            gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcg                          >  2:2890520‑M2/1‑72 (MQ=255)


                                                                             ggttccgttggATCCGTGGTGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTggg                         <  2:363214/92‑1 (MQ=11)


                                                                               gtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAt                       >  1:1071470/5‑101 (MQ=11)


                                                                               atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcgggcgggt                       >  2:358009/1‑93 (MQ=11)


                                                                                tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc                      <  2:2939927/101‑1 (MQ=14)


                                                                                 cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                     <  2:204522/101‑1 (MQ=14)


                                                                                     cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCAGCGGGGTCCGTCGGGTCCGTggggctgctgg                 >  2:3142353/1‑93 (MQ=14)


                                                                                     cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgg                 <  1:465808‑M2/101‑39 (MQ=255)


                                                                                     cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgg                 <  1:1334465/101‑3 (MQ=11)


                                                                                         tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgggggatc             <  1:2359469‑M2/101‑43 (MQ=255)


                                                                                          cggtgGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg            >  1:3858107‑M2/3‑58 (MQ=255)


                                                                                          cggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc            >  1:4095445/6‑101 (MQ=17)


                                                                                          ccGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg            <  2:2276439‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                                                           cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg           <  1:2560651‑M2/101‑45 (MQ=255)


                                                                                            gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg          >  2:3320351/1‑100 (MQ=14)


                                                                                             tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtc         >  1:955828‑M2/1‑55 (MQ=255)


                                                                                             tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc         <  2:1317375‑M2/101‑47 (MQ=255)


                                                                                               ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggggccgtggggtcggtcggggccgtgggatcggtcgg       <  2:2130438‑M2/101‑49 (MQ=255)


                                                                                                 aTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGGCCGTCGGGTCCGGGGGGTAGGTCGGGTCCGTcgggt     >  2:1884825/1‑99 (MQ=14)


                                                                                                  tcggtcggCGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc    <  2:3251133/101‑1 (MQ=17)


                                                                                                   cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggatcg   <  2:2743653‑M2/101‑53 (MQ=255)


                                                                                                    ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccg  <  1:277813‑M2/101‑54 (MQ=255)


CGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221915‑222115

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG