BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,021	G→A	23.5%	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,021	0	G→A	23.5%	0.0 ‑0.5 0.0	1534	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (163/198): ref base (550/623): total (713/821)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.87e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1852 total aligned reads displayed.


CATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221921‑222121


  gcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                                    >  1:1207666‑M1/34‑101 (MQ=255)


   cggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                   >  1:3723421‑M1/33‑101 (MQ=255)


   ccgtcggatccgtgggatcggtgggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                   >  1:2912483‑M1/33‑101 (MQ=255)


   ccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                   >  2:2567082‑M1/33‑101 (MQ=255)


    ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                                  <  1:2861009‑M1/70‑1 (MQ=255)


     aCGGTGGGAGTCGGCTGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGCCGGGTGCGTGGGACCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCTTGGGACAGTCCGGGTCCgg                                                                                                 >  2:3133310/1‑100 (MQ=18)


       ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                               >  2:3863140/1‑101 (MQ=255)


        ggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                              >  2:130842‑M1/28‑101 (MQ=255)


         gatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                             >  2:3935633‑M1/27‑101 (MQ=255)


           tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                           <  2:4083452‑M1/77‑1 (MQ=255)


            ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                          <  2:2718021‑M1/78‑1 (MQ=255)


             ggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccg                                                                                         >  2:2213199/2‑99 (MQ=11)


             cGTCGGATCTGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                         <  1:1884945/101‑1 (MQ=11)


              gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                        <  1:2700510‑M1/80‑1 (MQ=255)


              gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                        >  1:2778116‑M1/22‑101 (MQ=255)


              gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                        <  1:2042472/101‑1 (MQ=255)


                cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                      <  1:3001400/101‑1 (MQ=255)


                    tcggtcgtgtcggtgggAGCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtt                                                                                  <  2:1632173/92‑2 (MQ=11)


                      cGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                >  1:195652/1‑101 (MQ=255)


                       gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                               <  1:3466737/101‑1 (MQ=255)


                            gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                          >  2:583376‑M1/8‑101 (MQ=255)


                            gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                          <  1:661311/97‑1 (MQ=11)


                            gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                          >  1:1140137/5‑101 (MQ=11)


                              gcgtggggtcggtctgggccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                        <  1:527766/93‑1 (MQ=11)


                               ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCtcgg                                                                       >  1:3388796/1‑101 (MQ=255)


                               cgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                       >  2:2273619‑M1/5‑101 (MQ=255)


                                gtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                      >  1:944536‑M1/4‑101 (MQ=255)


                                 tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTGGGATCGGTGGGGtcgggg                                                                     >  2:681766/3‑99 (MQ=14)


                                  cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTCGGAtcggtgg                                                                    >  2:2917863/1‑99 (MQ=11)


                                   ggttcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                   <  2:1713610/98‑1 (MQ=11)


                                   ggatcggtcggggccgggggatcgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                   <  1:4076740/101‑1 (MQ=14)


                                    gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGAGCCGTGGGGTCGGGCCGGTCCGTGGGAACGGGCggg                                                                  >  2:1551034/1‑101 (MQ=11)


                                        ggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                              <  2:2121024/101‑1 (MQ=11)


                                        ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccggcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCg                                                              <  1:3857812/101‑1 (MQ=11)


                                        ggtcgggtccgtaggatgcgtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                              <  2:3237510/101‑1 (MQ=11)


                                        ggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCCGATCCGTGGGATGGGTCTGATCCGCGGCATCGGTCTGGTcgg                                                              >  2:497929/1‑99 (MQ=14)


                                         gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTCGGATTGGTAGGGTCCGt                                                             >  2:1954709/1‑101 (MQ=11)


                                           cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcagatcggaag                                                           >  1:1524402/1‑91 (MQ=11)


                                            gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGgg                                                          >  1:3141085/1‑101 (MQ=14)


                                            ggggccgtggggtcggtcggatccgtgggatcggtcGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                          <  2:187965/101‑1 (MQ=11)


                                            ggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                          <  1:873027/101‑1 (MQ=11)


                                             ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGggg                                                         >  1:7539/1‑100 (MQ=14)


                                             gggcggtggggtcggtgggggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                         <  1:1661893/96‑1 (MQ=11)


                                                ccgtgggatcggtcggatccgtggtatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                      >  1:2357555/1‑101 (MQ=11)


                                                 cgggggatcggtcggatccgggggatgggtcggGGCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                     <  1:227777/98‑1 (MQ=11)


                                                   tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTAGGATCGgtcgggtccgtc                                          >  2:3796209/1‑101 (MQ=11)


                                                    gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCTGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                  >  1:3588478/1‑101 (MQ=14)


                                                    gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                  <  1:3237751‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                     ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                                 <  1:3067298‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                      gatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg                                                <  1:2495245‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                      gagcggtcgggtccgtggggtccgtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggg                                                <  2:3003489/98‑1 (MQ=11)


                                                        tcggtcgggtccgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtc                                              >  2:358017‑M2/1‑86 (MQ=255)


                                                         cggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtcc                                             >  2:2349333/1‑101 (MQ=11)


                                                         cggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggggcc                                             >  1:441370/1‑101 (MQ=11)


                                                         cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                             >  2:2404549‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                          ggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg                                            <  1:599661/101‑1 (MQ=11)


                                                          ggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcgg                                            >  1:1294404/1‑99 (MQ=11)


                                                           ggggggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                                           <  1:1069575/98‑1 (MQ=11)


                                                             cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGGGGGGACGgtcggttccgtgg                                         >  2:1072127/1‑99 (MQ=11)


                                                             cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg                                         >  2:4005287/1‑101 (MQ=11)


                                                               ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggg                                       <  1:3643383‑M2/101‑23 (MQ=255)


                                                                  ccgtgggctcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGTATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc                                    <  1:1806957/101‑1 (MQ=11)


                                                                  ccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                    <  2:1797649‑M2/101‑26 (MQ=255)


                                                                   cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccg                                   >  1:2611830‑M2/1‑75 (MQ=255)


                                                                     tgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggagcggtg                                 <  2:933748‑M2/101‑29 (MQ=255)


                                                                     tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGGCGGTGGGGGCGGTGGGGTCGGTg                                 >  2:774778/1‑101 (MQ=11)


                                                                      gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggagcggtcg                                <  2:635753‑M2/101‑30 (MQ=255)


                                                                      gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCTTGGGCTCGgtcggagccgtgggatgggccg                                >  2:3483165/1‑93 (MQ=11)


                                                                       gggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                               >  1:2188645/10‑101 (MQ=11)


                                                                       gggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                               <  2:3310726/92‑1 (MQ=14)


                                                                       gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTggg                               <  2:20397/95‑1 (MQ=11)


                                                                           cggtcggATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                           >  2:116411‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                                                            ggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                          <  1:3317557‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                                                            ggtgggATCCGTGGGATCGGCCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccg                          <  2:4208227/101‑3 (MQ=11)


                                                                            ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcgg                          >  1:3526513/1‑101 (MQ=11)


                                                                            ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGtcgg                          >  1:2122180/1‑101 (MQ=14)


                                                                             gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGGtcggt                         >  1:3987917/1‑101 (MQ=11)


                                                                              tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc                        <  2:3067073/101‑1 (MQ=11)


                                                                               cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                       >  2:1464831‑M2/1‑63 (MQ=255)


                                                                               cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgg                       <  1:1334465/101‑3 (MQ=11)


                                                                                  gtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGCGGGAtcggtctggt                    >  1:3786307/2‑97 (MQ=11)


                                                                                   tCCGTGGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATc                   <  2:1233640/101‑1 (MQ=11)


                                                                                    ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                  <  2:3407852‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                                                    ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                  >  2:1353812‑M2/1‑58 (MQ=255)


                                                                                     cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                 <  1:2560651‑M2/101‑45 (MQ=255)


                                                                                       ggggcTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc               >  2:853812‑M2/2‑55 (MQ=255)


                                                                                         ggcacggtcggATCTGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg             <  2:3725410/97‑1 (MQ=14)


                                                                                            tcggtcgtGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc          <  2:3643130/101‑1 (MQ=17)


                                                                                            tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatc          <  1:1739115‑M2/101‑52 (MQ=255)


                                                                                             ccgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg         >  2:2492135/6‑101 (MQ=255)


                                                                                               gtgggGTCCGTGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgt       >  1:2418213‑M2/1‑47 (MQ=255)


                                                                                                tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg      <  1:1588498‑M2/101‑56 (MQ=255)


                                                                                                 ggggTCCGTGGGATGGGTCGTGCCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg     <  2:2871706/100‑1 (MQ=18)


                                                                                                 ggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg     >  1:4161582/2‑101 (MQ=255)


                                                                                                 cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcggtgg     <  1:3929568‑M2/101‑57 (MQ=255)


                                                                                                  ggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccggggg    <  2:1009697‑M2/101‑58 (MQ=255)


                                                                                                   ggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggga   >  1:1433316‑M2/1‑43 (MQ=255)


                                                                                                   ggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggga   <  1:1005158‑M2/101‑59 (MQ=255)


                                                                                                   ggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggg   >  2:2813841‑M2/1‑43 (MQ=255)


                                                                                                   ggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg   >  2:2630095/1‑101 (MQ=255)


CATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221921‑222121

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG