BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,096	G→C	1.7%	T187T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,096	0	G→C	1.7%	4.2 ‑2.1 ‑0.5	344	T187T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (1/5): ref base (172/166): total (173/171)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.20e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.05e-01

Only 100 of 464 total aligned reads displayed.


CGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGCAG  >  NC_014034/221996‑222196


cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAACCGCGGGGCTCGTGGGAtcg                                                                                                      >  1:3566395/1‑101 (MQ=11)


cggtcggGCCGGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                      <  1:2002913/101‑1 (MQ=11)


 ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGGtcgg                                                                                                     >  2:3967651/1‑101 (MQ=14)


  gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGCtcggc                                                                                                    >  2:1540964/4‑100 (MQ=14)


  gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                    <  2:535934/98‑1 (MQ=14)


  gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgt                                                                                                    >  1:3832867/1‑101 (MQ=11)


  ggcggATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgt                                                                                                    <  2:1755809/99‑1 (MQ=11)


   tcggTTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  2:1219327/101‑1 (MQ=14)


   tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  2:3067073/101‑1 (MQ=11)


    cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                  <  2:90869/101‑1 (MQ=11)


    cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgg                                                                                                  <  1:2385522/101‑3 (MQ=11)


     gggtcggTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                 <  1:3734451/95‑1 (MQ=11)


     gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                 >  2:725607/4‑101 (MQ=11)


     ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                                                                                                 >  1:3346899/1‑101 (MQ=11)


      gATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgag                                                                                                >  1:3969635/1‑99 (MQ=17)


      gATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGAtccgtgggg                                                                                                >  2:3008882/1‑100 (MQ=11)


      gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                                >  2:2758112/1‑101 (MQ=11)


       ttccgatctaTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                                               <  1:651165/92‑1 (MQ=18)


       gtCCGTAGGACCGGCGGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt                                                                                               <  2:1597731/100‑3 (MQ=14)


        gccGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGATCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                              <  1:4005547/100‑1 (MQ=11)


         cggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                             >  1:4095445/6‑101 (MQ=17)


         ccGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTcc                                                                                             >  2:214097/1‑101 (MQ=14)


         ccGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGGCCGGGGGGtcgggcggggcc                                                                                             >  2:3857553/1‑97 (MQ=14)


           gtcgggtcggtgggCTCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                           <  2:2892340/95‑1 (MQ=17)


           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCgg                                                                                           >  1:3678141/1‑100 (MQ=14)


           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg                                                                                           >  2:3320351/1‑100 (MQ=14)


             cggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                         >  2:1189001/2‑101 (MQ=255)


              ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                        >  1:894606/1‑101 (MQ=255)


               ggtccgttgggTCCGTCGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                       <  2:1804883/93‑1 (MQ=18)


               gATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                       >  1:2435017/1‑101 (MQ=255)


                gtcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                                      <  2:3181849/100‑1 (MQ=14)


                  cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                    >  1:2960612/1‑101 (MQ=17)


                   ggtcggTGCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg                                                                                   <  2:3227422/101‑1 (MQ=14)


                   cgtggggTCCGTGTGATCAGTCGGCGCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                   <  2:4131394/97‑1 (MQ=21)


                    gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCGGGAtcggt                                                                                  >  1:414267/4‑101 (MQ=255)


                    gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                  <  1:2915890/101‑1 (MQ=17)


                    gtcggGGCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                  <  1:1376482/101‑1 (MQ=17)


                     tggggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                 <  1:999493/99‑1 (MQ=17)


                       gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                               >  2:3753978/1‑101 (MQ=255)


                        ggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                                              >  2:2630095/1‑101 (MQ=255)


                         gTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTCGGGt                                                                             >  1:309239/1‑101 (MQ=17)


                         atCCGGGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGt                                                                             <  1:3278913/100‑1 (MQ=11)


                          tCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTc                                                                            >  2:2246394/1‑101 (MQ=17)


                           gcGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                           <  2:1521221/100‑1 (MQ=255)


                           ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                           <  2:3408783/101‑1 (MQ=255)


                           ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTcc                                                                           >  1:288042/1‑101 (MQ=11)


                           ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGTTCGGCCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGCTCGGGTCCGTGGCATCGGCCGCGTcc                                                                           >  1:567934/1‑101 (MQ=17)


                           ccGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc                                                                           <  1:1900855/101‑1 (MQ=17)


                             gtcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                         >  1:2790864/4‑101 (MQ=17)


                             gTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                         <  1:3320592/101‑1 (MQ=1)


                              tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                        >  2:1288863/1‑101 (MQ=17)


                               gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                       >  2:650021/1‑101 (MQ=255)


                               gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                       <  1:3494137/101‑1 (MQ=255)


                               gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtag                                                                       <  1:1064186/101‑3 (MQ=17)


                               cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTgg                                                                       >  1:805346/2‑101 (MQ=17)


                                ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                      >  1:2516790/1‑101 (MQ=255)


                                ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTagg                                                                      >  2:1878728/1‑101 (MQ=17)


                                 taccggtcggTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggg                                                                     <  2:3718408/98‑1 (MQ=255)


                                 gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTAGGGTCCGTGGGTTCGGGCGGGTCCGtagcg                                                                     >  2:3643791/1‑97 (MQ=11)


                                  gtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggat                                                                    <  1:3053655/100‑3 (MQ=14)


                                    cggtcggGTCGGTGGGATCTGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                                                  <  2:3617292/101‑5 (MQ=11)


                                      gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggt                                                                <  1:2229170/101‑1 (MQ=255)


                                      gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggg                                                                >  2:3442385/1‑100 (MQ=255)


                                      gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggt                                                                >  2:1110818/1‑95 (MQ=14)


                                        cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcg                                                              >  1:1680346/1‑94 (MQ=14)


                                         ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                                             >  1:497808/1‑92 (MQ=11)


                                          ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa                                                            >  2:2934183/3‑101 (MQ=255)


                                          ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGCTGGTGGGa                                                            >  2:1912461/3‑101 (MQ=255)


                                          ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTgggg                                                            >  1:1870810/3‑100 (MQ=255)


                                            tacgggggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtc                                                          <  1:614965/96‑1 (MQ=18)


                                            tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGGtc                                                          >  2:2865424/1‑101 (MQ=255)


                                            tCCGGGGGATCGGGGGGGTCGGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtc                                                          <  1:1431526/101‑1 (MQ=18)


                                             gcGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcg                                                         <  2:3517227/100‑1 (MQ=255)


                                                      cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCCGACCg                                                >  1:389323/1‑101 (MQ=255)


                                                       ggtcggGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGc                                               <  1:1541068/101‑1 (MQ=255)


                                                        gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCt                                              >  2:805028/1‑101 (MQ=255)


                                                          cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGt                                            >  2:2338702/1‑101 (MQ=255)


                                                               ccGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccg                                       >  1:748146/1‑101 (MQ=255)


                                                                cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgc                                      >  2:1415958/1‑101 (MQ=255)


                                                                 gtgggATCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgcc                                     <  2:3818461/98‑1 (MQ=18)


                                                                   aGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgccgc                                   >  1:148222/1‑101 (MQ=255)


                                                                   aGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgccgc                                   >  2:1058170/1‑101 (MQ=255)


                                                                      aTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCgg                                >  1:1621329/1‑101 (MQ=255)


                                                                         ggtcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACa                             >  2:439319/1‑101 (MQ=255)


                                                                           tcgggtccgtcgggtccgTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGa                           <  1:430658/101‑1 (MQ=255)


                                                                           gcgggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGa                           <  2:3677887/100‑1 (MQ=255)


                                                                            cgggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAc                          >  2:597885/1‑101 (MQ=255)


                                                                              ggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAccc                        <  1:2119936/101‑1 (MQ=255)


                                                                              ggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAccc                        <  2:502550/101‑1 (MQ=255)


                                                                              ggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAccc                        >  1:3450170/1‑101 (MQ=255)


                                                                               gtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAcccc                       >  2:1681665/1‑100 (MQ=255)


                                                                                tccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAg                      >  2:2535852/1‑101 (MQ=255)


                                                                                       ggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggcc               >  1:1006313/1‑101 (MQ=255)


                                                                                        gtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCa              >  2:2438261/1‑101 (MQ=255)


                                                                                           cgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAc           >  1:1163558/1‑101 (MQ=255)


                                                                                            gtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAcc          >  2:1975150/1‑101 (MQ=255)


                                                                                              gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCgg        >  2:2385197/1‑101 (MQ=255)


                                                                                              gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCgg        >  2:2060099/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGcc      >  1:122913/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                   cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGca   >  1:1768535/1‑101 (MQ=255)


CGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGCAG  >  NC_014034/221996‑222196

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG